Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Naip6-201ENSMUST00000042220 6705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
TtrP07309 Herc2-202ENSMUST00000164095 15261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
TtrP07309 Olfr798-202ENSMUST00000204979 3590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
TtrP07309 Eif3e-201ENSMUST00000022960 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
TtrP07309 Adgre1-201ENSMUST00000004850 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
TtrP07309 9930111J21Rik2-201ENSMUST00000093152 2403 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
TtrP07309 9930111J21Rik1-201ENSMUST00000093153 2403 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
TtrP07309 Lingo2-203ENSMUST00000108122 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
TtrP07309 Gm30075-201ENSMUST00000205509 3005 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
TtrP07309 Slamf1-201ENSMUST00000015460 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
TtrP07309 Mtpap-201ENSMUST00000025077 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
TtrP07309 Gm21123-201ENSMUST00000210822 1734 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
TtrP07309 Olfr348-204ENSMUST00000215199 3557 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
TtrP07309 Soat1-201ENSMUST00000051396 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
TtrP07309 Pcdh9-207ENSMUST00000195376 5096 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
TtrP07309 Cdh9-202ENSMUST00000228307 3539 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
TtrP07309 Ipo11-205ENSMUST00000186033 4147 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
TtrP07309 Them5-202ENSMUST00000198083 1378 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
TtrP07309 E330011O21Rik-204ENSMUST00000210839 1361 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
TtrP07309 Efcab14-201ENSMUST00000074425 4300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
TtrP07309 Olfr127-202ENSMUST00000217223 3733 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
TtrP07309 Gm38081-201ENSMUST00000192680 1645 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TtrP07309 AC121870.1-201ENSMUST00000216279 4879 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TtrP07309 Olfr553-202ENSMUST00000216776 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
TtrP07309 Gm20789-201ENSMUST00000221002 4195 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TtrP07309 Hyal4-201ENSMUST00000031691 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
TtrP07309 Ighv1-82-201ENSMUST00000103549 294 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
TtrP07309 Gm14248-201ENSMUST00000117790 544 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TtrP07309 Gm8421-201ENSMUST00000119439 305 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TtrP07309 Gm12879-201ENSMUST00000120003 1182 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TtrP07309 Gm11371-201ENSMUST00000120294 385 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TtrP07309 Gm12123-201ENSMUST00000120348 472 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TtrP07309 Gm15224-201ENSMUST00000120501 388 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TtrP07309 Gm14048-201ENSMUST00000121864 1268 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TtrP07309 Gm25962-201ENSMUST00000157173 168 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TtrP07309 Gm22206-201ENSMUST00000158612 116 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TtrP07309 Gm17212-201ENSMUST00000166666 259 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TtrP07309 Gm3585-201ENSMUST00000173438 875 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TtrP07309 Vmn2r-ps131-201ENSMUST00000176094 1046 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TtrP07309 n-R5s109-201ENSMUST00000179195 119 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TtrP07309 Gm27507-201ENSMUST00000184199 93 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TtrP07309 Gm8883-201ENSMUST00000187594 454 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
TtrP07309 Gm28502-201ENSMUST00000189781 476 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
TtrP07309 Gm37017-201ENSMUST00000195266 747 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TtrP07309 Gm42752-201ENSMUST00000198394 1106 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TtrP07309 Gm30808-201ENSMUST00000211166 845 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
TtrP07309 Gm45514-201ENSMUST00000211531 689 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TtrP07309 CAAA01216754.4-203ENSMUST00000217178 1097 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
TtrP07309 AC163684.1-201ENSMUST00000223766 927 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TtrP07309 AC163667.1-201ENSMUST00000225201 1289 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TtrP07309 AC130219.2-201ENSMUST00000228765 807 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TtrP07309 Olfr1457-201ENSMUST00000075170 954 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
TtrP07309 Vmn1r30-201ENSMUST00000078890 1053 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
TtrP07309 Defb18-201ENSMUST00000097818 258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
TtrP07309 Gm16123-201ENSMUST00000118647 1517 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TtrP07309 Gm43682-201ENSMUST00000202150 2090 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TtrP07309 Stc1-201ENSMUST00000014957 4197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
TtrP07309 Gm16503-201ENSMUST00000104964 3283 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
TtrP07309 Pramef8-201ENSMUST00000037356 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
TtrP07309 Ppm1k-201ENSMUST00000042766 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
TtrP07309 Olfr716-205ENSMUST00000214819 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
TtrP07309 Fastkd5-202ENSMUST00000179273 2424 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
TtrP07309 Kif9-203ENSMUST00000197248 3184 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
TtrP07309 Trpm3-204ENSMUST00000099564 3653 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
TtrP07309 Gm37435-201ENSMUST00000192078 3947 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
TtrP07309 4930402F06Rik-202ENSMUST00000113010 1372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
TtrP07309 Ugt2b38-201ENSMUST00000072818 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
TtrP07309 Sytl2-206ENSMUST00000190731 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
TtrP07309 AL450321.1-201ENSMUST00000220600 3550 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
TtrP07309 Gm45457-201ENSMUST00000209931 3089 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
TtrP07309 Zbtb20-204ENSMUST00000114694 26901 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
TtrP07309 Csn2-206ENSMUST00000197422 1329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
TtrP07309 Itih4-202ENSMUST00000078490 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
TtrP07309 Mybpc1-202ENSMUST00000121629 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
TtrP07309 Olfr373-203ENSMUST00000215198 3923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
TtrP07309 Stk38l-201ENSMUST00000001675 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
TtrP07309 Omg-201ENSMUST00000164465 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
TtrP07309 Gm44039-201ENSMUST00000204192 2246 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
TtrP07309 Gm25614-201ENSMUST00000104013 133 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
TtrP07309 Ccdc32-202ENSMUST00000110833 732 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
TtrP07309 Gm14480-201ENSMUST00000118521 433 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
TtrP07309 Gm14869-201ENSMUST00000119007 884 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
TtrP07309 AI646519-201ENSMUST00000140987 351 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
TtrP07309 Gm15843-201ENSMUST00000146593 529 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
TtrP07309 Gm11482-201ENSMUST00000147067 719 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
TtrP07309 Il4-204ENSMUST00000150568 605 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
TtrP07309 Gm15787-207ENSMUST00000152014 885 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
TtrP07309 2810442N19Rik-202ENSMUST00000161583 919 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
TtrP07309 Gm8895-201ENSMUST00000172300 1223 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
TtrP07309 Rbx1-ps-201ENSMUST00000173786 327 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
TtrP07309 Spint4-201ENSMUST00000017454 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
TtrP07309 1810053B23Rik-202ENSMUST00000185364 590 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
TtrP07309 Gm18351-201ENSMUST00000188646 883 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
TtrP07309 Gm26413-202ENSMUST00000198972 127 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
TtrP07309 Gm43495-201ENSMUST00000200060 205 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
TtrP07309 Gm3279-201ENSMUST00000203099 1092 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
TtrP07309 Gm39158-201ENSMUST00000210178 856 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
TtrP07309 D730003K21Rik-202ENSMUST00000217456 533 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
TtrP07309 AC153943.1-201ENSMUST00000219312 256 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
TtrP07309 Gm9289-201ENSMUST00000221269 606 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.4 ms