Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Slc7a12-201ENSMUST00000037321 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Gm30382-203ENSMUST00000199503 1858 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 AC131747.2-201ENSMUST00000226121 1895 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 A730091E23Rik-201ENSMUST00000221700 3825 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Cenpf-204ENSMUST00000171929 11130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Olfr60-203ENSMUST00000211031 2650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Olfr60-204ENSMUST00000215023 2692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Gm8180-201ENSMUST00000163599 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Gm3327-201ENSMUST00000168906 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Robo2-210ENSMUST00000226478 8059 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Gm21051-201ENSMUST00000221757 1688 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Sptlc3-201ENSMUST00000047370 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Qsox2-202ENSMUST00000091263 4011 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Wdr66-207ENSMUST00000170536 3679 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Cfap61-206ENSMUST00000133433 3998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 AC122828.2-201ENSMUST00000222511 2880 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Gm29274-202ENSMUST00000188814 1498 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Olfr195-202ENSMUST00000216957 2077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Ptprd-213ENSMUST00000173376 4793 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Rbmy-201ENSMUST00000100360 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Gstm6-203ENSMUST00000106683 745 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Fam107b-204ENSMUST00000115054 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Gm15105-201ENSMUST00000117777 204 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Gm14755-201ENSMUST00000118037 384 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Gm14631-201ENSMUST00000119067 594 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Rpl5-ps1-201ENSMUST00000121367 894 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 1700061H18Rik-201ENSMUST00000139488 634 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Krtap11-1-201ENSMUST00000171542 1008 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Gm7393-201ENSMUST00000172650 739 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Gm20615-201ENSMUST00000177503 705 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 1110032A03Rik-209ENSMUST00000177546 647 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 4933416M07Rik-201ENSMUST00000181424 624 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Gm27152-201ENSMUST00000183828 99 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Gm20257-201ENSMUST00000185352 936 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Gm10256-202ENSMUST00000188114 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Gm21708-203ENSMUST00000190283 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Gm7412-201ENSMUST00000191692 605 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 D630023O14Rik-201ENSMUST00000191913 3099 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 1700054O19Rik-201ENSMUST00000193604 868 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Gm18428-201ENSMUST00000194986 791 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Gm43141-201ENSMUST00000199695 274 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Gm9871-203ENSMUST00000204837 1560 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Gm2814-201ENSMUST00000207074 1277 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Spcs2-203ENSMUST00000207137 881 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Gm45045-201ENSMUST00000207368 218 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Gm31409-201ENSMUST00000209894 710 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 1700021G15Rik-201ENSMUST00000217671 528 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 4930486F22Rik-201ENSMUST00000218077 559 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Gm30239-201ENSMUST00000220776 780 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 AC091237.1-201ENSMUST00000224911 637 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 AC165287.1-201ENSMUST00000224985 178 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 AC124489.1-201ENSMUST00000225852 526 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 4930556J24Rik-201ENSMUST00000042344 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Gm15500-201ENSMUST00000071523 894 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Ogdh-202ENSMUST00000081894 4114 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Mir296-201ENSMUST00000083587 79 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Timp1-201ENSMUST00000009530 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 AC131687.1-201ENSMUST00000225931 5446 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Bbs12-201ENSMUST00000057975 2433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Gm10650-202ENSMUST00000196581 1969 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Ube4a-202ENSMUST00000117549 3415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Olfr1426-202ENSMUST00000208703 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Gm43775-201ENSMUST00000201019 3395 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Vmn1r220-204ENSMUST00000227950 6238 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Zfp607b-202ENSMUST00000120004 4612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Gm29021-201ENSMUST00000185451 1498 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Gm29071-201ENSMUST00000185729 1488 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Gm28799-201ENSMUST00000186506 1498 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Gm28663-201ENSMUST00000186567 1498 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Gm28470-201ENSMUST00000186912 1498 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Gm28971-201ENSMUST00000187506 1498 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Gm28733-202ENSMUST00000187597 1498 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Gm28820-201ENSMUST00000188530 1498 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Gm29606-202ENSMUST00000188564 1498 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Gm29225-202ENSMUST00000188647 1498 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Gm28152-201ENSMUST00000188694 1498 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Gm28771-202ENSMUST00000189399 1499 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Gm28741-201ENSMUST00000189417 1498 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Gm28540-202ENSMUST00000189573 1498 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Gm29122-203ENSMUST00000189609 1498 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Gm28613-201ENSMUST00000189627 1498 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Gm28816-202ENSMUST00000189686 1498 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Gm29584-202ENSMUST00000190181 1498 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Gm28293-202ENSMUST00000190417 1498 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Gm28463-203ENSMUST00000191085 1498 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Gm28124-202ENSMUST00000191099 1498 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Gm29217-202ENSMUST00000191270 1498 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Gm28332-203ENSMUST00000191389 1498 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Gm37346-201ENSMUST00000191665 1498 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Gm37454-202ENSMUST00000193918 1498 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Gm38371-202ENSMUST00000193996 1498 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Gm37434-203ENSMUST00000194239 1498 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Gm37840-202ENSMUST00000194805 1498 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Gm37687-203ENSMUST00000195020 1498 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Gm37071-203ENSMUST00000195814 1498 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Spire1-202ENSMUST00000082243 4950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 4732465J04Rik-202ENSMUST00000187483 2744 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Rab11fip2-203ENSMUST00000171986 5363 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Olfr1309-204ENSMUST00000215045 5236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Fundc2-201ENSMUST00000033541 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.9 ms