Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN4

Rhobtb3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb3Q9CTN4 Tcf4-202ENSMUST00000078486 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rhobtb3Q9CTN4 Satb1-214ENSMUST00000176669 4407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rhobtb3Q9CTN4 4921539E11Rik-201ENSMUST00000030245 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rhobtb3Q9CTN4 Asb4-201ENSMUST00000043294 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rhobtb3Q9CTN4 Slc17a3-204ENSMUST00000166467 4336 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rhobtb3Q9CTN4 Olfr846-202ENSMUST00000214810 4342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rhobtb3Q9CTN4 Aox1-201ENSMUST00000001027 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rhobtb3Q9CTN4 Mef2c-228ENSMUST00000199450 2862 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rhobtb3Q9CTN4 1700015I17Rik-201ENSMUST00000209585 2099 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rhobtb3Q9CTN4 Gm8281-201ENSMUST00000100893 612 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rhobtb3Q9CTN4 H2al2a-201ENSMUST00000105001 542 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rhobtb3Q9CTN4 Gm14904-201ENSMUST00000117067 335 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Rhobtb3Q9CTN4 Gm11198-201ENSMUST00000119771 974 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Rhobtb3Q9CTN4 1700026D11Rik-203ENSMUST00000144501 535 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rhobtb3Q9CTN4 Gm11940-201ENSMUST00000153599 417 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rhobtb3Q9CTN4 Gm9672-201ENSMUST00000166437 425 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Rhobtb3Q9CTN4 Gm20429-202ENSMUST00000174168 820 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rhobtb3Q9CTN4 Gm8237-202ENSMUST00000178594 447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rhobtb3Q9CTN4 Fam240b-201ENSMUST00000180282 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rhobtb3Q9CTN4 Gm26654-201ENSMUST00000180455 256 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rhobtb3Q9CTN4 Platr5-202ENSMUST00000181016 479 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rhobtb3Q9CTN4 Gm27207-201ENSMUST00000184995 878 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rhobtb3Q9CTN4 Gm8883-202ENSMUST00000188258 545 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rhobtb3Q9CTN4 Gm5103-201ENSMUST00000192081 1086 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rhobtb3Q9CTN4 Gm30667-201ENSMUST00000193120 870 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rhobtb3Q9CTN4 1700054O19Rik-201ENSMUST00000193604 868 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Rhobtb3Q9CTN4 Gm2861-201ENSMUST00000199885 666 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rhobtb3Q9CTN4 Ndufa4-204ENSMUST00000204714 452 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rhobtb3Q9CTN4 Gm35021-202ENSMUST00000210289 961 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rhobtb3Q9CTN4 AC164550.1-201ENSMUST00000217821 1066 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Rhobtb3Q9CTN4 Gm32235-202ENSMUST00000220286 898 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rhobtb3Q9CTN4 Gm36756-201ENSMUST00000222011 1214 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rhobtb3Q9CTN4 9230112D13Rik-201ENSMUST00000022325 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rhobtb3Q9CTN4 3300002A11Rik-201ENSMUST00000046994 654 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rhobtb3Q9CTN4 BC147527-201ENSMUST00000081558 504 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rhobtb3Q9CTN4 Olfr1416-201ENSMUST00000086837 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rhobtb3Q9CTN4 Gm30329-201ENSMUST00000211572 3077 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rhobtb3Q9CTN4 4933430H16Rik-201ENSMUST00000209078 1319 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rhobtb3Q9CTN4 CT030185.2-201ENSMUST00000222614 1310 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Rhobtb3Q9CTN4 Gm7690-201ENSMUST00000190885 1399 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Rhobtb3Q9CTN4 G6pd2-201ENSMUST00000053876 2348 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rhobtb3Q9CTN4 Cts3-201ENSMUST00000054702 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rhobtb3Q9CTN4 Sh2d1b2-202ENSMUST00000162752 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rhobtb3Q9CTN4 Nck1-201ENSMUST00000112874 1513 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rhobtb3Q9CTN4 Gm16123-201ENSMUST00000118647 1517 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Rhobtb3Q9CTN4 Slc25a53-214ENSMUST00000171738 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rhobtb3Q9CTN4 4930550L24Rik-202ENSMUST00000118305 1684 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rhobtb3Q9CTN4 4931406B18Rik-203ENSMUST00000163619 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rhobtb3Q9CTN4 Gm20706-201ENSMUST00000175985 2023 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rhobtb3Q9CTN4 Trip12-206ENSMUST00000186465 9590 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rhobtb3Q9CTN4 Pcdh15-215ENSMUST00000131321 6926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rhobtb3Q9CTN4 Vps8-207ENSMUST00000122235 2521 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rhobtb3Q9CTN4 4930516K23Rik-201ENSMUST00000074064 6133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp420-201ENSMUST00000057652 2744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rhobtb3Q9CTN4 Plch1-210ENSMUST00000162269 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rhobtb3Q9CTN4 Nfib-202ENSMUST00000064770 8429 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rhobtb3Q9CTN4 Gm44677-201ENSMUST00000209151 3739 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rhobtb3Q9CTN4 Gm14870-201ENSMUST00000118414 156 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rhobtb3Q9CTN4 Olfr1063-ps1-201ENSMUST00000118807 942 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rhobtb3Q9CTN4 Rpl36-ps7-201ENSMUST00000119462 315 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rhobtb3Q9CTN4 Gm16420-201ENSMUST00000120258 856 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rhobtb3Q9CTN4 Halr1-201ENSMUST00000125374 391 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rhobtb3Q9CTN4 1700028P15Rik-202ENSMUST00000139894 856 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rhobtb3Q9CTN4 Gm11423-202ENSMUST00000152784 686 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rhobtb3Q9CTN4 Gm17555-201ENSMUST00000164042 1113 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rhobtb3Q9CTN4 Gm17066-202ENSMUST00000165350 1113 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rhobtb3Q9CTN4 Gm8298-201ENSMUST00000179799 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rhobtb3Q9CTN4 Gm28739-201ENSMUST00000185415 696 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rhobtb3Q9CTN4 Gm28219-201ENSMUST00000185452 696 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rhobtb3Q9CTN4 Gm28542-201ENSMUST00000185545 696 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rhobtb3Q9CTN4 Gm28303-201ENSMUST00000185642 747 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rhobtb3Q9CTN4 Gm29244-201ENSMUST00000185825 696 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rhobtb3Q9CTN4 Gm29437-201ENSMUST00000185865 696 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rhobtb3Q9CTN4 Gm29412-201ENSMUST00000185869 696 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rhobtb3Q9CTN4 Gm28910-201ENSMUST00000185921 696 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rhobtb3Q9CTN4 Gm28812-201ENSMUST00000185963 696 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rhobtb3Q9CTN4 Gm29468-201ENSMUST00000185978 696 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rhobtb3Q9CTN4 Gm28335-201ENSMUST00000186204 696 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rhobtb3Q9CTN4 Gm28854-201ENSMUST00000186218 696 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rhobtb3Q9CTN4 Gm28636-201ENSMUST00000186353 696 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rhobtb3Q9CTN4 Gm28452-201ENSMUST00000186623 696 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rhobtb3Q9CTN4 Gm29298-201ENSMUST00000186704 696 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rhobtb3Q9CTN4 Gm28185-201ENSMUST00000186815 694 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rhobtb3Q9CTN4 Gm28227-201ENSMUST00000186862 696 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rhobtb3Q9CTN4 Gm28796-201ENSMUST00000186905 696 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rhobtb3Q9CTN4 Gm29659-201ENSMUST00000187063 696 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rhobtb3Q9CTN4 Gm28473-201ENSMUST00000187325 696 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rhobtb3Q9CTN4 Gm28558-201ENSMUST00000187373 696 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rhobtb3Q9CTN4 Gm28682-201ENSMUST00000187430 696 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rhobtb3Q9CTN4 Gm28738-201ENSMUST00000187480 696 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rhobtb3Q9CTN4 Gm28949-201ENSMUST00000187805 696 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rhobtb3Q9CTN4 Gm28773-201ENSMUST00000187925 696 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rhobtb3Q9CTN4 Gm29319-201ENSMUST00000188060 696 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rhobtb3Q9CTN4 Gm29422-201ENSMUST00000188062 694 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rhobtb3Q9CTN4 Gm28734-201ENSMUST00000188104 696 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rhobtb3Q9CTN4 Gm28787-201ENSMUST00000188357 696 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rhobtb3Q9CTN4 Gm29312-201ENSMUST00000188724 696 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rhobtb3Q9CTN4 Gm29451-201ENSMUST00000188862 696 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rhobtb3Q9CTN4 Gm29637-201ENSMUST00000188877 696 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rhobtb3Q9CTN4 Gm29033-201ENSMUST00000189114 696 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms