Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

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Length 1,947 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Gm37510-201ENSMUST00000194151 4762 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Vmn1r176-204ENSMUST00000227129 2955 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Vmn1r176-207ENSMUST00000228793 2959 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 AC155941.4-201ENSMUST00000219731 2705 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 AC153132.1-201ENSMUST00000222625 2705 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Nostrin-201ENSMUST00000041865 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Bbx-205ENSMUST00000114488 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Sla-201ENSMUST00000100572 2626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Gucy2g-201ENSMUST00000069183 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Slmap-202ENSMUST00000090359 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Smad5-201ENSMUST00000069557 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Psg29-201ENSMUST00000075934 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Acox1-202ENSMUST00000072948 3743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Tcf4-207ENSMUST00000114985 8577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Adar-201ENSMUST00000029563 3753 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Gm13762-202ENSMUST00000168169 2180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Olfr140-203ENSMUST00000216475 3574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Olfr1391-202ENSMUST00000215671 3235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Gm14550-201ENSMUST00000117918 407 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Rps12-ps20-201ENSMUST00000121168 402 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Gm12279-201ENSMUST00000142533 294 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Gm12963-203ENSMUST00000156271 388 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Gm17096-201ENSMUST00000172037 733 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Mir5107-201ENSMUST00000175586 88 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Gm20691-201ENSMUST00000176889 333 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Rps12-ps23-201ENSMUST00000179414 402 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Gm19087-201ENSMUST00000191430 946 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Gm43354-201ENSMUST00000196862 346 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Gm9710-201ENSMUST00000198053 499 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
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Scn3aA2ASI5 Uba1y-201ENSMUST00000115894 3981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Krcc1-202ENSMUST00000168700 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Pkib-202ENSMUST00000075992 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Psd4-202ENSMUST00000102942 11265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Mageb18-202ENSMUST00000113955 2163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Gm30340-201ENSMUST00000191898 2198 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 CAAA01119292.1-201ENSMUST00000226763 2766 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
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Scn3aA2ASI5 Cep290-210ENSMUST00000220346 8211 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
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Scn3aA2ASI5 Rasgrf1-202ENSMUST00000034912 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Dnah9-201ENSMUST00000080665 13798 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
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Scn3aA2ASI5 Snora35-201ENSMUST00000104579 128 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Gm8534-201ENSMUST00000118553 766 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Scgb2b23-ps-201ENSMUST00000122094 330 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
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Scn3aA2ASI5 Gm6061-201ENSMUST00000175860 492 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
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Scn3aA2ASI5 A730094K22Rik-201ENSMUST00000193867 740 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
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Scn3aA2ASI5 1810011H11Rik-201ENSMUST00000039191 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Itpr2-202ENSMUST00000079573 11679 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
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Scn3aA2ASI5 Meis2-205ENSMUST00000110907 3718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Rab1a-206ENSMUST00000163483 2657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Slc17a6-201ENSMUST00000032710 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Mapk10-205ENSMUST00000128869 2518 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
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Scn3aA2ASI5 Slc17a4-201ENSMUST00000021769 1604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Gm3234-201ENSMUST00000222644 5061 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Cd200r3-205ENSMUST00000114613 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Gm14054-201ENSMUST00000120744 704 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
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Scn3aA2ASI5 Gm14343-201ENSMUST00000154524 731 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Gm18833-201ENSMUST00000173218 862 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Gm2916-201ENSMUST00000178392 384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Gm10410-201ENSMUST00000180138 384 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
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Scn3aA2ASI5 Gm27853-201ENSMUST00000184176 250 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Txndc9-203ENSMUST00000192960 472 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Pilrb2-202ENSMUST00000196162 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
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Scn3aA2ASI5 Gm18851-201ENSMUST00000210087 1058 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 AC165292.1-201ENSMUST00000215218 620 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 AC131187.2-201ENSMUST00000223936 994 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Uqcrh-ps1-201ENSMUST00000038391 270 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 BC147527-201ENSMUST00000081558 504 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Boll-201ENSMUST00000087585 882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Ctnna3-202ENSMUST00000105440 3682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Akap2-204ENSMUST00000102902 6993 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 4930442L01Rik-201ENSMUST00000145865 2077 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Gm15880-201ENSMUST00000142678 2884 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Gm44620-201ENSMUST00000209183 2887 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Gm38366-201ENSMUST00000193127 1934 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
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