Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Olfr295-202ENSMUST00000215365 6013 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
VdrP48281 Schip1-207ENSMUST00000182997 1557 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
VdrP48281 Adh7-201ENSMUST00000090171 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.16
VdrP48281 F930017D23Rik-202ENSMUST00000213342 2141 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.16
VdrP48281 Coro2a-201ENSMUST00000030021 4112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.16
VdrP48281 Tor1aip1-210ENSMUST00000169241 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
VdrP48281 Vmn1r12-202ENSMUST00000226866 6639 ntAPPRIS P2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
VdrP48281 Nxpe4-201ENSMUST00000093853 3173 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
VdrP48281 Tdrkh-201ENSMUST00000045245 2642 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
VdrP48281 Fbxl5-203ENSMUST00000114047 2762 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
VdrP48281 Gja5-201ENSMUST00000072600 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
VdrP48281 Slirp-204ENSMUST00000161023 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
VdrP48281 Tdrkh-202ENSMUST00000166032 5692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
VdrP48281 Klhl23-201ENSMUST00000053087 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
VdrP48281 Olfr1500-205ENSMUST00000216287 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
VdrP48281 Gimap4-202ENSMUST00000090070 1804 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
VdrP48281 1700080O16Rik-201ENSMUST00000033449 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
VdrP48281 Calcr-205ENSMUST00000171613 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
VdrP48281 Mapk1ip1l-202ENSMUST00000166743 4542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
VdrP48281 Trav12n-1-201ENSMUST00000103587 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
VdrP48281 Lrrc51-205ENSMUST00000106965 743 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
VdrP48281 Gm11617-201ENSMUST00000119609 639 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
VdrP48281 Gm3275-201ENSMUST00000169145 487 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
VdrP48281 Gm6871-204ENSMUST00000171059 462 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
VdrP48281 Gm23413-201ENSMUST00000175521 125 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
VdrP48281 Obox4-ps30-201ENSMUST00000176032 948 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
VdrP48281 Trav5d-4-201ENSMUST00000179701 343 ntAPPRIS P1 BASIC7.83□□□□□ -1.16
VdrP48281 Trav5n-4-201ENSMUST00000179997 343 ntAPPRIS P1 BASIC7.83□□□□□ -1.16
VdrP48281 Gm26801-201ENSMUST00000180591 1219 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
VdrP48281 Trav12d-1-202ENSMUST00000183652 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
VdrP48281 Gm29143-201ENSMUST00000189462 201 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
VdrP48281 Gm18797-201ENSMUST00000190809 1174 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
VdrP48281 Gm43287-201ENSMUST00000197747 600 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
VdrP48281 Gm19211-201ENSMUST00000200251 1206 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
VdrP48281 Gm19590-201ENSMUST00000201551 1195 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
VdrP48281 Olfr181-203ENSMUST00000205742 1104 ntAPPRIS P1 BASIC7.83□□□□□ -1.16
VdrP48281 Mrpl22-201ENSMUST00000020820 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
VdrP48281 Gm39059-201ENSMUST00000209160 424 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
VdrP48281 Gm45274-201ENSMUST00000209938 647 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
VdrP48281 4930543K20Rik-201ENSMUST00000217044 355 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
VdrP48281 Gm35035-201ENSMUST00000218838 628 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
VdrP48281 CT010462.1-201ENSMUST00000220554 1200 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
VdrP48281 AC130829.2-201ENSMUST00000222931 127 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
VdrP48281 Fabp2-201ENSMUST00000023820 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
VdrP48281 Cst12-201ENSMUST00000028932 644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
VdrP48281 Ndufa4-201ENSMUST00000031637 468 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
VdrP48281 2410137M14Rik-201ENSMUST00000039846 865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
VdrP48281 Olfr1507-201ENSMUST00000073571 1112 ntAPPRIS P1 BASIC7.83□□□□□ -1.16
VdrP48281 Prh1-201ENSMUST00000074042 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
VdrP48281 Gm10123-201ENSMUST00000075723 490 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
VdrP48281 Olfr193-201ENSMUST00000076262 1009 ntAPPRIS P1 BASIC7.83□□□□□ -1.16
VdrP48281 Olfr2-201ENSMUST00000094109 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
VdrP48281 Zfp120-202ENSMUST00000094538 1245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
VdrP48281 Grxcr1-201ENSMUST00000094715 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
VdrP48281 Olfr1270-201ENSMUST00000099754 1018 ntAPPRIS P1 BASIC7.83□□□□□ -1.16
VdrP48281 Gm42510-201ENSMUST00000196470 2258 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
VdrP48281 Cavin4-201ENSMUST00000030033 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
VdrP48281 Tssk1-201ENSMUST00000046937 3700 ntAPPRIS P1 BASIC7.83□□□□□ -1.16
VdrP48281 Zranb1-201ENSMUST00000033265 2210 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
VdrP48281 Agbl1-203ENSMUST00000156166 3369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
VdrP48281 Ociad1-203ENSMUST00000166823 3354 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
VdrP48281 Rftn2-201ENSMUST00000027121 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
VdrP48281 A730011C13Rik-202ENSMUST00000141787 1877 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
VdrP48281 Gm28515-201ENSMUST00000189823 2530 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
VdrP48281 Gm43549-201ENSMUST00000198856 2661 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
VdrP48281 Gm42540-201ENSMUST00000200319 2008 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
VdrP48281 Ceacam15-201ENSMUST00000108498 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
VdrP48281 Gm15229-201ENSMUST00000146636 1398 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
VdrP48281 AC123629.1-201ENSMUST00000225669 1364 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
VdrP48281 AC169038.1-201ENSMUST00000227378 1352 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
VdrP48281 Ms4a13-201ENSMUST00000073380 1375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
VdrP48281 Hps5-203ENSMUST00000107654 4422 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
VdrP48281 Gm38173-201ENSMUST00000193126 2314 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
VdrP48281 Gm15228-201ENSMUST00000142044 3440 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
VdrP48281 Ogfod1-203ENSMUST00000109556 5310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
VdrP48281 Gm13544-201ENSMUST00000131189 2940 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
VdrP48281 Lrrtm4-205ENSMUST00000133918 2255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
VdrP48281 Gmeb1-203ENSMUST00000105965 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
VdrP48281 Gadl1-201ENSMUST00000069651 3652 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
VdrP48281 Serpinb1c-201ENSMUST00000021834 1633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
VdrP48281 Polk-204ENSMUST00000221645 1644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
VdrP48281 Gcc2-207ENSMUST00000162041 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
VdrP48281 Nyap2-202ENSMUST00000113494 4540 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
VdrP48281 Trim75-201ENSMUST00000095295 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
VdrP48281 Senp1-201ENSMUST00000044189 6575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
VdrP48281 Pifo-201ENSMUST00000010280 956 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
VdrP48281 Gm5915-201ENSMUST00000116136 454 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
VdrP48281 Gm14519-201ENSMUST00000118490 312 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
VdrP48281 Gm14098-201ENSMUST00000119295 623 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
VdrP48281 Gm11407-201ENSMUST00000120362 1058 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
VdrP48281 Gm12870-201ENSMUST00000121383 1016 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
VdrP48281 Gm15141-201ENSMUST00000121860 729 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
VdrP48281 Gm16150-201ENSMUST00000127620 437 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
VdrP48281 Kbtbd8os-201ENSMUST00000135145 427 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
VdrP48281 Gm15324-201ENSMUST00000139397 355 ntTSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
VdrP48281 Apbb1ip-201ENSMUST00000014290 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
VdrP48281 Gm22949-201ENSMUST00000158562 105 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
VdrP48281 Gm22202-201ENSMUST00000158608 311 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
VdrP48281 Gm16236-201ENSMUST00000159588 379 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
VdrP48281 Gm24083-201ENSMUST00000175174 120 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.9 ms