Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

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Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Gm9874-202ENSMUST00000194957 1464 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Gm44436-201ENSMUST00000204200 1494 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Ptprz1-206ENSMUST00000202579 6871 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 4632404H12Rik-202ENSMUST00000195940 4671 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Dnajb4-202ENSMUST00000050073 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Gm38697-201ENSMUST00000198061 1746 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 AC139758.3-201ENSMUST00000226853 2704 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Bmi1-202ENSMUST00000051929 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Tpp1-201ENSMUST00000033184 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Plce1-201ENSMUST00000169713 9439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Dthd1-201ENSMUST00000170704 2427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Rabgap1-201ENSMUST00000061179 4967 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Trav6-2-201ENSMUST00000103573 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Gstm6-203ENSMUST00000106683 745 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Prl8a2-202ENSMUST00000110363 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Gm7821-201ENSMUST00000117111 788 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Gm15310-201ENSMUST00000117891 372 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Gm8312-201ENSMUST00000119380 618 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Gm15171-201ENSMUST00000122191 334 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Tbata-208ENSMUST00000143207 982 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Sox5it-201ENSMUST00000144026 1207 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Gm11940-201ENSMUST00000153599 417 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Esp36-201ENSMUST00000172814 1117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Tnfsf10-202ENSMUST00000174840 989 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Esp36-202ENSMUST00000177882 1117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Trav6d-5-201ENSMUST00000180687 338 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Prl8a2-201ENSMUST00000018403 939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Gm28117-201ENSMUST00000188472 371 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 1700120K04Rik-201ENSMUST00000191038 546 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Gm38200-201ENSMUST00000192083 2111 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Gm37679-201ENSMUST00000192868 1192 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Gm8182-201ENSMUST00000197863 769 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Gm18781-201ENSMUST00000211252 924 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 AC122486.1-201ENSMUST00000221562 196 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Gm7240-202ENSMUST00000221961 353 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 AC115304.1-202ENSMUST00000226850 837 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Cst8-201ENSMUST00000028931 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Olfr299-201ENSMUST00000057734 993 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Olfr765-201ENSMUST00000071559 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Mup14-202ENSMUST00000075206 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Boll-201ENSMUST00000087585 882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Tdrkh-207ENSMUST00000197901 2652 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Hibch-201ENSMUST00000044478 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 AC156636.2-201ENSMUST00000218845 4557 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 AC135669.2-201ENSMUST00000215636 4958 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 2610001J05Rik-201ENSMUST00000139231 3177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 6430584L05Rik-201ENSMUST00000204412 3151 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Mrgprx2-202ENSMUST00000186394 1930 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Gm38178-201ENSMUST00000194502 2471 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Smc1a-201ENSMUST00000045312 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Zfp638-203ENSMUST00000113836 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Gm28407-201ENSMUST00000185630 1497 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Gm28108-201ENSMUST00000186747 1497 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Gm28218-202ENSMUST00000186782 1498 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Gm29511-201ENSMUST00000187580 1497 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Gm28367-201ENSMUST00000187942 1496 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Gm29549-202ENSMUST00000189569 1497 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Matr3-205ENSMUST00000186796 1854 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Gm45949-201ENSMUST00000221550 1895 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Gm38263-201ENSMUST00000195879 3059 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Slc26a5-202ENSMUST00000115176 2768 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 4933400F21Rik-203ENSMUST00000187295 2633 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Pigc-202ENSMUST00000111594 3290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Olfr1396-201ENSMUST00000060398 3946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Olfr1390-202ENSMUST00000215014 2875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Ceacam1-203ENSMUST00000098669 2873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 AC124516.2-201ENSMUST00000221455 1829 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 AC165080.3-201ENSMUST00000217162 3116 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Gm26861-201ENSMUST00000180807 5278 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Clrn3-201ENSMUST00000053716 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Gm25724-201ENSMUST00000104531 117 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Rpl31-ps10-201ENSMUST00000116034 378 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Rpl31-ps11-201ENSMUST00000119898 377 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Rpl31-ps12-201ENSMUST00000119957 375 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Gm14489-201ENSMUST00000120868 901 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Gm5834-201ENSMUST00000126680 1026 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Gm21970-201ENSMUST00000160764 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Gm5726-201ENSMUST00000173886 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Gm8677-201ENSMUST00000174637 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Gm24157-201ENSMUST00000175265 111 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Vmn2r-ps131-201ENSMUST00000176094 1046 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Obox1-206ENSMUST00000181001 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Rpl31-ps8-201ENSMUST00000181935 378 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 1110008L16Rik-206ENSMUST00000184980 888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Gm29141-201ENSMUST00000190357 882 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 1700123O21Rik-201ENSMUST00000190515 677 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Gm38177-201ENSMUST00000192213 1040 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Rpl31-206ENSMUST00000195123 356 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Gm44342-201ENSMUST00000196874 129 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Igkv4-83-201ENSMUST00000196933 334 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Gm44383-201ENSMUST00000198940 129 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Gm43599-201ENSMUST00000202680 528 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Gm8479-201ENSMUST00000203825 718 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Gm5086-201ENSMUST00000210022 1297 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 AC113082.2-201ENSMUST00000215876 756 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 AC163354.1-207ENSMUST00000221270 1243 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 AC154248.1-201ENSMUST00000222072 495 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Gm4808-201ENSMUST00000222283 1203 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Gm2139-201ENSMUST00000222569 1075 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 AC123533.2-201ENSMUST00000228176 375 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
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