Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Ccdc7a-202ENSMUST00000108747 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
OtofQ9ESF1 Col25a1-202ENSMUST00000106353 6701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
OtofQ9ESF1 Kirrel3os-201ENSMUST00000066604 3799 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
OtofQ9ESF1 Kcnj15-201ENSMUST00000037154 5089 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
OtofQ9ESF1 AC134577.3-201ENSMUST00000226490 3000 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
OtofQ9ESF1 AC159264.1-201ENSMUST00000224844 4257 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
OtofQ9ESF1 Gm21846-201ENSMUST00000179257 3073 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
OtofQ9ESF1 Atl3-201ENSMUST00000025668 6376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
OtofQ9ESF1 Zfp518b-201ENSMUST00000057258 6804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
OtofQ9ESF1 Qsox2-202ENSMUST00000091263 4011 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
OtofQ9ESF1 Tsix-201ENSMUST00000152916 4306 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
OtofQ9ESF1 Ptpn13-201ENSMUST00000048957 7915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
OtofQ9ESF1 1700014D04Rik-203ENSMUST00000180139 3231 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
OtofQ9ESF1 Greb1-212ENSMUST00000162112 8058 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
OtofQ9ESF1 Gm11271-201ENSMUST00000116054 440 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
OtofQ9ESF1 Gm12842-201ENSMUST00000117298 476 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
OtofQ9ESF1 Rps12-ps10-201ENSMUST00000117447 399 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
OtofQ9ESF1 Gm13176-201ENSMUST00000117910 477 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
OtofQ9ESF1 Rps12-ps16-201ENSMUST00000118529 399 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
OtofQ9ESF1 Gm15502-201ENSMUST00000121449 208 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
OtofQ9ESF1 Gm15503-201ENSMUST00000141541 449 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
OtofQ9ESF1 Gm20491-201ENSMUST00000173765 1241 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
OtofQ9ESF1 Tnfsf10-202ENSMUST00000174840 989 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
OtofQ9ESF1 Gm20685-201ENSMUST00000176654 489 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
OtofQ9ESF1 Rps12-ps13-201ENSMUST00000178365 399 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
OtofQ9ESF1 Rps12-ps11-201ENSMUST00000178427 399 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
OtofQ9ESF1 Rps12-ps12-201ENSMUST00000179020 399 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
OtofQ9ESF1 Rps12-ps17-201ENSMUST00000179067 399 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
OtofQ9ESF1 Rps12-ps6-201ENSMUST00000179239 399 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
OtofQ9ESF1 Rps12-ps14-201ENSMUST00000179356 399 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
OtofQ9ESF1 Rps12-ps18-201ENSMUST00000179420 399 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
OtofQ9ESF1 Rps12-ps15-201ENSMUST00000179567 399 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
OtofQ9ESF1 Rps12l1-201ENSMUST00000183090 399 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
OtofQ9ESF1 Gm29357-201ENSMUST00000186877 698 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
OtofQ9ESF1 Gm18447-201ENSMUST00000187501 307 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
OtofQ9ESF1 Rps12-ps4-201ENSMUST00000208689 397 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
OtofQ9ESF1 Gm18586-201ENSMUST00000217265 518 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
OtofQ9ESF1 AC153821.1-201ENSMUST00000217893 581 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
OtofQ9ESF1 Mylf-ps-201ENSMUST00000222174 421 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
OtofQ9ESF1 AC163660.1-201ENSMUST00000223696 818 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
OtofQ9ESF1 AC132260.1-201ENSMUST00000225499 734 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
OtofQ9ESF1 Prl3d3-201ENSMUST00000073601 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
OtofQ9ESF1 Gm10205-201ENSMUST00000087431 234 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
OtofQ9ESF1 Olfr702-201ENSMUST00000080899 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
OtofQ9ESF1 Fam90a1b-203ENSMUST00000113903 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
OtofQ9ESF1 9330199G10Rik-201ENSMUST00000221601 2072 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
OtofQ9ESF1 Utp14b-ps1-201ENSMUST00000197716 2265 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
OtofQ9ESF1 Slco1a4-201ENSMUST00000032364 2252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
OtofQ9ESF1 Gm36930-201ENSMUST00000195431 2376 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
OtofQ9ESF1 AC132465.2-201ENSMUST00000218673 2728 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
OtofQ9ESF1 Tulp4-201ENSMUST00000039655 9687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
OtofQ9ESF1 Piwil2-201ENSMUST00000048129 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
OtofQ9ESF1 Depdc5-205ENSMUST00000120902 5195 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
OtofQ9ESF1 Slc12a6-201ENSMUST00000028549 6105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
OtofQ9ESF1 Sox6-210ENSMUST00000206034 8668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
OtofQ9ESF1 Clec1a-202ENSMUST00000203162 5128 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
OtofQ9ESF1 Galnt5-201ENSMUST00000112616 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
OtofQ9ESF1 Gm43285-201ENSMUST00000196563 3592 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
OtofQ9ESF1 4930568G15Rik-201ENSMUST00000193317 3218 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
OtofQ9ESF1 Fndc3b-204ENSMUST00000195008 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
OtofQ9ESF1 Gmeb1-203ENSMUST00000105965 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
OtofQ9ESF1 Sirpb1c-204ENSMUST00000108352 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
OtofQ9ESF1 Gm26422-201ENSMUST00000104276 132 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
OtofQ9ESF1 Gm15216-201ENSMUST00000118058 277 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
OtofQ9ESF1 Rpl21-ps9-201ENSMUST00000119897 482 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
OtofQ9ESF1 Sms-ps-201ENSMUST00000121773 1101 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
OtofQ9ESF1 Gm15471-201ENSMUST00000145893 625 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
OtofQ9ESF1 Gm25219-201ENSMUST00000157545 330 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
OtofQ9ESF1 Mir1953-201ENSMUST00000157866 89 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
OtofQ9ESF1 Gm25550-201ENSMUST00000158079 128 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
OtofQ9ESF1 Lrrc4-202ENSMUST00000171353 883 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
OtofQ9ESF1 Gm2602-201ENSMUST00000202112 571 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
OtofQ9ESF1 Gm45122-201ENSMUST00000206376 784 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
OtofQ9ESF1 Gm32816-202ENSMUST00000206497 496 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
OtofQ9ESF1 Gm39078-201ENSMUST00000207973 704 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
OtofQ9ESF1 Gkn3-201ENSMUST00000032127 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
OtofQ9ESF1 Olfr11-201ENSMUST00000043081 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
OtofQ9ESF1 Olfr275-201ENSMUST00000095085 960 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
OtofQ9ESF1 Tbc1d23-203ENSMUST00000226586 3112 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
OtofQ9ESF1 Wdr44-201ENSMUST00000035766 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
OtofQ9ESF1 Vmn1r180-201ENSMUST00000173816 5060 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
OtofQ9ESF1 AC155941.4-201ENSMUST00000219731 2705 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
OtofQ9ESF1 AC153132.1-201ENSMUST00000222625 2705 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
OtofQ9ESF1 Vmn1r8-202ENSMUST00000227706 1563 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
OtofQ9ESF1 Gm9877-201ENSMUST00000064271 2627 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
OtofQ9ESF1 Gm28472-202ENSMUST00000190133 1499 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
OtofQ9ESF1 Gm28789-202ENSMUST00000190429 1499 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
OtofQ9ESF1 Lilra6-204ENSMUST00000206077 2281 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
OtofQ9ESF1 4833423E24Rik-201ENSMUST00000099923 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
OtofQ9ESF1 Gm26512-201ENSMUST00000181874 3042 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
OtofQ9ESF1 Plscr2-202ENSMUST00000113044 1239 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
OtofQ9ESF1 Gm11256-201ENSMUST00000118109 829 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
OtofQ9ESF1 Gm5319-201ENSMUST00000118965 873 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
OtofQ9ESF1 Gm14375-201ENSMUST00000119490 855 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
OtofQ9ESF1 Rps13-ps6-201ENSMUST00000120038 428 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
OtofQ9ESF1 Pgbd1-202ENSMUST00000122872 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
OtofQ9ESF1 Rpl35a-ps5-201ENSMUST00000137013 333 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
OtofQ9ESF1 Igkv4-53-201ENSMUST00000166380 292 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
OtofQ9ESF1 Gm3344-201ENSMUST00000169610 603 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
OtofQ9ESF1 1700054O19Rik-201ENSMUST00000193604 868 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms