Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 Gm8206-203ENSMUST00000171428 997 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 Gm3500-202ENSMUST00000178058 609 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 1700003H04Rik-206ENSMUST00000180162 1086 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 Gm27468-201ENSMUST00000183577 106 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 Klk1b7-ps-202ENSMUST00000183762 619 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 Ly6c2-203ENSMUST00000188214 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 Eif4e-202ENSMUST00000196990 856 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 Gm43400-201ENSMUST00000197294 1254 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 4933432G23Rik-201ENSMUST00000213675 840 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 Olfr1092-ps1-201ENSMUST00000216544 398 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 AC148328.2-201ENSMUST00000216960 262 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 AC153544.1-201ENSMUST00000217988 400 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 AC163621.1-201ENSMUST00000220695 379 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 AC117797.1-201ENSMUST00000223977 695 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 1700003H04Rik-201ENSMUST00000047110 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 AA467197-201ENSMUST00000047498 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 n-R5s95-201ENSMUST00000082684 118 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 Olfr1281-201ENSMUST00000090326 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 Gm3512-201ENSMUST00000090663 441 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 Olfr143-201ENSMUST00000093865 942 ntAPPRIS P2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 Gm10770-201ENSMUST00000099418 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 Psd4-210ENSMUST00000166388 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 Vmn2r88-201ENSMUST00000022438 2574 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 Il15ra-210ENSMUST00000128156 1624 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 Gm38416-201ENSMUST00000209648 3565 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 Cd84-203ENSMUST00000135386 3434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 Pomk-201ENSMUST00000061850 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 AC163660.4-201ENSMUST00000224983 2171 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 Serpind1-201ENSMUST00000023450 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 Oscp1-201ENSMUST00000035497 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 Chil3-201ENSMUST00000063062 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 Gm45805-201ENSMUST00000212695 2066 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 U2surp-209ENSMUST00000217176 3111 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 Zfp638-203ENSMUST00000113836 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 AC165260.6-206ENSMUST00000223884 3698 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 Dpcr1-201ENSMUST00000095467 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 Gcnt2-202ENSMUST00000069958 3929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 Lcp1-206ENSMUST00000131802 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 Ampd1-201ENSMUST00000090715 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 Cdk5rap2-206ENSMUST00000144099 11847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 Gm44652-201ENSMUST00000208648 2854 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 Vwde-201ENSMUST00000054530 3979 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 Gm20815-201ENSMUST00000115496 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 Snord88a-201ENSMUST00000116723 90 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 Olfr602-ps1-201ENSMUST00000118403 948 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 Gm12713-201ENSMUST00000118404 764 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 Gm14745-201ENSMUST00000118480 1096 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 Gm15311-201ENSMUST00000119682 282 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 Gm15305-201ENSMUST00000120354 288 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 Gm12978-201ENSMUST00000121250 522 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 Gm12001-201ENSMUST00000121727 913 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 Gm15130-201ENSMUST00000132464 663 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 Gm12160-201ENSMUST00000146372 342 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 4933407I08Rik-201ENSMUST00000151215 1294 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 Gm25722-201ENSMUST00000157498 279 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 Gm16333-201ENSMUST00000161416 318 ntTSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 Gm3585-201ENSMUST00000173438 875 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 Gm20685-201ENSMUST00000176654 489 ntTSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 6530403H02Rik-203ENSMUST00000183168 843 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 Gm21812-202ENSMUST00000188908 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 Gm28846-201ENSMUST00000189161 368 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 Lax1-202ENSMUST00000189524 628 ntTSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 9530003O04Rik-201ENSMUST00000192663 908 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 Gm37439-201ENSMUST00000193150 856 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 Gm38232-201ENSMUST00000193602 411 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
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Hoxa13Q62424 A730082K24Rik-201ENSMUST00000205365 465 ntTSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
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Hoxa13Q62424 Gm18043-201ENSMUST00000216741 739 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 Olfr602-ps1-202ENSMUST00000218213 1169 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 Olfr809-203ENSMUST00000218237 1100 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 Hmgb1-ps11-201ENSMUST00000221749 621 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 AC154558.1-201ENSMUST00000222278 415 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 Gm9315-201ENSMUST00000222696 908 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 Gm7745-202ENSMUST00000222914 567 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 AC163660.1-201ENSMUST00000223696 818 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 AC154640.1-202ENSMUST00000227828 496 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 AC132833.4-201ENSMUST00000228313 203 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 Scp2d1-201ENSMUST00000028918 760 ntAPPRIS P1 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 Olfr809-201ENSMUST00000059891 1100 ntAPPRIS P1 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 Olfr1501-201ENSMUST00000073966 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 Vmn1r37-201ENSMUST00000077482 909 ntAPPRIS P2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 Zfp850-201ENSMUST00000099111 941 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 Srek1ip1-201ENSMUST00000022230 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 Rgs22-203ENSMUST00000172831 4006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 AC164978.1-201ENSMUST00000228608 4011 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 Gm44553-201ENSMUST00000206316 2037 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 Gm43410-201ENSMUST00000197510 2234 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 4930511E03Rik-201ENSMUST00000203778 2232 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 Cmtr2-201ENSMUST00000056972 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 Gm6150-202ENSMUST00000219888 2977 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 Fam19a1-201ENSMUST00000075080 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 Slc17a3-204ENSMUST00000166467 4336 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 Olfr1160-202ENSMUST00000215457 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 Cyp4a10-202ENSMUST00000094886 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 Ppp1r9a-212ENSMUST00000177456 3975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 Gm29571-201ENSMUST00000191547 1909 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 Gm14540-201ENSMUST00000138298 3261 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
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