Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Dixdc1-201ENSMUST00000034566 5709 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxc13P50207 Ccdc66-201ENSMUST00000050480 2457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Hoxc13P50207 Krba1-204ENSMUST00000114572 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Hoxc13P50207 Spag17os-202ENSMUST00000145279 3219 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Hoxc13P50207 Olfr1079-202ENSMUST00000111582 2141 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Hoxc13P50207 Gm12290-201ENSMUST00000145095 2112 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Hoxc13P50207 Cyp4a10-201ENSMUST00000058785 2109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Hoxc13P50207 Cdon-201ENSMUST00000042842 7213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Hoxc13P50207 Slc15a2-208ENSMUST00000165531 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Hoxc13P50207 Scd1-201ENSMUST00000041331 4836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Hoxc13P50207 Rab30-203ENSMUST00000107180 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Hoxc13P50207 Nusap1-201ENSMUST00000028771 3526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Hoxc13P50207 Plk4-202ENSMUST00000167556 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Hoxc13P50207 5830432E09Rik-201ENSMUST00000180693 3569 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Ighv1-19-201ENSMUST00000103505 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Gm15048-201ENSMUST00000118201 954 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Rps13-ps6-201ENSMUST00000120038 428 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Gm14489-201ENSMUST00000120868 901 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Gm12181-201ENSMUST00000121448 531 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Pcnp-204ENSMUST00000122253 792 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Gm21990-201ENSMUST00000124692 383 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 St8sia3os-203ENSMUST00000127716 667 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Gm12160-201ENSMUST00000146372 342 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Gm11963-201ENSMUST00000149826 500 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Gm23031-201ENSMUST00000157998 119 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Gm16298-201ENSMUST00000161107 420 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Gm4202-201ENSMUST00000169025 733 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Gm20685-201ENSMUST00000176654 489 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 1700120O09Rik-201ENSMUST00000177127 977 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Gm28023-201ENSMUST00000184556 60 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Gm27825-201ENSMUST00000184586 60 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Gm29508-202ENSMUST00000191414 710 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Gm43849-201ENSMUST00000201086 215 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 1700028E10Rik-204ENSMUST00000201853 767 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Fxyd4-204ENSMUST00000203433 670 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Gm18838-201ENSMUST00000204855 886 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Gm45607-201ENSMUST00000211143 678 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Mobp-206ENSMUST00000214943 435 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 AC154248.1-201ENSMUST00000222072 495 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 CT030184.2-201ENSMUST00000223064 263 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 A1cf-203ENSMUST00000224400 1204 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 CT009711.2-201ENSMUST00000225352 934 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 AC160962.1-202ENSMUST00000225859 1116 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 AC168062.1-201ENSMUST00000228048 769 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Gsta4-201ENSMUST00000034903 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Fxyd4-201ENSMUST00000005114 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Olfr933-201ENSMUST00000075680 1003 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Olfr1456-ps1-201ENSMUST00000087769 518 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Trim12a-203ENSMUST00000106839 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Pfkfb1-202ENSMUST00000112713 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Gm5702-201ENSMUST00000185629 2469 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Gm9866-203ENSMUST00000182592 8487 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Btbd3-201ENSMUST00000075410 4940 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Csde1-201ENSMUST00000029446 4318 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Olfr1155-203ENSMUST00000215903 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Prdm11-202ENSMUST00000111274 11678 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Gm6811-201ENSMUST00000169389 1533 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Cabyr-204ENSMUST00000121018 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 4933430H16Rik-201ENSMUST00000209078 1319 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Nif3l1-201ENSMUST00000087521 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Fndc3b-204ENSMUST00000195008 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Gm37107-201ENSMUST00000195326 2552 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Gm37755-201ENSMUST00000195880 2179 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Apbb2-204ENSMUST00000159786 6333 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Lars-201ENSMUST00000097590 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Tmem229b-202ENSMUST00000070174 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Plce1-201ENSMUST00000169713 9439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Wdr44-201ENSMUST00000035766 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Actl11-201ENSMUST00000085073 3993 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Gm39321-201ENSMUST00000216597 2075 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Ppfia2-203ENSMUST00000217854 8885 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Cts3-201ENSMUST00000054702 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Olfr1032-202ENSMUST00000079298 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Osbpl3-204ENSMUST00000114468 6494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Trappc8-201ENSMUST00000025177 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Mecp2-202ENSMUST00000100750 10538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Olfr1324-202ENSMUST00000215270 5679 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Skiv2l2-201ENSMUST00000022281 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Gpatch11-201ENSMUST00000170759 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Zbtb43-202ENSMUST00000095035 4925 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Ighv1-53-201ENSMUST00000103523 351 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Ighv1-69-201ENSMUST00000103539 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Gm25785-201ENSMUST00000104129 125 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Gm3476-201ENSMUST00000112742 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Gm7113-201ENSMUST00000120477 958 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Dnah2os-201ENSMUST00000124108 859 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Gm16152-201ENSMUST00000131663 872 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Gm11820-201ENSMUST00000139614 664 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Gm15322-201ENSMUST00000142621 739 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Gm24682-201ENSMUST00000158764 137 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Gm20713-201ENSMUST00000176344 435 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 4930532G15Rik-201ENSMUST00000180632 699 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 1810012K16Rik-201ENSMUST00000190830 547 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Gm29784-201ENSMUST00000196217 406 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Igkv4-83-201ENSMUST00000196933 334 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Gm16571-202ENSMUST00000203839 585 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Gm43867-201ENSMUST00000203860 525 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Gm45589-201ENSMUST00000209366 895 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Gm45732-201ENSMUST00000212460 586 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Prr9-201ENSMUST00000070284 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.4 ms