Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Gm3383-201ENSMUST00000096171 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
Vpreb1P13372 Olfr1247-201ENSMUST00000099771 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.46□□□□□ -1.7
Vpreb1P13372 Gm15813-201ENSMUST00000142286 2541 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
Vpreb1P13372 Gm37456-201ENSMUST00000193176 5837 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Vpreb1P13372 4933402E13Rik-202ENSMUST00000178085 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
Vpreb1P13372 AC154522.1-201ENSMUST00000224647 1903 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Vpreb1P13372 Cd59a-203ENSMUST00000168176 1806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
Vpreb1P13372 AC153143.2-201ENSMUST00000220999 1804 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Vpreb1P13372 Gm21284-201ENSMUST00000205532 3736 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
Vpreb1P13372 Ggta1-203ENSMUST00000102794 3606 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
Vpreb1P13372 2210408I21Rik-202ENSMUST00000225605 1539 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Vpreb1P13372 Vwa5a-202ENSMUST00000118144 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
Vpreb1P13372 Olfr701-202ENSMUST00000166880 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
Vpreb1P13372 Sgip1-205ENSMUST00000106882 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
Vpreb1P13372 Ice2-201ENSMUST00000034761 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
Vpreb1P13372 Gm44231-201ENSMUST00000204106 4075 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Vpreb1P13372 Olfr191-202ENSMUST00000215647 3857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
Vpreb1P13372 Il18r1-201ENSMUST00000087983 2826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
Vpreb1P13372 Mbnl1-214ENSMUST00000193517 5151 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
Vpreb1P13372 Gm37245-201ENSMUST00000195137 2713 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
Vpreb1P13372 Prdm9-206ENSMUST00000167994 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
Vpreb1P13372 4930563J15Rik-201ENSMUST00000218306 3468 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Vpreb1P13372 Zfp933-201ENSMUST00000105718 4238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
Vpreb1P13372 Pum2-203ENSMUST00000111123 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
Vpreb1P13372 Sh2d1b2-202ENSMUST00000162752 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
Vpreb1P13372 AC159193.1-201ENSMUST00000222872 2517 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Vpreb1P13372 Mas1-206ENSMUST00000162333 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
Vpreb1P13372 Gm28818-201ENSMUST00000187553 2989 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
Vpreb1P13372 Mdga2-210ENSMUST00000222167 2871 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
Vpreb1P13372 Mdga2-213ENSMUST00000223141 2850 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
Vpreb1P13372 CAAA01119292.1-201ENSMUST00000226763 2766 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Vpreb1P13372 Gm16070-202ENSMUST00000149914 2146 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
Vpreb1P13372 Crtam-203ENSMUST00000180872 4443 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
Vpreb1P13372 Dram2-203ENSMUST00000121034 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
Vpreb1P13372 Mef2c-212ENSMUST00000197146 6088 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
Vpreb1P13372 Gm37628-201ENSMUST00000194644 5440 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Vpreb1P13372 Gm5891-202ENSMUST00000186212 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
Vpreb1P13372 Gm10662-202ENSMUST00000186928 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
Vpreb1P13372 A230057D06Rik-201ENSMUST00000208961 3026 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
Vpreb1P13372 Atp8a2-201ENSMUST00000080368 12886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
Vpreb1P13372 Gm23529-201ENSMUST00000104562 132 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Vpreb1P13372 Borcs8-202ENSMUST00000110139 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
Vpreb1P13372 Gm13137-201ENSMUST00000118035 345 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Vpreb1P13372 Gm11259-201ENSMUST00000120554 715 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Vpreb1P13372 Gm13282-201ENSMUST00000121577 545 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Vpreb1P13372 Gm13206-201ENSMUST00000129579 1090 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
Vpreb1P13372 Wdr83os-202ENSMUST00000140621 630 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
Vpreb1P13372 Gm12227-201ENSMUST00000147847 563 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
Vpreb1P13372 0610012D04Rik-201ENSMUST00000159031 531 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
Vpreb1P13372 Gm17057-201ENSMUST00000169887 591 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
Vpreb1P13372 Gm26197-201ENSMUST00000175033 115 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Vpreb1P13372 Gm3605-201ENSMUST00000185858 440 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Vpreb1P13372 Gm28535-201ENSMUST00000188069 885 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
Vpreb1P13372 1700030F04Rik-202ENSMUST00000188781 617 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
Vpreb1P13372 Ly6c2-204ENSMUST00000191451 538 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
Vpreb1P13372 Gm16754-202ENSMUST00000193429 508 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
Vpreb1P13372 Gm37469-201ENSMUST00000193728 890 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Vpreb1P13372 1700039M15Rik-201ENSMUST00000195377 1120 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
Vpreb1P13372 Gm43346-201ENSMUST00000198290 685 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
Vpreb1P13372 6430710M23Rik-201ENSMUST00000210843 1191 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Vpreb1P13372 Gm45301-201ENSMUST00000211359 933 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
Vpreb1P13372 Gm33778-201ENSMUST00000216884 704 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Vpreb1P13372 AC160138.1-201ENSMUST00000217965 588 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
Vpreb1P13372 Gm9231-201ENSMUST00000220817 1009 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Vpreb1P13372 AC154382.1-201ENSMUST00000220958 1282 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Vpreb1P13372 Gm18619-201ENSMUST00000222722 1147 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Vpreb1P13372 AC154484.2-201ENSMUST00000228359 818 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Vpreb1P13372 Gstk1-201ENSMUST00000031897 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
Vpreb1P13372 Wdr66-201ENSMUST00000069311 978 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
Vpreb1P13372 Pcdh15-222ENSMUST00000147189 6806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
Vpreb1P13372 Kif9-203ENSMUST00000197248 3184 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
Vpreb1P13372 Fmo9-201ENSMUST00000027843 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
Vpreb1P13372 Ralgapa2-202ENSMUST00000109986 11030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
Vpreb1P13372 Dcun1d1-203ENSMUST00000178098 4434 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
Vpreb1P13372 Crnn-201ENSMUST00000107300 1628 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
Vpreb1P13372 Serpinb11-201ENSMUST00000027566 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
Vpreb1P13372 Cd44-205ENSMUST00000111191 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
Vpreb1P13372 Matr3-201ENSMUST00000166793 6262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
Vpreb1P13372 Gm29123-201ENSMUST00000185808 3657 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
Vpreb1P13372 Prokr2-204ENSMUST00000142766 3932 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
Vpreb1P13372 4933406G16Rik-201ENSMUST00000144854 1415 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
Vpreb1P13372 Liph-202ENSMUST00000074230 3703 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
Vpreb1P13372 Cntn4-202ENSMUST00000089208 5179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
Vpreb1P13372 Atf2-205ENSMUST00000112010 4037 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
Vpreb1P13372 Trp53inp1-201ENSMUST00000029865 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
Vpreb1P13372 Fam205a3-201ENSMUST00000178192 3927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
Vpreb1P13372 Fam205a2-202ENSMUST00000180201 3927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
Vpreb1P13372 Bnip3l-201ENSMUST00000022634 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
Vpreb1P13372 P2ry13-201ENSMUST00000040622 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
Vpreb1P13372 Csde1-215ENSMUST00000199420 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
Vpreb1P13372 Kmt2d-201ENSMUST00000023741 19823 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
Vpreb1P13372 Pls3-204ENSMUST00000114059 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
Vpreb1P13372 Trim5-201ENSMUST00000051795 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
Vpreb1P13372 Zdhhc11-201ENSMUST00000091493 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
Vpreb1P13372 A4gnt-201ENSMUST00000042553 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
Vpreb1P13372 Rfc1-203ENSMUST00000203581 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
Vpreb1P13372 Clca3b-201ENSMUST00000159989 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
Vpreb1P13372 Ppp4r4-202ENSMUST00000187155 2675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
Vpreb1P13372 Rsrc2-201ENSMUST00000050827 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
Vpreb1P13372 Gm7265-201ENSMUST00000192735 3502 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.9 ms