Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Gm2950-201ENSMUST00000185530 520 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Gm44111-201ENSMUST00000204649 399 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Gm38840-201ENSMUST00000204716 843 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Zfp60-202ENSMUST00000108336 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Chd1P40201 Tcaim-201ENSMUST00000052740 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Chd1P40201 Matr3-205ENSMUST00000186796 1854 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Chd1P40201 Gria1-202ENSMUST00000094179 5399 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Chd1P40201 Gm16568-201ENSMUST00000066038 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Chd1P40201 Cpt1a-201ENSMUST00000025835 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Chd1P40201 Zbtb38-201ENSMUST00000093798 4091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Chd1P40201 Gm43627-201ENSMUST00000197119 2299 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Chd1P40201 Olfr1087-202ENSMUST00000214141 3861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Chd1P40201 Phc3-206ENSMUST00000129817 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Chd1P40201 Ank1-215ENSMUST00000173248 7100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Chd1P40201 Golph3l-207ENSMUST00000177390 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Chd1P40201 Nrp2-205ENSMUST00000114155 6534 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Chd1P40201 Slc38a6-202ENSMUST00000101313 1546 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Chd1P40201 Ect2l-201ENSMUST00000095817 2900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Chd1P40201 Mapk10-202ENSMUST00000112846 2617 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Chd1P40201 Zhx3-202ENSMUST00000103112 9109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Chd1P40201 Cdh23-205ENSMUST00000105464 11090 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Chd1P40201 Gm24789-201ENSMUST00000104282 131 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Chd1P40201 Smt3h1-ps-201ENSMUST00000117126 280 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Chd1P40201 Gm14173-201ENSMUST00000117690 278 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Chd1P40201 Gm8323-201ENSMUST00000168436 1201 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
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Chd1P40201 Gm8324-201ENSMUST00000178911 1204 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Chd1P40201 Gm2871-201ENSMUST00000179984 1204 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Chd1P40201 Gm8325-202ENSMUST00000193411 182 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Chd1P40201 AC133207.2-201ENSMUST00000218430 237 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Chd1P40201 AC154452.1-201ENSMUST00000225819 241 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Chd1P40201 Olfr250-201ENSMUST00000052085 996 ntAPPRIS P2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Chd1P40201 9330158H04Rik-206ENSMUST00000161161 3103 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Chd1P40201 Gm44021-201ENSMUST00000203055 3516 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Chd1P40201 5430419D17Rik-203ENSMUST00000208921 7948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Chd1P40201 Olfr947-ps1-203ENSMUST00000215471 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Chd1P40201 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Chd1P40201 9430053O09Rik-201ENSMUST00000192654 2570 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Chd1P40201 Stat1-206ENSMUST00000186857 4241 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Chd1P40201 Gpbp1l1-202ENSMUST00000106475 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Chd1P40201 Scn3b-202ENSMUST00000114956 4045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Chd1P40201 Tbc1d14-201ENSMUST00000031094 4590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Chd1P40201 Atxn1-201ENSMUST00000091628 10569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Chd1P40201 Gm26813-201ENSMUST00000180778 3587 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Chd1P40201 Dlgap2-201ENSMUST00000043279 3580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Chd1P40201 Gm13101-201ENSMUST00000105763 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Chd1P40201 Cd47-202ENSMUST00000114496 867 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Chd1P40201 Gm11894-201ENSMUST00000121579 328 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Chd1P40201 Gm12301-201ENSMUST00000152963 523 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Chd1P40201 Mir3080-201ENSMUST00000175010 79 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
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Chd1P40201 Klk1b7-ps-201ENSMUST00000078897 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Chd1P40201 Olfr1132-201ENSMUST00000090711 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Chd1P40201 Myof-202ENSMUST00000172095 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Chd1P40201 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Chd1P40201 9930022D16Rik-201ENSMUST00000055404 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Chd1P40201 A330049N07Rik-203ENSMUST00000220010 1989 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Chd1P40201 Rbm27-201ENSMUST00000046972 6134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Chd1P40201 Sulf1-205ENSMUST00000186051 4563 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Chd1P40201 Gm4764-201ENSMUST00000130207 1233 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Chd1P40201 Gm25152-201ENSMUST00000157117 114 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Chd1P40201 Gm22596-201ENSMUST00000157601 316 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Chd1P40201 Gm26738-201ENSMUST00000181312 601 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Chd1P40201 Ralyl-205ENSMUST00000192209 662 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
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Chd1P40201 Igkv4-56-201ENSMUST00000198436 349 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Chd1P40201 Olfr27-201ENSMUST00000214052 1076 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Chd1P40201 AC116591.1-201ENSMUST00000227919 351 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Chd1P40201 Spink13-201ENSMUST00000097557 796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Chd1P40201 Gm5118-201ENSMUST00000184692 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Chd1P40201 Isy1-201ENSMUST00000089497 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Chd1P40201 Clec1a-202ENSMUST00000203162 5128 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Chd1P40201 Mug-ps1-202ENSMUST00000189975 3293 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Chd1P40201 4833420G17Rik-203ENSMUST00000224312 3406 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Chd1P40201 Filip1l-201ENSMUST00000099667 1576 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Chd1P40201 Errfi1-202ENSMUST00000073600 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Chd1P40201 Gm43681-201ENSMUST00000201581 1903 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Chd1P40201 Olfr716-205ENSMUST00000214819 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Chd1P40201 C8a-203ENSMUST00000106808 3539 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Chd1P40201 Sgcg-201ENSMUST00000077954 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Chd1P40201 Fam135a-208ENSMUST00000187752 5194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Chd1P40201 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
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