Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Gm31036-201ENSMUST00000212925 521 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 AC132474.3-201ENSMUST00000213244 383 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm21936-201ENSMUST00000221442 435 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm36862-202ENSMUST00000222758 1051 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 AC124397.1-201ENSMUST00000224296 653 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 AC121114.1-201ENSMUST00000228522 570 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm22043-201ENSMUST00000082993 158 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm25582-201ENSMUST00000083412 110 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Mir24-2-201ENSMUST00000083607 107 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm24522-201ENSMUST00000083964 108 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm7493-201ENSMUST00000085919 626 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Olfr1241-203ENSMUST00000215055 2441 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 F13a1-202ENSMUST00000164727 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm36737-201ENSMUST00000209653 2189 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm43544-201ENSMUST00000196474 2472 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Fcgr3-201ENSMUST00000164044 1347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Nrf1-204ENSMUST00000115199 2296 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Csnk1d-202ENSMUST00000070575 3500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Cnot2-204ENSMUST00000164088 2618 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Plau-201ENSMUST00000022368 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 CU024890.1-201ENSMUST00000221361 2019 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 AC154681.1-201ENSMUST00000225876 1735 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Ntsr1-201ENSMUST00000029084 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Ctnnd1-203ENSMUST00000067232 6119 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Mtpn-201ENSMUST00000031866 3960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Bicc1-202ENSMUST00000131445 3005 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm4673-201ENSMUST00000181395 3660 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Coa7-202ENSMUST00000131656 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Ptprg-202ENSMUST00000119888 2787 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Zfp939-201ENSMUST00000061201 2131 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm43982-201ENSMUST00000204995 1829 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm43970-201ENSMUST00000204346 3605 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Sec16b-202ENSMUST00000086130 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Pum1-205ENSMUST00000105992 5058 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Adgrb3-205ENSMUST00000135518 5432 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Olfr77-201ENSMUST00000057596 9649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Atf6-201ENSMUST00000027974 7246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Mical2-201ENSMUST00000037991 3352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Slc22a19-201ENSMUST00000025666 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Pappa2-202ENSMUST00000159861 9518 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm33533-201ENSMUST00000193853 1633 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm25943-201ENSMUST00000103791 90 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Mir466b-7-201ENSMUST00000103804 88 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Mir466b-5-201ENSMUST00000103900 88 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm26014-201ENSMUST00000104405 132 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm12886-201ENSMUST00000106266 1149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm13414-201ENSMUST00000117516 727 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm13929-201ENSMUST00000117553 1125 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Mup9-202ENSMUST00000118759 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm11348-201ENSMUST00000118813 318 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm12720-201ENSMUST00000123834 472 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Pogk-201ENSMUST00000127596 769 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm12828-201ENSMUST00000136115 289 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm11632-201ENSMUST00000145489 674 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm24002-201ENSMUST00000158456 104 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm16043-201ENSMUST00000160030 616 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm3373-201ENSMUST00000169087 516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm3500-202ENSMUST00000178058 609 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Mir466b-4-201ENSMUST00000178801 90 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm25285-201ENSMUST00000178951 90 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Mir466b-6-201ENSMUST00000180061 90 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Mir466c-2-201ENSMUST00000180211 90 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm2042-202ENSMUST00000180706 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Mir6951-201ENSMUST00000183910 75 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 1810041H14Rik-202ENSMUST00000187218 434 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm29126-201ENSMUST00000188686 151 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm21256-202ENSMUST00000188881 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm5252-201ENSMUST00000189030 909 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 1700124L16Rik-202ENSMUST00000189308 546 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm29276-201ENSMUST00000190453 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm28266-201ENSMUST00000191410 439 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm43476-201ENSMUST00000197873 405 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm32585-201ENSMUST00000198586 764 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Smr2-204ENSMUST00000199635 680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm17909-201ENSMUST00000207587 907 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Olfr1435-ps1-201ENSMUST00000207773 249 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 AC163623.2-202ENSMUST00000214165 610 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 AC122533.2-201ENSMUST00000223772 545 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Cd74-201ENSMUST00000050487 1218 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Olfr139-201ENSMUST00000050678 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Arhgef38-201ENSMUST00000054105 814 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Olfr150-201ENSMUST00000078557 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm25259-201ENSMUST00000083048 193 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Ezh1-202ENSMUST00000107284 4207 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Hecw2-203ENSMUST00000120904 11263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Olfr134-202ENSMUST00000215900 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm43181-201ENSMUST00000197001 2072 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Fam160a1-202ENSMUST00000118408 4445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Psg19-201ENSMUST00000004657 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Zfp473-207ENSMUST00000149011 9230 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 4933406K04Rik-203ENSMUST00000135423 1391 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Ldhc-201ENSMUST00000014545 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Pglyrp4-203ENSMUST00000169698 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Ryr2-202ENSMUST00000170156 16813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Pclo-202ENSMUST00000182407 16846 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Ryr2-201ENSMUST00000021750 16814 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Tnfrsf19-202ENSMUST00000111236 3958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Olfr1246-202ENSMUST00000213221 5338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Olfr1246-203ENSMUST00000217192 5301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Adgrf4-204ENSMUST00000170723 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
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