Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Rps13-ps6-201ENSMUST00000120038 428 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Rnf6Q9DBU5 Gm13735-201ENSMUST00000120217 670 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Rnf6Q9DBU5 Gm12630-201ENSMUST00000121575 784 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Rnf6Q9DBU5 2210409E12Rik-201ENSMUST00000122062 346 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Rnf6Q9DBU5 Gm16224-201ENSMUST00000127711 412 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rnf6Q9DBU5 Gm24545-201ENSMUST00000158651 85 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Rnf6Q9DBU5 Gm5861-201ENSMUST00000168407 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rnf6Q9DBU5 Rsl24d1-204ENSMUST00000169399 841 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rnf6Q9DBU5 Gm23810-201ENSMUST00000175150 74 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Rnf6Q9DBU5 Gm24157-201ENSMUST00000175265 111 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Rnf6Q9DBU5 Gm27866-201ENSMUST00000184459 171 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Rnf6Q9DBU5 Gm28929-201ENSMUST00000185330 1193 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Rnf6Q9DBU5 Dap-202ENSMUST00000185618 388 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rnf6Q9DBU5 Gm29197-201ENSMUST00000185922 702 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Rnf6Q9DBU5 Gm29496-201ENSMUST00000189854 693 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Rnf6Q9DBU5 Gm29141-201ENSMUST00000190357 882 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Rnf6Q9DBU5 Gm17918-201ENSMUST00000205315 574 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Rnf6Q9DBU5 Gm31812-201ENSMUST00000210323 1170 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rnf6Q9DBU5 AC164881.1-201ENSMUST00000215648 664 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rnf6Q9DBU5 Akr1c13-201ENSMUST00000021634 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rnf6Q9DBU5 Gm40685-201ENSMUST00000217861 580 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rnf6Q9DBU5 AC113204.1-203ENSMUST00000219475 375 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rnf6Q9DBU5 CT030705.2-201ENSMUST00000225301 556 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Rnf6Q9DBU5 CT025667.1-201ENSMUST00000225872 382 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Rnf6Q9DBU5 CT030238.3-201ENSMUST00000227352 875 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Rnf6Q9DBU5 Vmn1r78-201ENSMUST00000078039 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rnf6Q9DBU5 Olfr1224-ps1-202ENSMUST00000099793 1212 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rnf6Q9DBU5 Etl4-202ENSMUST00000066509 7197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rnf6Q9DBU5 Gm37107-201ENSMUST00000195326 2552 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Rnf6Q9DBU5 Gm10555-201ENSMUST00000193178 1791 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Rnf6Q9DBU5 Gm21284-201ENSMUST00000205532 3736 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rnf6Q9DBU5 Gm43335-201ENSMUST00000198299 3276 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Rnf6Q9DBU5 Lilrb4a-201ENSMUST00000217706 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rnf6Q9DBU5 Pole-201ENSMUST00000007296 7163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rnf6Q9DBU5 Gm18701-201ENSMUST00000188281 1536 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Rnf6Q9DBU5 Olfr119-201ENSMUST00000080483 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rnf6Q9DBU5 Gm37877-201ENSMUST00000191630 2709 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
Rnf6Q9DBU5 C130075A20Rik-201ENSMUST00000198178 4176 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
Rnf6Q9DBU5 Kif4-ps-201ENSMUST00000184686 3665 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
Rnf6Q9DBU5 Nmur2-201ENSMUST00000037682 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Rnf6Q9DBU5 Srrm4os-201ENSMUST00000126959 3360 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Rnf6Q9DBU5 Adam28-202ENSMUST00000111072 3025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Rnf6Q9DBU5 Gabpb2-204ENSMUST00000107209 8357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Rnf6Q9DBU5 Zfp874a-202ENSMUST00000075255 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rnf6Q9DBU5 Dnah10-203ENSMUST00000141137 13862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rnf6Q9DBU5 A430110C17Rik-201ENSMUST00000195666 4348 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Rnf6Q9DBU5 Ccdc32-202ENSMUST00000110833 732 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rnf6Q9DBU5 Gm12135-201ENSMUST00000119170 466 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Rnf6Q9DBU5 Gm14612-201ENSMUST00000121522 881 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Rnf6Q9DBU5 Gm2200-201ENSMUST00000124814 764 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rnf6Q9DBU5 Gm2117-201ENSMUST00000130478 764 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rnf6Q9DBU5 Gm2101-202ENSMUST00000131997 764 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rnf6Q9DBU5 Gm13746-201ENSMUST00000133981 605 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rnf6Q9DBU5 Gm2165-203ENSMUST00000137981 764 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rnf6Q9DBU5 Gm3669-204ENSMUST00000140946 764 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rnf6Q9DBU5 Airn-202ENSMUST00000159731 435 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rnf6Q9DBU5 Obox4-ps30-201ENSMUST00000176032 948 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Rnf6Q9DBU5 Gm20691-201ENSMUST00000176889 333 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Rnf6Q9DBU5 Gm5345-201ENSMUST00000183076 1014 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Rnf6Q9DBU5 Trav6d-4-202ENSMUST00000183820 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rnf6Q9DBU5 Mir7033-201ENSMUST00000184259 81 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Rnf6Q9DBU5 1700016L21Rik-201ENSMUST00000187497 394 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rnf6Q9DBU5 Gm29383-201ENSMUST00000188284 480 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Rnf6Q9DBU5 Gm28528-201ENSMUST00000188560 857 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rnf6Q9DBU5 Gm7867-201ENSMUST00000189856 546 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Rnf6Q9DBU5 Gm10640-202ENSMUST00000190947 1134 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rnf6Q9DBU5 4930533L02Rik-201ENSMUST00000194425 1160 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Rnf6Q9DBU5 Gm43546-201ENSMUST00000196721 943 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Rnf6Q9DBU5 Gm42543-201ENSMUST00000198756 353 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rnf6Q9DBU5 Gm43599-201ENSMUST00000202680 528 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rnf6Q9DBU5 Gm42713-201ENSMUST00000202709 945 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Rnf6Q9DBU5 Gm45136-201ENSMUST00000205793 943 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Rnf6Q9DBU5 Gm4585-201ENSMUST00000207218 452 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Rnf6Q9DBU5 Gm45307-201ENSMUST00000211122 751 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rnf6Q9DBU5 AC102582.2-201ENSMUST00000214658 1137 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rnf6Q9DBU5 AC116589.2-201ENSMUST00000220469 478 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rnf6Q9DBU5 Gm35619-201ENSMUST00000222548 600 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Rnf6Q9DBU5 AC131029.2-203ENSMUST00000228116 1244 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Rnf6Q9DBU5 Mir138-2-201ENSMUST00000083578 71 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Rnf6Q9DBU5 Olfr1278-203ENSMUST00000213727 6744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rnf6Q9DBU5 Ccdc191-203ENSMUST00000132859 3779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rnf6Q9DBU5 Myt1l-202ENSMUST00000049784 7202 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rnf6Q9DBU5 Rrh-201ENSMUST00000029648 1506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rnf6Q9DBU5 Olfr1220-203ENSMUST00000213288 4223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rnf6Q9DBU5 Gm15448-205ENSMUST00000189095 1905 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rnf6Q9DBU5 BC080695-201ENSMUST00000105765 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rnf6Q9DBU5 Pcdh15-217ENSMUST00000134009 3300 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rnf6Q9DBU5 Gm44661-201ENSMUST00000208830 3503 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Rnf6Q9DBU5 Gm45084-201ENSMUST00000207096 1957 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnf6Q9DBU5 5330413P13Rik-203ENSMUST00000150466 2173 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnf6Q9DBU5 Vmn1r57-204ENSMUST00000228062 2365 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnf6Q9DBU5 Dapp1-203ENSMUST00000136613 2950 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnf6Q9DBU5 Itih5l-ps-201ENSMUST00000145639 3964 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnf6Q9DBU5 Ezh1-203ENSMUST00000107285 4193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnf6Q9DBU5 Gm44194-201ENSMUST00000204222 3229 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnf6Q9DBU5 4933400F21Rik-203ENSMUST00000187295 2633 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnf6Q9DBU5 Gm37090-201ENSMUST00000195694 4105 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnf6Q9DBU5 BC064078-202ENSMUST00000131176 2299 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnf6Q9DBU5 1700015I17Rik-201ENSMUST00000209585 2099 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnf6Q9DBU5 Gm28112-201ENSMUST00000190898 1875 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms