Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN9

Lrrc9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,456 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc9Q8CDN9 Igkv19-93-201ENSMUST00000183936 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
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Lrrc9Q8CDN9 Gm5110-201ENSMUST00000203122 1063 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Lrrc9Q8CDN9 4930480K02Rik-201ENSMUST00000203679 1054 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Lrrc9Q8CDN9 1190001M18Rik-201ENSMUST00000215937 1270 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Lrrc9Q8CDN9 AC138284.1-201ENSMUST00000214258 3236 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Lrrc9Q8CDN9 Pcbp2-202ENSMUST00000078404 2829 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lrrc9Q8CDN9 Accs-203ENSMUST00000111246 3950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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Lrrc9Q8CDN9 Gm26981-201ENSMUST00000182453 3169 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Lrrc9Q8CDN9 Ick-202ENSMUST00000044551 6560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Lrrc9Q8CDN9 St6galnac3-204ENSMUST00000200397 8169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Lrrc9Q8CDN9 1700015I17Rik-201ENSMUST00000209585 2099 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Lrrc9Q8CDN9 Fshr-201ENSMUST00000035701 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
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Lrrc9Q8CDN9 Olfr452-203ENSMUST00000215719 2728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Lrrc9Q8CDN9 Stat4-201ENSMUST00000027277 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Lrrc9Q8CDN9 Nemp1-201ENSMUST00000048099 6002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Lrrc9Q8CDN9 Eif2ak4-206ENSMUST00000110874 5298 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Lrrc9Q8CDN9 Gm28993-201ENSMUST00000186236 1499 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
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Lrrc9Q8CDN9 F830112A20Rik-201ENSMUST00000194249 3552 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
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Lrrc9Q8CDN9 Atp6v1c2-207ENSMUST00000156727 1279 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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Lrrc9Q8CDN9 1700108J01Rik-201ENSMUST00000187423 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Lrrc9Q8CDN9 Gm28777-201ENSMUST00000191402 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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Lrrc9Q8CDN9 Sorbs1-211ENSMUST00000224667 4313 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Lrrc9Q8CDN9 Saa4-201ENSMUST00000006952 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Lrrc9Q8CDN9 Kcnc2-202ENSMUST00000218445 4033 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Lrrc9Q8CDN9 Umodl1-202ENSMUST00000066981 4662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Lrrc9Q8CDN9 1810011H11Rik-201ENSMUST00000039191 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Lrrc9Q8CDN9 Selp-205ENSMUST00000162746 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Lrrc9Q8CDN9 Gm33843-201ENSMUST00000219313 1637 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Lrrc9Q8CDN9 Zfp638-202ENSMUST00000113835 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Lrrc9Q8CDN9 Ebpl-201ENSMUST00000022494 10092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Lrrc9Q8CDN9 Alkbh8-206ENSMUST00000212294 2584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Lrrc9Q8CDN9 5330411O13Rik-201ENSMUST00000205759 1544 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Lrrc9Q8CDN9 Bbs12-202ENSMUST00000108121 2348 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Lrrc9Q8CDN9 Spaca7-201ENSMUST00000010579 762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Lrrc9Q8CDN9 Gm8009-201ENSMUST00000191672 436 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Lrrc9Q8CDN9 Gm37265-201ENSMUST00000191698 885 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Lrrc9Q8CDN9 Gm35013-201ENSMUST00000197218 832 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Lrrc9Q8CDN9 Gm42437-201ENSMUST00000197263 923 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Lrrc9Q8CDN9 Gm42504-201ENSMUST00000198312 525 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Lrrc9Q8CDN9 Spaca7-202ENSMUST00000209428 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Lrrc9Q8CDN9 AC170086.2-201ENSMUST00000224733 803 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Lrrc9Q8CDN9 AC154583.1-201ENSMUST00000224788 655 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.6 ms