Protein–RNA interactions for Protein: P28704

Rxrb, Retinoic acid receptor RXR-beta, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrbP28704 Gm22923-201ENSMUST00000174952 110 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
RxrbP28704 Gm20617-201ENSMUST00000177082 717 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
RxrbP28704 Gm5445-201ENSMUST00000180224 480 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
RxrbP28704 Gm26944-201ENSMUST00000182265 633 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
RxrbP28704 Gm4891-201ENSMUST00000182279 912 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
RxrbP28704 Gm27033-201ENSMUST00000183226 544 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
RxrbP28704 Mir6340-201ENSMUST00000183857 119 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
RxrbP28704 Gm18303-201ENSMUST00000190055 1176 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
RxrbP28704 Gm20915-201ENSMUST00000191575 663 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
RxrbP28704 Gm37068-201ENSMUST00000195168 640 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
RxrbP28704 Cacnb2-216ENSMUST00000195841 503 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
RxrbP28704 Gm18611-201ENSMUST00000200334 1118 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
RxrbP28704 Mrps33-204ENSMUST00000201461 717 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
RxrbP28704 Gm44285-201ENSMUST00000203557 940 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
RxrbP28704 Olfr214-202ENSMUST00000203867 1255 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
RxrbP28704 Gm34368-201ENSMUST00000209512 1111 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
RxrbP28704 Gm45382-201ENSMUST00000210607 151 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
RxrbP28704 Olfr724-202ENSMUST00000213390 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
RxrbP28704 Gm32688-201ENSMUST00000213849 585 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
RxrbP28704 Gm18996-201ENSMUST00000214851 755 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
RxrbP28704 Gm32281-202ENSMUST00000217220 691 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
RxrbP28704 AC108437.1-201ENSMUST00000222170 776 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
RxrbP28704 Gm4804-203ENSMUST00000222542 577 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
RxrbP28704 Gm31063-201ENSMUST00000222636 580 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
RxrbP28704 CT010480.1-201ENSMUST00000223612 363 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
RxrbP28704 AC154849.2-201ENSMUST00000223781 974 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
RxrbP28704 AC156574.2-201ENSMUST00000228023 282 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
RxrbP28704 AC134414.1-201ENSMUST00000228499 1221 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
RxrbP28704 Klrd1-201ENSMUST00000032268 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
RxrbP28704 4930433N12Rik-201ENSMUST00000048921 1204 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
RxrbP28704 Olfr1276-201ENSMUST00000073322 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
RxrbP28704 Olfr888-201ENSMUST00000075228 945 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
RxrbP28704 Olfr338-202ENSMUST00000091006 921 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
RxrbP28704 A830010M20Rik-203ENSMUST00000100951 4545 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
RxrbP28704 Adgrg6-201ENSMUST00000041168 6507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
RxrbP28704 Gm44769-201ENSMUST00000206120 2809 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
RxrbP28704 AC122263.1-201ENSMUST00000228636 2805 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
RxrbP28704 Olfr976-204ENSMUST00000217630 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
RxrbP28704 5031410I06Rik-201ENSMUST00000063524 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
RxrbP28704 Gm7347-201ENSMUST00000095004 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
RxrbP28704 Gm21051-201ENSMUST00000221757 1688 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
RxrbP28704 Bcas3os1-202ENSMUST00000151652 3138 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
RxrbP28704 Cd44-206ENSMUST00000111192 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
RxrbP28704 Gm4927-201ENSMUST00000219548 1318 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
RxrbP28704 Lsmem1-202ENSMUST00000220951 2152 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
RxrbP28704 Vmn1r58-204ENSMUST00000228728 9991 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
RxrbP28704 Sdcbp-202ENSMUST00000103008 2086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
RxrbP28704 Gm12299-201ENSMUST00000138819 2327 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
RxrbP28704 Gm45516-201ENSMUST00000211588 4182 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
RxrbP28704 Zfp874a-201ENSMUST00000057241 2210 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
RxrbP28704 Gm8113-201ENSMUST00000160298 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
RxrbP28704 Olfr348-202ENSMUST00000213498 3540 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
RxrbP28704 Olfr458-202ENSMUST00000216650 1799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
RxrbP28704 Kif24-201ENSMUST00000030148 4333 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
RxrbP28704 Igkv12-38-201ENSMUST00000103371 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
RxrbP28704 Ghrh-202ENSMUST00000109536 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
RxrbP28704 Borcs8-202ENSMUST00000110139 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
RxrbP28704 Zcchc9-ps-201ENSMUST00000117884 786 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
RxrbP28704 Gm14388-201ENSMUST00000118119 477 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
RxrbP28704 Gm15780-201ENSMUST00000121283 935 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
RxrbP28704 Gm11797-201ENSMUST00000121336 754 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
RxrbP28704 Gm17057-201ENSMUST00000169887 591 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
RxrbP28704 Svs5-201ENSMUST00000017148 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
RxrbP28704 Gm4246-201ENSMUST00000172822 216 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
RxrbP28704 Gm8974-201ENSMUST00000175770 479 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
RxrbP28704 Trav9n-3-201ENSMUST00000177705 575 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
RxrbP28704 Trav9d-3-201ENSMUST00000178252 575 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
RxrbP28704 Magea2-203ENSMUST00000178950 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
RxrbP28704 Gm10717-207ENSMUST00000179264 672 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
RxrbP28704 1500015L24Rik-202ENSMUST00000179640 780 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
RxrbP28704 Rps19-ps5-201ENSMUST00000180745 403 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
RxrbP28704 Gm27315-201ENSMUST00000183977 154 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
RxrbP28704 Mir6415-201ENSMUST00000184064 100 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
RxrbP28704 2010005H15Rik-202ENSMUST00000187183 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
RxrbP28704 Gm18800-202ENSMUST00000188688 1105 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
RxrbP28704 2610001A08Rik-201ENSMUST00000193315 867 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
RxrbP28704 Gm38135-201ENSMUST00000195068 502 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
RxrbP28704 Pilrb2-202ENSMUST00000196162 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
RxrbP28704 4930597L12Rik-201ENSMUST00000196286 911 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
RxrbP28704 Gm42650-201ENSMUST00000197038 575 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
RxrbP28704 Mir1897-202ENSMUST00000198006 79 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
RxrbP28704 Gm18207-201ENSMUST00000205486 526 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
RxrbP28704 Gm45864-201ENSMUST00000211965 1019 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
RxrbP28704 AC124778.1-201ENSMUST00000216013 162 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
RxrbP28704 Gm4796-201ENSMUST00000219802 624 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
RxrbP28704 Mylf-ps-201ENSMUST00000222174 421 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
RxrbP28704 AC154785.1-201ENSMUST00000223280 572 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
RxrbP28704 AL590616.1-201ENSMUST00000223339 574 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
RxrbP28704 AC154687.1-201ENSMUST00000224875 677 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
RxrbP28704 AC168880.1-201ENSMUST00000225113 707 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
RxrbP28704 CT009711.4-201ENSMUST00000225685 198 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
RxrbP28704 AC158981.3-201ENSMUST00000226844 1024 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
RxrbP28704 1700024P04Rik-201ENSMUST00000054425 481 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
RxrbP28704 Gm10717-203ENSMUST00000099051 639 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
RxrbP28704 Gm42820-201ENSMUST00000200084 3063 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
RxrbP28704 Gstz1-201ENSMUST00000063117 1656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
RxrbP28704 Gm44194-201ENSMUST00000204222 3229 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
RxrbP28704 Gm6823-201ENSMUST00000120791 1839 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
RxrbP28704 Ctage5-209ENSMUST00000175912 2885 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
RxrbP28704 Gen1-201ENSMUST00000166117 5268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
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