Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Gm37951-201ENSMUST00000192963 3032 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
ChmQ9QXG2 AC125328.1-201ENSMUST00000226812 2265 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
ChmQ9QXG2 Mmp20-201ENSMUST00000034487 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
ChmQ9QXG2 Cltc-201ENSMUST00000060766 6163 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
ChmQ9QXG2 Golga3-202ENSMUST00000112512 8132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
ChmQ9QXG2 Mpdz-202ENSMUST00000107258 7241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
ChmQ9QXG2 Sh3kbp1-202ENSMUST00000080394 2980 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
ChmQ9QXG2 Vmn1r218-204ENSMUST00000227160 9558 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
ChmQ9QXG2 Gm10309-201ENSMUST00000095186 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
ChmQ9QXG2 Gm45061-201ENSMUST00000204395 2095 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
ChmQ9QXG2 Lonrf2-201ENSMUST00000039612 5077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
ChmQ9QXG2 Adgb-204ENSMUST00000172530 5215 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
ChmQ9QXG2 Plek-201ENSMUST00000020321 3896 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
ChmQ9QXG2 Gm33148-201ENSMUST00000210835 7227 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
ChmQ9QXG2 Il18r1-202ENSMUST00000108044 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
ChmQ9QXG2 Gm15813-201ENSMUST00000142286 2541 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
ChmQ9QXG2 Zfp799-205ENSMUST00000202988 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
ChmQ9QXG2 Zfp638-202ENSMUST00000113835 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
ChmQ9QXG2 Zfp930-204ENSMUST00000212681 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
ChmQ9QXG2 Olfr798-202ENSMUST00000204979 3590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
ChmQ9QXG2 Vps50-203ENSMUST00000170873 3687 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
ChmQ9QXG2 D330045A20Rik-202ENSMUST00000113030 3736 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
ChmQ9QXG2 Gm24462-201ENSMUST00000102430 106 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
ChmQ9QXG2 Gm22671-201ENSMUST00000104420 134 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
ChmQ9QXG2 Cav1-205ENSMUST00000115456 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
ChmQ9QXG2 Mageb8-ps-201ENSMUST00000117228 1033 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
ChmQ9QXG2 Gm9506-201ENSMUST00000118516 320 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
ChmQ9QXG2 Gm5759-201ENSMUST00000119203 811 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
ChmQ9QXG2 Gm13163-201ENSMUST00000119875 336 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
ChmQ9QXG2 Gm11255-201ENSMUST00000120448 1180 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
ChmQ9QXG2 Gm12665-201ENSMUST00000126063 541 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
ChmQ9QXG2 Cox7c-204ENSMUST00000132233 709 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
ChmQ9QXG2 Gm10913-201ENSMUST00000133732 463 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
ChmQ9QXG2 1700011I03Rik-204ENSMUST00000135806 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
ChmQ9QXG2 4931413K12Rik-201ENSMUST00000142068 1282 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
ChmQ9QXG2 4933427D06Rik-202ENSMUST00000153517 522 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
ChmQ9QXG2 Gm12526-201ENSMUST00000154462 615 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
ChmQ9QXG2 Gm24735-201ENSMUST00000158859 118 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
ChmQ9QXG2 Mir3471-2-201ENSMUST00000174896 102 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
ChmQ9QXG2 Gm17174-201ENSMUST00000178962 671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
ChmQ9QXG2 Prl8a6-201ENSMUST00000018392 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
ChmQ9QXG2 Ighv13-2-202ENSMUST00000183954 302 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
ChmQ9QXG2 Pkia-203ENSMUST00000193330 631 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
ChmQ9QXG2 Gm37729-201ENSMUST00000194761 1172 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
ChmQ9QXG2 A930028O11Rik-201ENSMUST00000197219 1108 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
ChmQ9QXG2 U90926-202ENSMUST00000201332 524 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
ChmQ9QXG2 Gm44196-202ENSMUST00000204186 812 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
ChmQ9QXG2 Gm45627-201ENSMUST00000210130 977 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
ChmQ9QXG2 AC172027.1-201ENSMUST00000217659 337 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
ChmQ9QXG2 Scp2d1-201ENSMUST00000028918 760 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
ChmQ9QXG2 Olfr648-201ENSMUST00000052659 951 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
ChmQ9QXG2 Olfr150-201ENSMUST00000078557 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
ChmQ9QXG2 Vmn1r196-201ENSMUST00000091735 906 ntAPPRIS P2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
ChmQ9QXG2 Fetub-202ENSMUST00000116625 1338 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
ChmQ9QXG2 1700007E05Rik-201ENSMUST00000186196 1513 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
ChmQ9QXG2 Vmn2r61-201ENSMUST00000166131 2598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
ChmQ9QXG2 Msantd4-202ENSMUST00000212075 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
ChmQ9QXG2 Vmn2r-ps21-201ENSMUST00000177115 2947 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
ChmQ9QXG2 Gm45457-201ENSMUST00000209931 3089 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
ChmQ9QXG2 Rapgef6-201ENSMUST00000094536 3372 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
ChmQ9QXG2 Mef2c-214ENSMUST00000197722 3517 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
ChmQ9QXG2 Zfp607a-202ENSMUST00000205534 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
ChmQ9QXG2 Ceacam1-201ENSMUST00000098666 3656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
ChmQ9QXG2 Gm40518-202ENSMUST00000214538 4080 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
ChmQ9QXG2 Taf1-201ENSMUST00000101341 8054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
ChmQ9QXG2 Selenoi-203ENSMUST00000145167 6803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
ChmQ9QXG2 Vmn1r201-202ENSMUST00000226330 4770 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
ChmQ9QXG2 Fancd2-208ENSMUST00000204827 4707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
ChmQ9QXG2 Olfr1264-202ENSMUST00000216616 4311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
ChmQ9QXG2 4932416K20Rik-201ENSMUST00000093229 3554 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
ChmQ9QXG2 A230028O05Rik-201ENSMUST00000181655 2793 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
ChmQ9QXG2 Vmn2r-ps130-201ENSMUST00000175853 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
ChmQ9QXG2 Vmn2r-ps129-201ENSMUST00000177509 2568 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
ChmQ9QXG2 Gm7562-201ENSMUST00000210502 2537 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
ChmQ9QXG2 Gm44039-201ENSMUST00000204192 2246 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
ChmQ9QXG2 Smc5-201ENSMUST00000087556 5683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
ChmQ9QXG2 Trp63-208ENSMUST00000115310 5366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
ChmQ9QXG2 A2ml1-201ENSMUST00000060574 4695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
ChmQ9QXG2 A2m-201ENSMUST00000032203 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
ChmQ9QXG2 Rnase4-202ENSMUST00000169895 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
ChmQ9QXG2 Cct8-203ENSMUST00000175977 1470 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
ChmQ9QXG2 Olfr734-203ENSMUST00000217152 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
ChmQ9QXG2 Ncr1-201ENSMUST00000006792 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
ChmQ9QXG2 CT025639.1-201ENSMUST00000223906 1375 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
ChmQ9QXG2 Snord65-201ENSMUST00000104269 72 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
ChmQ9QXG2 4930578G10Rik-202ENSMUST00000107984 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
ChmQ9QXG2 Gm22152-201ENSMUST00000116966 125 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
ChmQ9QXG2 Gm13858-201ENSMUST00000118862 671 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
ChmQ9QXG2 Gm13521-201ENSMUST00000118922 866 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
ChmQ9QXG2 Gm13038-201ENSMUST00000119886 459 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
ChmQ9QXG2 Gm13940-201ENSMUST00000121023 301 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
ChmQ9QXG2 1700047F07Rik-202ENSMUST00000143064 463 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
ChmQ9QXG2 Gm15642-201ENSMUST00000148057 311 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
ChmQ9QXG2 Gm15351-203ENSMUST00000153095 406 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
ChmQ9QXG2 Zfp652os-201ENSMUST00000155531 537 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
ChmQ9QXG2 Hist2h2bb-201ENSMUST00000177113 381 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
ChmQ9QXG2 Gm20738-201ENSMUST00000177666 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
ChmQ9QXG2 Gm20823-201ENSMUST00000179949 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
ChmQ9QXG2 Gm20865-202ENSMUST00000181163 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
ChmQ9QXG2 4930467D21Rik-202ENSMUST00000181724 570 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms