Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Gm12299-201ENSMUST00000138819 2327 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Gm26645-201ENSMUST00000181076 1316 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 D630023O14Rik-201ENSMUST00000191913 3099 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Mdm4-202ENSMUST00000067429 3490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Gm18451-201ENSMUST00000196759 1719 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Taf1-201ENSMUST00000101341 8054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Gm14755-201ENSMUST00000118037 384 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Gm11903-201ENSMUST00000118958 727 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Gm14218-201ENSMUST00000137802 595 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Klra8-201ENSMUST00000014476 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Gm22035-201ENSMUST00000157284 228 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Ulbp1-201ENSMUST00000169796 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 n-R5s109-201ENSMUST00000179195 119 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Gm27014-201ENSMUST00000182658 937 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 1700020M21Rik-201ENSMUST00000188320 644 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Gm5575-201ENSMUST00000190879 398 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 1700054O19Rik-201ENSMUST00000193604 868 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Gm43057-201ENSMUST00000196789 429 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Klrb1-ps1-202ENSMUST00000203057 414 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Gm9604-201ENSMUST00000211175 433 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 RMST_1.1-203ENSMUST00000217866 775 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 4930486F22Rik-201ENSMUST00000218077 559 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 AC091237.1-201ENSMUST00000224911 637 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 AC157212.1-201ENSMUST00000228398 1075 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Olfr648-201ENSMUST00000052659 951 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Olfr342-201ENSMUST00000074192 1054 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Scgb1b27-201ENSMUST00000085618 493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Aktip-204ENSMUST00000120426 1687 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Tcf7l2-213ENSMUST00000111662 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 4921534A09Rik-201ENSMUST00000213976 2495 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Iqch-201ENSMUST00000042322 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Klkb1-201ENSMUST00000026907 5249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Tpp1-201ENSMUST00000033184 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Sptlc3-201ENSMUST00000047370 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Gm9871-203ENSMUST00000204837 1560 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Vmn1r71-203ENSMUST00000227003 5048 ntAPPRIS P2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Zfp568-202ENSMUST00000146074 6867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Alcam-203ENSMUST00000164728 1885 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 2610021A01Rik-201ENSMUST00000163475 4004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Helz-203ENSMUST00000106746 13147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Cyp2c29-202ENSMUST00000176624 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Gm17039-201ENSMUST00000165145 4901 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Ctage5-217ENSMUST00000176892 2784 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Rbmy-201ENSMUST00000100360 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Gm10256-202ENSMUST00000188114 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Gm21708-203ENSMUST00000190283 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Olfr571-203ENSMUST00000215773 5153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Gm26530-201ENSMUST00000180969 3941 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Olfr716-204ENSMUST00000213367 3585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Olfr131-203ENSMUST00000215940 1614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Olfr338-201ENSMUST00000072114 5780 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Trappc1-202ENSMUST00000102601 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Gm23748-201ENSMUST00000104227 131 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Lrrc51-203ENSMUST00000106963 835 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Lrrc51-204ENSMUST00000106964 872 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Rpl5-ps1-201ENSMUST00000121367 894 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Gm11263-201ENSMUST00000121853 749 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Gm11820-201ENSMUST00000139614 664 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Gm15322-201ENSMUST00000142621 739 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Gm26182-201ENSMUST00000157688 116 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Gm15872-201ENSMUST00000162454 1108 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Svs6-201ENSMUST00000017144 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 1110032A03Rik-209ENSMUST00000177546 647 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Gm29529-201ENSMUST00000187154 714 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Gm35323-201ENSMUST00000191836 499 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Gm31831-201ENSMUST00000196240 684 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Igkv4-83-201ENSMUST00000196933 334 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Gm44812-202ENSMUST00000208999 1285 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Gm2975-201ENSMUST00000209710 820 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 AC102582.1-201ENSMUST00000215376 378 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 AC131654.1-201ENSMUST00000219675 745 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 AC132954.2-201ENSMUST00000222400 403 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Olfr159-201ENSMUST00000053931 960 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Gm15500-201ENSMUST00000071523 894 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Defa35-201ENSMUST00000078121 398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Xlr3b-201ENSMUST00000101486 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Gm13881-201ENSMUST00000149025 3716 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Qsox2-202ENSMUST00000091263 4011 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Lifr-207ENSMUST00000227727 2489 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Bdnf-201ENSMUST00000053317 4266 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 AL607131.1-201ENSMUST00000222575 1835 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Bbs12-201ENSMUST00000057975 2433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Gm37877-201ENSMUST00000191630 2709 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Noct-202ENSMUST00000144826 9797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Elavl2-209ENSMUST00000107124 4127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
H2-Eb1P04230 Igsf10-203ENSMUST00000194546 8393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
H2-Eb1P04230 Gm4513-201ENSMUST00000207881 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
H2-Eb1P04230 Gm4565-201ENSMUST00000208134 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
H2-Eb1P04230 Gm45786-201ENSMUST00000213021 2278 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
H2-Eb1P04230 B230303O12Rik-201ENSMUST00000199119 3645 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
H2-Eb1P04230 Pde1c-206ENSMUST00000166890 4728 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
H2-Eb1P04230 Gm3072-201ENSMUST00000167712 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
H2-Eb1P04230 Adgrg6-203ENSMUST00000208429 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
H2-Eb1P04230 Tmem182-201ENSMUST00000114765 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
H2-Eb1P04230 Gm5157-201ENSMUST00000185914 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
H2-Eb1P04230 AC124516.2-201ENSMUST00000221455 1829 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
H2-Eb1P04230 Gm10845-202ENSMUST00000228217 3389 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
H2-Eb1P04230 Tbcel-202ENSMUST00000066179 3893 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
H2-Eb1P04230 Gm8281-201ENSMUST00000100893 612 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
H2-Eb1P04230 Ighv14-1-201ENSMUST00000103463 351 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms