Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 AC153729.1-201ENSMUST00000214055 2562 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Rnft1Q9DCN7 Mettl6-201ENSMUST00000055303 3946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Rnft1Q9DCN7 Aktip-204ENSMUST00000120426 1687 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Rnft1Q9DCN7 Olfr701-202ENSMUST00000166880 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Rnft1Q9DCN7 Ccl20-201ENSMUST00000027351 1417 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Rnft1Q9DCN7 Rasgef1b-210ENSMUST00000209346 3028 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Rnft1Q9DCN7 Apol10a-201ENSMUST00000060551 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Rnft1Q9DCN7 Pank1-202ENSMUST00000112460 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Rnft1Q9DCN7 Gm45073-201ENSMUST00000207688 4247 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Rnft1Q9DCN7 Gm10376-201ENSMUST00000100694 555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Rnft1Q9DCN7 Mir697-201ENSMUST00000102316 109 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Rnft1Q9DCN7 Mir760-201ENSMUST00000103257 119 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Rnft1Q9DCN7 Homer1-210ENSMUST00000109497 779 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Rnft1Q9DCN7 Homer1-211ENSMUST00000109498 815 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Rnft1Q9DCN7 Gm15245-201ENSMUST00000129410 1186 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Rnft1Q9DCN7 Zfp968-203ENSMUST00000131676 1272 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Rnft1Q9DCN7 Gm24883-201ENSMUST00000158391 281 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Rnft1Q9DCN7 Tmbim6-203ENSMUST00000159531 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Rnft1Q9DCN7 Gm17217-201ENSMUST00000166613 469 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Rnft1Q9DCN7 Gm18191-201ENSMUST00000174624 824 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Rnft1Q9DCN7 Gm20655-201ENSMUST00000176132 473 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Rnft1Q9DCN7 Gm20797-201ENSMUST00000177894 383 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Rnft1Q9DCN7 Gm27401-201ENSMUST00000184052 173 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Rnft1Q9DCN7 Gm27159-201ENSMUST00000185132 432 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Rnft1Q9DCN7 1700028D13Rik-202ENSMUST00000187272 675 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Rnft1Q9DCN7 Gm28117-201ENSMUST00000188472 371 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Rnft1Q9DCN7 Gm3841-201ENSMUST00000191399 451 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Rnft1Q9DCN7 Gm19231-201ENSMUST00000193212 830 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Rnft1Q9DCN7 Gm8869-201ENSMUST00000195222 947 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Rnft1Q9DCN7 4930597L12Rik-201ENSMUST00000196286 911 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Rnft1Q9DCN7 Gm26413-202ENSMUST00000198972 127 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Rnft1Q9DCN7 Gm44353-201ENSMUST00000200618 138 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Rnft1Q9DCN7 Gm31172-201ENSMUST00000210068 321 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Rnft1Q9DCN7 Gm7688-201ENSMUST00000212857 337 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Rnft1Q9DCN7 Olfr931-ps1-201ENSMUST00000214941 549 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Rnft1Q9DCN7 AC153955.3-201ENSMUST00000216787 646 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Rnft1Q9DCN7 Uqcrb-201ENSMUST00000021993 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Rnft1Q9DCN7 AC132237.2-201ENSMUST00000221702 1209 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Rnft1Q9DCN7 Gm46436-201ENSMUST00000221851 1294 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Rnft1Q9DCN7 Zfp874a-208ENSMUST00000225479 1092 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Rnft1Q9DCN7 Vmn1r20-201ENSMUST00000226808 912 ntAPPRIS P1 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Rnft1Q9DCN7 AC164302.1-201ENSMUST00000227036 433 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Rnft1Q9DCN7 AC154838.3-201ENSMUST00000228876 965 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Rnft1Q9DCN7 Tas2r103-201ENSMUST00000032317 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Rnft1Q9DCN7 Cypt4-201ENSMUST00000053956 629 ntAPPRIS P1 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Rnft1Q9DCN7 Gpr15-201ENSMUST00000089318 1290 ntAPPRIS P1 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Rnft1Q9DCN7 Vmn1r27-201ENSMUST00000095862 912 ntAPPRIS P2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Rnft1Q9DCN7 Olfr798-202ENSMUST00000204979 3590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Rnft1Q9DCN7 Gm30329-201ENSMUST00000211572 3077 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Rnft1Q9DCN7 Vmn1r90-209ENSMUST00000227855 7362 ntAPPRIS P2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Rnft1Q9DCN7 Gm10735-201ENSMUST00000099162 2943 ntAPPRIS P1 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Rnft1Q9DCN7 Tmem175-201ENSMUST00000063272 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Rnft1Q9DCN7 Zfp78-203ENSMUST00000207314 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Rnft1Q9DCN7 Atp13a4-202ENSMUST00000057018 4054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Rnft1Q9DCN7 Myt1l-202ENSMUST00000049784 7202 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Rnft1Q9DCN7 Atp6v0d2-201ENSMUST00000029900 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Rnft1Q9DCN7 Ndst3-201ENSMUST00000029602 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Rnft1Q9DCN7 Aadat-202ENSMUST00000209338 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Rnft1Q9DCN7 2610203C20Rik-215ENSMUST00000212373 1574 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Rnft1Q9DCN7 CT025675.1-201ENSMUST00000228171 1567 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Rnft1Q9DCN7 AY512931-201ENSMUST00000139751 2395 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.32
Rnft1Q9DCN7 Tcf7l2-209ENSMUST00000111656 3629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.32
Rnft1Q9DCN7 Arl5b-201ENSMUST00000017562 6933 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Vmn2r84-201ENSMUST00000094502 3034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Scn9a-203ENSMUST00000112354 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Psg21-202ENSMUST00000182128 2066 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Gm28240-201ENSMUST00000187560 2053 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Il15ra-210ENSMUST00000128156 1624 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Gm9403-201ENSMUST00000196299 2181 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Olfr305-202ENSMUST00000213255 3749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Olfr305-204ENSMUST00000216700 3734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Gm42930-201ENSMUST00000200872 3260 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 4930578G10Rik-202ENSMUST00000107984 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Kat6b-203ENSMUST00000112458 997 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Gm14248-201ENSMUST00000117790 544 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Gm14727-201ENSMUST00000118526 525 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Gm14645-201ENSMUST00000118597 417 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Rpl22-ps1-201ENSMUST00000118652 386 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Gm12944-201ENSMUST00000119262 463 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Gm15049-201ENSMUST00000120474 463 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Gm11446-201ENSMUST00000121319 866 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Gm14721-201ENSMUST00000121381 525 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Gm16129-201ENSMUST00000152628 486 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Gm13017-201ENSMUST00000156409 400 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 4931403E22Rik-201ENSMUST00000177048 668 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Gm26692-201ENSMUST00000180428 688 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Gm28918-201ENSMUST00000188822 699 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Gm8883-204ENSMUST00000189680 699 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 1700020D05Rik-201ENSMUST00000189704 1021 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Gm8101-201ENSMUST00000192796 478 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Gm2429-201ENSMUST00000194635 586 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Gm44971-201ENSMUST00000206192 337 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Gm44869-201ENSMUST00000208836 357 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Gm7706-201ENSMUST00000209946 388 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Olfr928-ps1-201ENSMUST00000213313 237 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Olfr1251-203ENSMUST00000214750 1040 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 AC142113.2-201ENSMUST00000217425 748 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 Cyp3a61-ps1-201ENSMUST00000218470 592 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 CT009742.1-201ENSMUST00000222507 702 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Rnft1Q9DCN7 CT025639.2-201ENSMUST00000224440 1220 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.3 ms