Protein–RNA interactions for Protein: P0C1T1

Hoxb2, Homeobox protein Hox-B2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb2P0C1T1 Gm43979-201ENSMUST00000203179 475 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Gm44449-201ENSMUST00000203610 153 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Gm44448-201ENSMUST00000205104 393 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Gm36371-201ENSMUST00000209043 1103 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Ldhc-204ENSMUST00000210585 1071 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Spata19-204ENSMUST00000214287 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Gm7239-201ENSMUST00000220981 860 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 CT030170.6-202ENSMUST00000223186 544 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 AC118639.1-204ENSMUST00000226401 694 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Frem3-201ENSMUST00000039695 6384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Mapk9-202ENSMUST00000043321 1297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Olfr957-201ENSMUST00000051653 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Vmn1r89-201ENSMUST00000053008 951 ntAPPRIS P2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Vmn1r46-201ENSMUST00000075797 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Olfr1354-201ENSMUST00000075859 1095 ntAPPRIS P1 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Olfr715-201ENSMUST00000076958 1131 ntAPPRIS P1 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Gm26264-201ENSMUST00000083278 159 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Anapc15-ps-201ENSMUST00000099328 426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Dnajc6-201ENSMUST00000038207 5258 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Gm28427-201ENSMUST00000190144 2162 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Gm38072-201ENSMUST00000192127 2162 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Zfyve9-201ENSMUST00000042185 2170 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Pbdc1-201ENSMUST00000033577 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Tcf7l2-211ENSMUST00000111658 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Ehhadh-201ENSMUST00000023559 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Gm43128-201ENSMUST00000202212 1621 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Olfr1465-202ENSMUST00000207340 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 AC122346.2-201ENSMUST00000224326 2931 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Kntc1-201ENSMUST00000031366 6961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Ttc39d-202ENSMUST00000134652 2438 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Arpp21-201ENSMUST00000035085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Gm37739-201ENSMUST00000191742 1505 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Gm38003-201ENSMUST00000191968 1504 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Hrh2-201ENSMUST00000038101 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Chn1os3-201ENSMUST00000147420 2707 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Tnfrsf19-202ENSMUST00000111236 3958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Jakmip2-201ENSMUST00000082254 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Zfp963-201ENSMUST00000130458 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 4932414J04Rik-201ENSMUST00000152483 3059 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Gm6823-201ENSMUST00000120791 1839 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 5430401H09Rik-202ENSMUST00000218836 2620 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Olfr1254-203ENSMUST00000216587 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Gm28906-201ENSMUST00000191371 1779 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Gm38147-201ENSMUST00000192397 1798 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Gm18830-201ENSMUST00000199036 1396 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Gm4673-201ENSMUST00000181395 3660 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Zfp474-202ENSMUST00000209270 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Olfr119-202ENSMUST00000213732 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Kcnj15-203ENSMUST00000113855 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Sos2-203ENSMUST00000182396 3963 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Pik3r4-201ENSMUST00000065778 4711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 4930407I10Rik-201ENSMUST00000100396 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Mmaa-201ENSMUST00000048718 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Syn3-201ENSMUST00000120638 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Zfp472-201ENSMUST00000039132 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Gm8281-201ENSMUST00000100893 612 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Mir190b-201ENSMUST00000104803 80 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Gm2348-201ENSMUST00000108782 300 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Uqcrq-202ENSMUST00000109019 504 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Gm13243-201ENSMUST00000117481 565 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Gm15616-201ENSMUST00000118662 375 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Gm4918-201ENSMUST00000119420 1084 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Gm13240-201ENSMUST00000120042 565 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Gm13131-201ENSMUST00000122228 321 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Gm13649-201ENSMUST00000122325 606 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Gm16096-202ENSMUST00000149386 819 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Gm24065-201ENSMUST00000157487 264 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Gm24738-201ENSMUST00000158856 123 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Gm3339-201ENSMUST00000163462 475 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Gm3298-201ENSMUST00000165289 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Cd180-202ENSMUST00000167144 430 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Gm8206-202ENSMUST00000168733 516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Gm8265-201ENSMUST00000170469 475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Gm20432-201ENSMUST00000173716 250 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Gm19203-201ENSMUST00000174049 939 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Gm25690-201ENSMUST00000175439 77 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Gm6176-201ENSMUST00000178209 906 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Gm5698-201ENSMUST00000178317 724 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Gm4567-201ENSMUST00000178591 906 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Gm3642-202ENSMUST00000179296 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Gm10668-201ENSMUST00000179491 906 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Gm3696-202ENSMUST00000179898 612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Gm7976-201ENSMUST00000181507 1242 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Gm26812-201ENSMUST00000181647 328 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Gm28428-201ENSMUST00000188886 697 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Gm4545-201ENSMUST00000190797 603 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Gm36945-201ENSMUST00000192040 864 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Gm7804-201ENSMUST00000192784 738 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Gm6522-201ENSMUST00000197160 1203 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Gm43772-201ENSMUST00000202052 379 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Gng12-208ENSMUST00000204511 739 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Gm17995-201ENSMUST00000209266 530 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Gm45299-201ENSMUST00000210199 420 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Olfr942-ps1-201ENSMUST00000215640 662 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Gm18378-201ENSMUST00000216245 628 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Gm7392-201ENSMUST00000217815 345 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 AC153852.1-201ENSMUST00000217881 567 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 Gm35619-201ENSMUST00000222548 600 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 AC126939.4-201ENSMUST00000225360 743 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxb2P0C1T1 AC139569.1-201ENSMUST00000226080 614 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
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