Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Scgb2b8-ps-201ENSMUST00000188661 327 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Sp100O35892 Scgb2b13-ps-201ENSMUST00000190420 328 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Sp100O35892 Gm28400-201ENSMUST00000191332 380 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Sp100O35892 Gm8101-201ENSMUST00000192796 478 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Sp100O35892 Gm1647-201ENSMUST00000195406 735 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Sp100O35892 5033403H07Rik-202ENSMUST00000198248 756 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Sp100O35892 4930568A13Rik-201ENSMUST00000199961 1061 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Sp100O35892 Gm43812-202ENSMUST00000202701 581 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Sp100O35892 Gm44418-201ENSMUST00000204219 705 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Sp100O35892 Gm44931-201ENSMUST00000206056 545 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Sp100O35892 Gm44692-201ENSMUST00000207441 901 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Sp100O35892 Gm39158-201ENSMUST00000210178 856 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Sp100O35892 Gm19217-201ENSMUST00000218238 328 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Sp100O35892 AC155941.3-201ENSMUST00000218476 308 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Sp100O35892 D830013O20Rik-202ENSMUST00000221180 683 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Sp100O35892 Mplkip-202ENSMUST00000221480 582 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Sp100O35892 AC164597.1-201ENSMUST00000226538 514 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Sp100O35892 Olfr1364-201ENSMUST00000057453 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Sp100O35892 Defa35-201ENSMUST00000078121 398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Sp100O35892 Olfr220-201ENSMUST00000085861 978 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Sp100O35892 Gm9314-201ENSMUST00000199881 1528 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Sp100O35892 Epgn-201ENSMUST00000041516 1760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Sp100O35892 Ccar1-211ENSMUST00000219527 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Sp100O35892 Zfp638-203ENSMUST00000113836 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Sp100O35892 Gm13106-201ENSMUST00000119045 1443 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Sp100O35892 Pde1a-202ENSMUST00000102651 1673 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Sp100O35892 Vmn1r71-203ENSMUST00000227003 5048 ntAPPRIS P2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Sp100O35892 Pde1a-201ENSMUST00000090756 1661 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Sp100O35892 Dcp2-201ENSMUST00000025350 8616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Sp100O35892 Sspo-202ENSMUST00000169350 15571 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Sp100O35892 Gm5286-201ENSMUST00000159524 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Sp100O35892 Pard3-212ENSMUST00000160717 4214 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Sp100O35892 Zbtb44-202ENSMUST00000167346 1308 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Sp100O35892 Bnc2-201ENSMUST00000102820 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Sp100O35892 Gm13346-201ENSMUST00000135767 3634 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Sp100O35892 Zdhhc17-201ENSMUST00000041723 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Sp100O35892 Ms4a4c-201ENSMUST00000072729 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
Sp100O35892 Gm30948-201ENSMUST00000195683 4827 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
Sp100O35892 Iqch-202ENSMUST00000080527 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
Sp100O35892 Vezt-204ENSMUST00000119818 11138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
Sp100O35892 D030034A15Rik-201ENSMUST00000215835 3953 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
Sp100O35892 Gm46136-202ENSMUST00000217053 6329 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
Sp100O35892 Trpm3-203ENSMUST00000087576 6740 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
Sp100O35892 Kidins220-201ENSMUST00000066652 7409 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Sp100O35892 Cep85l-201ENSMUST00000095691 2560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Sp100O35892 Adar-201ENSMUST00000029563 3753 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Sp100O35892 Adipor2-201ENSMUST00000032272 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Sp100O35892 Olfr318-203ENSMUST00000214728 4552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Sp100O35892 Gm5512-202ENSMUST00000220222 1522 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Sp100O35892 Sv2b-204ENSMUST00000206344 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Sp100O35892 Skil-201ENSMUST00000029194 6717 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Sp100O35892 Cldn34b4-201ENSMUST00000101419 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Sp100O35892 1700092K14Rik-201ENSMUST00000106604 395 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Sp100O35892 Apoa2-204ENSMUST00000111321 518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Sp100O35892 1700025D23Rik-201ENSMUST00000129365 846 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Sp100O35892 4930405D11Rik-203ENSMUST00000142521 645 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Sp100O35892 4933411O13Rik-203ENSMUST00000146849 607 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Sp100O35892 Gm12514-202ENSMUST00000150455 699 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Sp100O35892 Gm25505-201ENSMUST00000157220 246 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Sp100O35892 Vmn1r-ps21-201ENSMUST00000176891 925 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Sp100O35892 A630095E13Rik-202ENSMUST00000184611 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Sp100O35892 Oosp1-203ENSMUST00000186557 495 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Sp100O35892 1700006H21Rik-201ENSMUST00000188490 627 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Sp100O35892 Gm28564-201ENSMUST00000190864 240 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Sp100O35892 Gm28070-201ENSMUST00000191502 445 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Sp100O35892 Gm18865-201ENSMUST00000193011 1171 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Sp100O35892 Gm37017-201ENSMUST00000195266 747 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Sp100O35892 Gm18985-201ENSMUST00000196472 1079 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Sp100O35892 Gm10416-201ENSMUST00000197379 645 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Sp100O35892 Gm18330-201ENSMUST00000199246 547 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Sp100O35892 Scn8a-207ENSMUST00000200959 587 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Sp100O35892 A730082K24Rik-202ENSMUST00000205795 658 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Sp100O35892 Gm34853-201ENSMUST00000211662 509 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Sp100O35892 Gm6885-201ENSMUST00000217261 372 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Sp100O35892 AC131654.1-201ENSMUST00000219675 745 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Sp100O35892 AC154450.1-201ENSMUST00000220911 485 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Sp100O35892 Spata31-202ENSMUST00000221202 814 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Sp100O35892 Gm19189-201ENSMUST00000221689 754 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Sp100O35892 CT009718.2-202ENSMUST00000222092 704 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Sp100O35892 AC117949.1-201ENSMUST00000225547 419 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Sp100O35892 CT025630.2-201ENSMUST00000228293 487 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Sp100O35892 Tmem253-204ENSMUST00000228408 415 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Sp100O35892 Gsta4-201ENSMUST00000034903 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Sp100O35892 Olfr683-201ENSMUST00000061284 960 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Sp100O35892 Snora21-201ENSMUST00000082967 137 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Sp100O35892 Mir365-2-201ENSMUST00000083555 112 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Sp100O35892 Slxl1-201ENSMUST00000088740 730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Sp100O35892 Gm1604a-201ENSMUST00000097422 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Sp100O35892 Mgam2-ps-201ENSMUST00000195870 3745 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Sp100O35892 Olfr1564-202ENSMUST00000208645 5213 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Sp100O35892 Gm45360-201ENSMUST00000210698 1405 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Sp100O35892 Vangl1-202ENSMUST00000159388 3207 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Sp100O35892 Golph3l-207ENSMUST00000177390 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Sp100O35892 Cyp2c67-201ENSMUST00000067328 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Sp100O35892 Gm37023-201ENSMUST00000192895 2426 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Sp100O35892 Adgre1-201ENSMUST00000004850 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Sp100O35892 Olfr342-202ENSMUST00000216275 3818 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Sp100O35892 Vmn2r61-201ENSMUST00000166131 2598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Sp100O35892 Gm31822-201ENSMUST00000216096 2572 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Sp100O35892 Bbx-201ENSMUST00000066037 4523 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms