Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Gm11850-201ENSMUST00000119679 479 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Gm11343-201ENSMUST00000120579 599 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Olfr349-ps1-201ENSMUST00000121879 609 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Gm7546-201ENSMUST00000146119 966 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Gm17205-201ENSMUST00000168370 1207 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Gm20549-201ENSMUST00000174804 429 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Cers6-206ENSMUST00000176018 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Gm27373-201ENSMUST00000184017 184 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Gm27782-201ENSMUST00000185059 199 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Gm28807-201ENSMUST00000187799 471 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Gm44471-201ENSMUST00000197963 100 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 4930568A13Rik-201ENSMUST00000199961 1061 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Gm18422-201ENSMUST00000203663 1032 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Gm18562-201ENSMUST00000209949 915 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Gm45627-201ENSMUST00000210130 977 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Gm46311-201ENSMUST00000217971 203 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 4930503E24Rik-202ENSMUST00000219657 942 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 AC154849.2-201ENSMUST00000223781 974 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 CT025639.2-201ENSMUST00000224440 1220 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Gm24411-201ENSMUST00000083428 131 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Vmn1r198-204ENSMUST00000227167 5990 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Helz-203ENSMUST00000106746 13147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Gm28819-202ENSMUST00000187416 1335 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Olfr930-202ENSMUST00000217208 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Il18bp-201ENSMUST00000094134 1311 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Celf2-214ENSMUST00000170438 8856 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 AC121844.3-201ENSMUST00000219124 1785 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Gm39465-201ENSMUST00000213810 9813 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Itga1-201ENSMUST00000061673 10967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Gm14667-201ENSMUST00000119448 1350 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 4921534H16Rik-201ENSMUST00000162370 1392 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Olfr212-203ENSMUST00000220134 2349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Atp2b4-202ENSMUST00000112264 3324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Vmn1r90-203ENSMUST00000226510 6674 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 C530050E15Rik-201ENSMUST00000181373 3837 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 4930547M16Rik-201ENSMUST00000181590 2400 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Gm21122-201ENSMUST00000191548 3452 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Gm45457-201ENSMUST00000209931 3089 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 4933434E20Rik-201ENSMUST00000029551 3097 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Zscan18-201ENSMUST00000046245 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Gm16794-201ENSMUST00000180727 2100 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Osbpl9-214ENSMUST00000160774 2765 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Fam227b-202ENSMUST00000110448 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 4931403G20Rik-201ENSMUST00000180861 1699 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 AC130661.1-201ENSMUST00000218248 1680 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Olfr1217-204ENSMUST00000216592 3992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Fut9-201ENSMUST00000084770 12134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Iigp1-202ENSMUST00000066912 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Skint7-201ENSMUST00000055014 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Smurf2-206ENSMUST00000167787 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Adgrl2-205ENSMUST00000196526 5615 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Olfr602-ps1-201ENSMUST00000118403 948 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Gm11320-201ENSMUST00000119434 463 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Gm12525-201ENSMUST00000125412 554 ntTSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Gm2735-201ENSMUST00000136133 277 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Tmem132cos-202ENSMUST00000154361 699 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Gm15275-201ENSMUST00000154752 347 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Gm25180-201ENSMUST00000157746 115 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Trav12d-3-201ENSMUST00000177703 347 ntAPPRIS P1 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Gm27866-201ENSMUST00000184459 171 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 1700054A03Rik-201ENSMUST00000187368 780 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Gm28923-201ENSMUST00000187755 322 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Gm37349-201ENSMUST00000194205 624 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 4930597L12Rik-201ENSMUST00000196286 911 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Gm2762-203ENSMUST00000201658 1234 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Gm43122-201ENSMUST00000201752 354 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Gm21054-201ENSMUST00000203981 380 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Gm44044-201ENSMUST00000205178 1089 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
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Sh3bp1P55194 Gm18469-201ENSMUST00000208850 439 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Olfr706-201ENSMUST00000209025 1087 ntAPPRIS P1 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Ctxn3-203ENSMUST00000209786 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Gm6145-202ENSMUST00000210292 787 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
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Sh3bp1P55194 AC155266.1-201ENSMUST00000220762 904 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 AC154733.1-201ENSMUST00000221126 679 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 AC154816.1-201ENSMUST00000222688 634 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Vmn1r76-201ENSMUST00000058772 975 ntAPPRIS P2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Bglap3-201ENSMUST00000075523 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Fam47e-201ENSMUST00000082382 750 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Sry-201ENSMUST00000091178 1188 ntAPPRIS P1 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Gm13304-201ENSMUST00000098123 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 AC105407.2-201ENSMUST00000223707 3911 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Rasgrp3-202ENSMUST00000164192 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Tmem45a-201ENSMUST00000023435 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 AC153962.2-202ENSMUST00000219391 1382 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 CT025639.1-201ENSMUST00000223906 1375 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Gm13106-201ENSMUST00000119045 1443 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Gm5512-202ENSMUST00000220222 1522 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Kynu-203ENSMUST00000112826 1587 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Pum2-216ENSMUST00000178015 5874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 CT009480.2-201ENSMUST00000225152 3369 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Il1rl1-201ENSMUST00000053043 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Vmn2r61-201ENSMUST00000166131 2598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Slc9a9-201ENSMUST00000033463 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Gpr22-203ENSMUST00000176710 1772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Zfp607b-202ENSMUST00000120004 4612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Olfr312-202ENSMUST00000216407 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
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