Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Itpr1-201ENSMUST00000032192 9870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Slc12a3-205ENSMUST00000212134 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 9230009I02Rik-201ENSMUST00000101255 1148 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Igkv6-23-201ENSMUST00000103386 369 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Gm25374-201ENSMUST00000158158 101 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Gm18849-201ENSMUST00000189861 560 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 AC157822.1-201ENSMUST00000196643 80 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Gm44265-201ENSMUST00000203631 465 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Gm45734-201ENSMUST00000211916 411 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Gm6056-201ENSMUST00000221253 488 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 AC154248.1-201ENSMUST00000222072 495 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Mylf-ps-201ENSMUST00000222174 421 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 AC105950.1-201ENSMUST00000222637 408 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 AC154633.1-201ENSMUST00000223276 449 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Olfr516-201ENSMUST00000071410 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 BC147527-201ENSMUST00000081558 504 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Cc2d2b-203ENSMUST00000207801 3730 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 5330409N07Rik-201ENSMUST00000222069 3518 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Plp1-201ENSMUST00000033800 4699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Atp8b5-202ENSMUST00000102953 2609 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Myo6-202ENSMUST00000076140 7663 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Polq-201ENSMUST00000054034 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Zscan4e-201ENSMUST00000166753 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Myo1h-205ENSMUST00000169347 3545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Inpp5d-210ENSMUST00000169754 4937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Daam1-202ENSMUST00000221317 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Gm43719-201ENSMUST00000200088 2199 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Errfi1-202ENSMUST00000073600 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Gm44215-201ENSMUST00000204910 2711 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Asph-211ENSMUST00000108339 6453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Cdh23-203ENSMUST00000105462 10592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Fbxo3-202ENSMUST00000102565 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 AC153959.1-201ENSMUST00000213617 1694 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 CT009757.6-201ENSMUST00000220661 2312 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 BC035044-201ENSMUST00000160290 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Pappa2-202ENSMUST00000159861 9518 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Aebp2-201ENSMUST00000032359 5932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Gm11984-201ENSMUST00000118142 766 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Gm22820-201ENSMUST00000157205 329 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Gm22552-201ENSMUST00000157796 337 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Mir3097-201ENSMUST00000175356 67 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Gm23799-201ENSMUST00000175559 120 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Arhgap39-209ENSMUST00000177026 371 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Gm27210-201ENSMUST00000184263 402 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Rpap3-ps1-201ENSMUST00000190928 454 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Gm5065-202ENSMUST00000207531 807 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Gm44930-201ENSMUST00000207545 489 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Gm36262-201ENSMUST00000223274 499 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Olfr771-201ENSMUST00000078914 954 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Kif9-202ENSMUST00000084952 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Smim17-202ENSMUST00000160218 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Smco3-201ENSMUST00000068293 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Eif3e-201ENSMUST00000022960 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Srl-202ENSMUST00000090500 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Gjc1-203ENSMUST00000107075 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Gm32305-201ENSMUST00000221742 1899 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Zfand4-201ENSMUST00000036503 3123 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Iars-201ENSMUST00000047363 4396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Itgae-202ENSMUST00000102537 3825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Map2-207ENSMUST00000114018 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Cep85-202ENSMUST00000121566 3748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Abca4-207ENSMUST00000141135 3606 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Bdp1-204ENSMUST00000109379 7567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Olfr1490-202ENSMUST00000213900 5165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Inpp5f-208ENSMUST00000151237 2609 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Inpp5f-203ENSMUST00000118605 3220 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 AY512915-201ENSMUST00000089303 1823 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 CT009480.2-201ENSMUST00000225152 3369 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Olfr1276-203ENSMUST00000218065 5052 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Ank3-203ENSMUST00000092431 5823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Mapk1ip1l-202ENSMUST00000166743 4542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Tmcc3-203ENSMUST00000117929 3317 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Pknox1-201ENSMUST00000097352 4172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Gm22714-201ENSMUST00000116894 78 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Gm13428-201ENSMUST00000117540 365 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Gm4789-201ENSMUST00000121708 1216 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Rpl28-ps4-201ENSMUST00000170447 377 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Ms4a12-201ENSMUST00000186228 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Gm28777-201ENSMUST00000191402 535 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Gm37375-201ENSMUST00000193859 387 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Gm37385-201ENSMUST00000195223 387 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Oaz3-204ENSMUST00000199678 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Gm42951-201ENSMUST00000199688 684 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Gm43798-201ENSMUST00000202056 394 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Gm35453-201ENSMUST00000210304 331 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Gm45473-201ENSMUST00000211452 616 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 AC154595.2-201ENSMUST00000225067 310 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 AC116591.1-201ENSMUST00000227919 351 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r11-201ENSMUST00000071304 900 ntAPPRIS P2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Gm10693-201ENSMUST00000144146 2037 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Gm37423-201ENSMUST00000194246 3342 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Myh8-202ENSMUST00000108685 2306 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Gm13040-201ENSMUST00000094521 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Lrat-201ENSMUST00000029632 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Cd36-202ENSMUST00000165232 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Gm26530-201ENSMUST00000180969 3941 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Gm37725-201ENSMUST00000193965 2125 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 AC164883.2-201ENSMUST00000227931 3815 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Ubn2-205ENSMUST00000160583 14644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Nmur2-201ENSMUST00000037682 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
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