Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm43229-201ENSMUST00000201812 1850 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Olfr167-202ENSMUST00000214315 7435 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Bmx-201ENSMUST00000112263 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Xlr3b-201ENSMUST00000101486 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Platr25-201ENSMUST00000143260 2509 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Ctage5-217ENSMUST00000176892 2784 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Mylk4-201ENSMUST00000057428 5571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Igkv2-137-201ENSMUST00000103302 501 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Gm26419-201ENSMUST00000104272 133 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Gm23834-201ENSMUST00000104436 129 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Gm24519-201ENSMUST00000104507 132 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Eif3m-202ENSMUST00000111110 817 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Gm11903-201ENSMUST00000118958 727 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Gm14218-201ENSMUST00000137802 595 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Gm11820-201ENSMUST00000139614 664 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Gm15322-201ENSMUST00000142621 739 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Gml-202ENSMUST00000164026 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Gm23639-201ENSMUST00000175078 132 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Ighv13-2-202ENSMUST00000183954 302 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Mir6241-201ENSMUST00000184225 103 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 4930568A12Rik-201ENSMUST00000186117 498 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 1700020M21Rik-201ENSMUST00000188320 644 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Gm35323-201ENSMUST00000191836 499 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Gm1647-201ENSMUST00000195406 735 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Shisa5-214ENSMUST00000198708 771 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 A730082K24Rik-202ENSMUST00000205795 658 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Gm44812-202ENSMUST00000208999 1285 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Gm45309-201ENSMUST00000211528 695 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Gm30132-202ENSMUST00000212825 819 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 AC108846.4-201ENSMUST00000216783 341 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 AC125064.1-201ENSMUST00000225801 295 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Dusp21-201ENSMUST00000026018 845 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Odf3l1-201ENSMUST00000055036 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Gm6054-201ENSMUST00000078052 378 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Olfr220-201ENSMUST00000085861 978 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Hsp90aa1-201ENSMUST00000021698 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Iqch-201ENSMUST00000042322 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Adgre1-201ENSMUST00000004850 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Dclre1c-201ENSMUST00000061852 7075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Emcn-202ENSMUST00000122064 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Nckap5-201ENSMUST00000057846 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Gm44763-201ENSMUST00000208287 2019 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Gtpbp4-204ENSMUST00000222098 8783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Lef1-203ENSMUST00000098611 2298 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Gm40518-202ENSMUST00000214538 4080 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Alcam-203ENSMUST00000164728 1885 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Cntnap5a-201ENSMUST00000043725 10945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Ncr1-201ENSMUST00000006792 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Vmn2r13-201ENSMUST00000053253 2496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Heph-203ENSMUST00000113838 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Map2-203ENSMUST00000114012 5119 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Gm38077-201ENSMUST00000193657 3245 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Uba1y-201ENSMUST00000115894 3981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Gm26645-201ENSMUST00000181076 1316 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 AC107452.3-201ENSMUST00000228807 1308 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Cyld-206ENSMUST00000209559 4476 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Tlr4-201ENSMUST00000048096 4077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Nmd3-201ENSMUST00000029358 9135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Gm4513-201ENSMUST00000207881 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Gm4565-201ENSMUST00000208134 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Ncoa6-201ENSMUST00000043126 6872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Gm38156-201ENSMUST00000194601 2260 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Vmn1r15-201ENSMUST00000228297 2021 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Trrap-201ENSMUST00000038980 12344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Abca15-202ENSMUST00000121265 5335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Abca15-201ENSMUST00000076272 5335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Enpp2-204ENSMUST00000173516 2887 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Ttk-201ENSMUST00000070326 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Gm31520-202ENSMUST00000203574 1524 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Zfp317-203ENSMUST00000213725 2354 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Gm23748-201ENSMUST00000104227 131 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Gm11787-201ENSMUST00000121996 1050 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Gm25180-201ENSMUST00000157746 115 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Gm24130-201ENSMUST00000158536 151 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Gm17079-201ENSMUST00000167231 666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Ulbp1-201ENSMUST00000169796 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Gm26381-201ENSMUST00000174895 92 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Gm22119-201ENSMUST00000175594 99 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Gm20691-201ENSMUST00000176889 333 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Gm27026-201ENSMUST00000183003 892 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Gm29529-201ENSMUST00000187154 714 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Igkv4-83-201ENSMUST00000196933 334 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Gm43040-201ENSMUST00000202399 558 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Crcp-206ENSMUST00000202756 600 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Gm5586-201ENSMUST00000206264 795 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Olfr1500-206ENSMUST00000217079 1025 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 AC154248.1-201ENSMUST00000222072 495 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 CT030260.1-201ENSMUST00000223243 442 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 AC147245.1-201ENSMUST00000223294 677 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Smim15-202ENSMUST00000223808 808 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 AC161877.2-201ENSMUST00000226248 545 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Ropn1-201ENSMUST00000023530 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 F730035P03Rik-201ENSMUST00000065741 917 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Olfr342-201ENSMUST00000074192 1054 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Lrrc51-201ENSMUST00000078448 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 n-R5s56-201ENSMUST00000082521 105 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Scgb1b27-201ENSMUST00000085618 493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Serpina7-202ENSMUST00000060824 1895 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Olfr1015-203ENSMUST00000215945 2479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Gm14827-201ENSMUST00000146644 3089 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
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