Protein–RNA interactions for Protein: P56183

Rrp1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1P56183 Gm28663-201ENSMUST00000186567 1498 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rrp1P56183 Gm28470-201ENSMUST00000186912 1498 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rrp1P56183 Gm28971-201ENSMUST00000187506 1498 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rrp1P56183 Gm28733-202ENSMUST00000187597 1498 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rrp1P56183 Gm28820-201ENSMUST00000188530 1498 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rrp1P56183 Gm29606-202ENSMUST00000188564 1498 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rrp1P56183 Gm29225-202ENSMUST00000188647 1498 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rrp1P56183 Gm28152-201ENSMUST00000188694 1498 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rrp1P56183 Gm28771-202ENSMUST00000189399 1499 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rrp1P56183 Gm28741-201ENSMUST00000189417 1498 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rrp1P56183 Gm28540-202ENSMUST00000189573 1498 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rrp1P56183 Gm29122-203ENSMUST00000189609 1498 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rrp1P56183 Gm28613-201ENSMUST00000189627 1498 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rrp1P56183 Gm28816-202ENSMUST00000189686 1498 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rrp1P56183 Gm29584-202ENSMUST00000190181 1498 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rrp1P56183 Gm28293-202ENSMUST00000190417 1498 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rrp1P56183 Gm28463-203ENSMUST00000191085 1498 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rrp1P56183 Gm28124-202ENSMUST00000191099 1498 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rrp1P56183 Gm29217-202ENSMUST00000191270 1498 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rrp1P56183 Gm28332-203ENSMUST00000191389 1498 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rrp1P56183 Gm37346-201ENSMUST00000191665 1498 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rrp1P56183 Gm37870-201ENSMUST00000192349 1499 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rrp1P56183 Gm37467-202ENSMUST00000192785 1499 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rrp1P56183 Gm37454-202ENSMUST00000193918 1498 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rrp1P56183 Gm38371-202ENSMUST00000193996 1498 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rrp1P56183 Gm37434-203ENSMUST00000194239 1498 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rrp1P56183 Gm37840-202ENSMUST00000194805 1498 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rrp1P56183 Gm37687-203ENSMUST00000195020 1498 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rrp1P56183 Gm37252-201ENSMUST00000195063 1499 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rrp1P56183 Gm38013-202ENSMUST00000195453 1499 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rrp1P56183 Gm37071-203ENSMUST00000195814 1498 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rrp1P56183 Gm37286-201ENSMUST00000195885 1499 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rrp1P56183 Matr3-205ENSMUST00000186796 1854 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rrp1P56183 Pcmtd2-202ENSMUST00000108754 3499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rrp1P56183 Rbmy-201ENSMUST00000100360 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rrp1P56183 Gm10256-202ENSMUST00000188114 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rrp1P56183 Gm21708-203ENSMUST00000190283 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rrp1P56183 AC125487.2-201ENSMUST00000219810 1300 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rrp1P56183 Mrpl1-201ENSMUST00000036437 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rrp1P56183 Adgre1-201ENSMUST00000004850 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rrp1P56183 Atf2-205ENSMUST00000112010 4037 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rrp1P56183 Gm43864-201ENSMUST00000204452 4028 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rrp1P56183 Atf2-202ENSMUST00000090802 4016 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rrp1P56183 Olfr195-202ENSMUST00000216957 2077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rrp1P56183 Bbs12-201ENSMUST00000057975 2433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rrp1P56183 Gip-202ENSMUST00000103157 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rrp1P56183 Gm20730-201ENSMUST00000103301 359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rrp1P56183 Gm23437-201ENSMUST00000104036 127 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rrp1P56183 Gm13744-201ENSMUST00000118953 850 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rrp1P56183 1700061H18Rik-201ENSMUST00000139488 634 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rrp1P56183 Gm12860-201ENSMUST00000148457 957 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rrp1P56183 Gm26025-201ENSMUST00000158655 271 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rrp1P56183 Gm17022-201ENSMUST00000166415 922 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rrp1P56183 Serpina4-ps1-201ENSMUST00000166601 1287 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rrp1P56183 Pantr1-203ENSMUST00000176154 514 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rrp1P56183 1110032A03Rik-209ENSMUST00000177546 647 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rrp1P56183 Gm28502-201ENSMUST00000189781 476 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rrp1P56183 1700020G17Rik-203ENSMUST00000191286 723 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rrp1P56183 Gm22711-202ENSMUST00000197029 135 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rrp1P56183 Csde1-206ENSMUST00000197488 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rrp1P56183 Gm42464-202ENSMUST00000198111 774 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rrp1P56183 Gm44252-201ENSMUST00000204187 330 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rrp1P56183 Rps12-ps4-201ENSMUST00000208689 397 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rrp1P56183 Gm6145-202ENSMUST00000210292 787 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rrp1P56183 Elovl2-201ENSMUST00000021793 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rrp1P56183 AC122327.2-201ENSMUST00000220883 120 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rrp1P56183 AC122327.3-201ENSMUST00000221852 120 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rrp1P56183 AC166341.1-201ENSMUST00000223360 105 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rrp1P56183 Ceacam14-201ENSMUST00000023953 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rrp1P56183 Clec4a2-201ENSMUST00000032248 1261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rrp1P56183 Agl-203ENSMUST00000159742 4344 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rrp1P56183 BC064078-202ENSMUST00000131176 2299 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rrp1P56183 Lef1-203ENSMUST00000098611 2298 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rrp1P56183 Fam160a1-201ENSMUST00000094148 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rrp1P56183 Gsdme-202ENSMUST00000101405 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rrp1P56183 Poln-205ENSMUST00000202409 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rrp1P56183 Zfp78-203ENSMUST00000207314 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rrp1P56183 4930517E11Rik-201ENSMUST00000129584 1457 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rrp1P56183 Gm9871-203ENSMUST00000204837 1560 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rrp1P56183 Sspo-201ENSMUST00000043676 15148 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rrp1P56183 Ntrk3-202ENSMUST00000039438 3977 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rrp1P56183 Gm18409-201ENSMUST00000218988 2506 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rrp1P56183 Gm38156-201ENSMUST00000194601 2260 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Rrp1P56183 Vmn2r-ps34-202ENSMUST00000204750 1671 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Rrp1P56183 Gm14635-202ENSMUST00000146535 1409 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rrp1P56183 Olfr1396-204ENSMUST00000215553 4237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rrp1P56183 Gm25757-201ENSMUST00000103986 123 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Rrp1P56183 Gm25916-201ENSMUST00000104263 131 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Rrp1P56183 Gm25379-201ENSMUST00000104338 114 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Rrp1P56183 Gm25724-201ENSMUST00000104531 117 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Rrp1P56183 Stk36-203ENSMUST00000113694 629 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rrp1P56183 Gm11864-201ENSMUST00000116179 1220 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Rrp1P56183 Gm12720-201ENSMUST00000123834 472 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rrp1P56183 4933431E20Rik-206ENSMUST00000138472 483 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rrp1P56183 Gm24442-201ENSMUST00000157238 327 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Rrp1P56183 Gm24781-201ENSMUST00000157636 117 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Rrp1P56183 Gm24422-201ENSMUST00000157800 119 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Rrp1P56183 Gm23757-201ENSMUST00000158353 100 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Rrp1P56183 Gm5039-201ENSMUST00000177747 435 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rrp1P56183 Gm8332-201ENSMUST00000179468 435 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms