Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Gm44620-201ENSMUST00000209183 2887 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Ubl3Q9Z2M6 Rfx4-205ENSMUST00000166696 3332 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Ubl3Q9Z2M6 Ccdc191-203ENSMUST00000132859 3779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Ubl3Q9Z2M6 Stag2-203ENSMUST00000115073 6171 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Ubl3Q9Z2M6 Cenpc1-201ENSMUST00000031170 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Ubl3Q9Z2M6 Gm30948-201ENSMUST00000195683 4827 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Ubl3Q9Z2M6 Tnr-202ENSMUST00000192069 12202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Ubl3Q9Z2M6 Kmo-202ENSMUST00000097458 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Ubl3Q9Z2M6 Gm19024-201ENSMUST00000194681 1319 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Ubl3Q9Z2M6 Med23-202ENSMUST00000092646 5098 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Ubl3Q9Z2M6 Gm45949-201ENSMUST00000221550 1895 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Ubl3Q9Z2M6 Vmn1r176-204ENSMUST00000227129 2955 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
Ubl3Q9Z2M6 Vmn1r176-207ENSMUST00000228793 2959 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
Ubl3Q9Z2M6 Vmn1r11-202ENSMUST00000226968 2522 ntAPPRIS P2 BASIC6□□□□□ -1.45
Ubl3Q9Z2M6 Gm20749-201ENSMUST00000186319 3492 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Ubl3Q9Z2M6 P2ry14-203ENSMUST00000196081 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Ubl3Q9Z2M6 Vmn1r220-202ENSMUST00000226651 6252 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
Ubl3Q9Z2M6 Mtrr-201ENSMUST00000045827 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Ubl3Q9Z2M6 Kcnmb2-205ENSMUST00000192429 2357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Ubl3Q9Z2M6 Gm42668-201ENSMUST00000200747 2487 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Ubl3Q9Z2M6 Gm45601-201ENSMUST00000211483 6753 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Ubl3Q9Z2M6 Gm45201-201ENSMUST00000207187 2679 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Ubl3Q9Z2M6 Amelx-202ENSMUST00000112118 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Ubl3Q9Z2M6 Gm11889-201ENSMUST00000118402 1079 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Ubl3Q9Z2M6 Gm13930-201ENSMUST00000118569 368 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Ubl3Q9Z2M6 Gm15129-201ENSMUST00000119673 279 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Ubl3Q9Z2M6 Vmn1r207-ps-201ENSMUST00000119931 1073 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Ubl3Q9Z2M6 Gm6067-201ENSMUST00000121648 491 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Ubl3Q9Z2M6 Gm15242-201ENSMUST00000122459 283 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Ubl3Q9Z2M6 Gm2788-201ENSMUST00000129551 797 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
Ubl3Q9Z2M6 Gm13715-201ENSMUST00000136578 411 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
Ubl3Q9Z2M6 4930412L05Rik-202ENSMUST00000146501 1241 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Ubl3Q9Z2M6 4933411O13Rik-203ENSMUST00000146849 607 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Ubl3Q9Z2M6 Nol12-205ENSMUST00000149580 646 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Ubl3Q9Z2M6 A430048G15Rik-201ENSMUST00000149965 627 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Ubl3Q9Z2M6 Gm22552-201ENSMUST00000157796 337 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Ubl3Q9Z2M6 Gm24680-201ENSMUST00000158759 126 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Ubl3Q9Z2M6 Serpina4-ps1-201ENSMUST00000166601 1287 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Ubl3Q9Z2M6 Pid1-205ENSMUST00000176720 450 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Ubl3Q9Z2M6 Gm26587-201ENSMUST00000180795 989 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Ubl3Q9Z2M6 Gm9167-201ENSMUST00000182469 962 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Ubl3Q9Z2M6 Gm38204-201ENSMUST00000194835 619 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
Ubl3Q9Z2M6 Gm6077-201ENSMUST00000196008 499 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Ubl3Q9Z2M6 Pilrb2-202ENSMUST00000196162 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Ubl3Q9Z2M6 U90926-202ENSMUST00000201332 524 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Ubl3Q9Z2M6 Pde6h-203ENSMUST00000204382 211 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Ubl3Q9Z2M6 Gm2975-201ENSMUST00000209710 820 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Ubl3Q9Z2M6 Gm7368-201ENSMUST00000213307 367 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Ubl3Q9Z2M6 Gm30676-202ENSMUST00000214464 793 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Ubl3Q9Z2M6 Gm19007-201ENSMUST00000217746 874 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Ubl3Q9Z2M6 Lrrc51-201ENSMUST00000078448 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Ubl3Q9Z2M6 Gla-201ENSMUST00000033621 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Ubl3Q9Z2M6 C3ar1-201ENSMUST00000042081 4305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Ubl3Q9Z2M6 Tarm1-202ENSMUST00000203020 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Ubl3Q9Z2M6 Gm12800-201ENSMUST00000075999 1455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Ubl3Q9Z2M6 Mug4-ps-201ENSMUST00000203118 3578 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Ubl3Q9Z2M6 Gm9871-203ENSMUST00000204837 1560 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Ubl3Q9Z2M6 Tmem182-201ENSMUST00000114765 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Ubl3Q9Z2M6 Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 9405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Ubl3Q9Z2M6 Olfr976-201ENSMUST00000169307 2813 ntAPPRIS P2 BASIC6□□□□□ -1.45
Ubl3Q9Z2M6 Olfr1364-202ENSMUST00000206526 2938 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
Ubl3Q9Z2M6 Slc4a4-203ENSMUST00000130041 3335 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Ubl3Q9Z2M6 Gm37183-201ENSMUST00000191712 3405 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Ubl3Q9Z2M6 Snx10-207ENSMUST00000179365 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Ubl3Q9Z2M6 Wdr35-202ENSMUST00000111113 4312 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Ubl3Q9Z2M6 Vmn1r79-202ENSMUST00000226953 5636 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
Ubl3Q9Z2M6 Hormad2-203ENSMUST00000109949 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ubl3Q9Z2M6 Ankrd66-201ENSMUST00000178772 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ubl3Q9Z2M6 Gm16123-201ENSMUST00000118647 1517 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Ubl3Q9Z2M6 C430042M11Rik-201ENSMUST00000180515 1617 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ubl3Q9Z2M6 Mylk4-201ENSMUST00000057428 5571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ubl3Q9Z2M6 CT025619.1-201ENSMUST00000214294 2331 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ubl3Q9Z2M6 Atp2b4-206ENSMUST00000143567 11725 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ubl3Q9Z2M6 Sh2d1b2-202ENSMUST00000162752 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ubl3Q9Z2M6 Vmn1r176-203ENSMUST00000226767 2536 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ubl3Q9Z2M6 Vmn1r176-205ENSMUST00000227661 2507 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ubl3Q9Z2M6 Vmn1r176-206ENSMUST00000228280 2532 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ubl3Q9Z2M6 4732465J04Rik-202ENSMUST00000187483 2744 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ubl3Q9Z2M6 Gm30075-201ENSMUST00000205509 3005 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ubl3Q9Z2M6 1700014D04Rik-203ENSMUST00000180139 3231 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ubl3Q9Z2M6 Gm43876-201ENSMUST00000203831 3229 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Ubl3Q9Z2M6 Tmcc3-203ENSMUST00000117929 3317 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ubl3Q9Z2M6 Vmn1r81-202ENSMUST00000227080 13256 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ubl3Q9Z2M6 Clock-205ENSMUST00000202651 9744 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ubl3Q9Z2M6 Nmd3-201ENSMUST00000029358 9135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ubl3Q9Z2M6 Il1rapl1-201ENSMUST00000078875 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ubl3Q9Z2M6 C87977-204ENSMUST00000105757 1885 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ubl3Q9Z2M6 Gm10555-201ENSMUST00000193178 1791 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Ubl3Q9Z2M6 Cct8-203ENSMUST00000175977 1470 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ubl3Q9Z2M6 4930402F06Rik-202ENSMUST00000113010 1372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ubl3Q9Z2M6 Gm20730-201ENSMUST00000103301 359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ubl3Q9Z2M6 Gm22781-201ENSMUST00000104083 137 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Ubl3Q9Z2M6 Rpl31-ps10-201ENSMUST00000116034 378 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Ubl3Q9Z2M6 Gm12242-201ENSMUST00000118824 738 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Ubl3Q9Z2M6 Gm14466-201ENSMUST00000119028 451 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Ubl3Q9Z2M6 Rpl31-ps11-201ENSMUST00000119898 377 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Ubl3Q9Z2M6 Rpl31-ps12-201ENSMUST00000119957 375 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Ubl3Q9Z2M6 Gm15712-201ENSMUST00000120369 1156 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Ubl3Q9Z2M6 Amy2-ps1-201ENSMUST00000122117 1117 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Ubl3Q9Z2M6 Gm14503-201ENSMUST00000130337 1164 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms