Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Gm30329-201ENSMUST00000211572 3077 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Gdpd4-201ENSMUST00000041860 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Ugt2a2-201ENSMUST00000079811 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Gm38416-201ENSMUST00000209648 3565 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Fras1-201ENSMUST00000036019 15848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Vmn1r199-202ENSMUST00000227685 5713 ntAPPRIS P2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Tdrd7-202ENSMUST00000107777 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Gm16142-201ENSMUST00000130584 2850 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Olfr76-202ENSMUST00000213471 3109 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Olfr727-202ENSMUST00000215317 2616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 CT009480.2-201ENSMUST00000225152 3369 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Obox3-201ENSMUST00000086122 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Specc1-203ENSMUST00000108709 6843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Trpm3-201ENSMUST00000037901 5082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 4921534H16Rik-202ENSMUST00000162911 2838 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 A530017D24Rik-201ENSMUST00000101077 2315 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 9330182O14Rik-202ENSMUST00000228780 2053 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Vmn1r8-202ENSMUST00000227706 1563 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Gm30931-202ENSMUST00000211698 1320 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 4930554C24Rik-203ENSMUST00000216802 1346 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Tnfrsf22-201ENSMUST00000075588 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Rrh-201ENSMUST00000029648 1506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Olfr358-201ENSMUST00000100146 1059 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Snora35-201ENSMUST00000104579 128 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Zfp616-203ENSMUST00000116546 531 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Gm15300-201ENSMUST00000122324 279 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 D830026I12Rik-201ENSMUST00000124434 935 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Gm15898-201ENSMUST00000162213 627 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Gm20617-202ENSMUST00000177332 758 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Gm38084-201ENSMUST00000193488 437 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Gm37865-201ENSMUST00000194996 437 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Gm42626-201ENSMUST00000196866 1148 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Gm42443-201ENSMUST00000198084 1155 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Gm36793-201ENSMUST00000199211 922 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 4933417G07Rik-202ENSMUST00000199732 964 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Olfr374-201ENSMUST00000209675 1053 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Gm38574-201ENSMUST00000211855 640 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 AC112680.2-201ENSMUST00000213119 595 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Gm39317-201ENSMUST00000213360 1138 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Gm35619-201ENSMUST00000222548 600 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 AC156790.1-201ENSMUST00000226572 559 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Gm22126-201ENSMUST00000083244 142 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Slc17a3-204ENSMUST00000166467 4336 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 AC153501.1-201ENSMUST00000218156 1860 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Itih4-201ENSMUST00000006703 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Itih4-202ENSMUST00000078490 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Stxbp4-202ENSMUST00000107872 2529 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Sirpb1c-204ENSMUST00000108352 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 4931406P16Rik-202ENSMUST00000108074 6224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Vezt-201ENSMUST00000047711 4479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Ankub1-201ENSMUST00000099091 2696 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Gm15930-201ENSMUST00000156603 2037 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Cd200r4-202ENSMUST00000176321 2005 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Inpp5d-208ENSMUST00000167032 4125 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Gm18313-201ENSMUST00000221036 1784 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Olfr524-202ENSMUST00000215815 5044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Atf6-201ENSMUST00000027974 7246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Svil-215ENSMUST00000210707 7633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Tex14-201ENSMUST00000060835 4763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Pde4b-204ENSMUST00000106901 2129 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Mei1-204ENSMUST00000189540 3718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Vmn1r44-206ENSMUST00000226760 2070 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Gm26079-201ENSMUST00000104066 133 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Ncald-202ENSMUST00000116445 858 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Gm14796-201ENSMUST00000121216 959 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Gm14640-201ENSMUST00000145800 437 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Gm23896-201ENSMUST00000158109 130 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Gm25904-201ENSMUST00000158491 143 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Gm27299-201ENSMUST00000184593 103 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Gm18009-201ENSMUST00000203239 1016 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Gm44075-201ENSMUST00000204208 216 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Gm31659-201ENSMUST00000211989 481 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 AC160138.1-201ENSMUST00000217965 588 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 AC125064.1-201ENSMUST00000225801 295 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 AC102139.1-201ENSMUST00000227000 251 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Olfr166-201ENSMUST00000074739 1040 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Rapgef5-206ENSMUST00000222185 5508 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Rdh1-201ENSMUST00000073639 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Slc17a4-201ENSMUST00000021769 1604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Gm4073-201ENSMUST00000176792 3500 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Olfr20-202ENSMUST00000120137 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Olfr60-202ENSMUST00000210932 2383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Dock9-201ENSMUST00000040700 7803 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Fmr1-203ENSMUST00000114654 4061 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Slc4a4-203ENSMUST00000130041 3335 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Ripor2-204ENSMUST00000110383 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Gm6811-201ENSMUST00000169389 1533 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Gm31805-201ENSMUST00000211921 4031 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Bbx-203ENSMUST00000089404 4024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Vmn2r118-201ENSMUST00000168440 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Ctnnd1-216ENSMUST00000111690 5945 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Bdnf-201ENSMUST00000053317 4266 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Sestd1-202ENSMUST00000102660 8990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 AC124516.2-201ENSMUST00000221455 1829 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Gm28472-202ENSMUST00000190133 1499 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Gm28789-202ENSMUST00000190429 1499 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Gm13881-201ENSMUST00000149025 3716 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Myom1-202ENSMUST00000073211 5602 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Trim12c-202ENSMUST00000130139 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Trbv13-2-201ENSMUST00000103270 340 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms