Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

Predictions only

Length 869 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Gm2101-202ENSMUST00000131997 764 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Gm15407-201ENSMUST00000136919 634 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Gm2165-203ENSMUST00000137981 764 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Gm3669-204ENSMUST00000140946 764 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Cav1-209ENSMUST00000150901 380 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Gm6434-201ENSMUST00000163316 372 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Gm26654-201ENSMUST00000180455 256 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Mir6908-201ENSMUST00000184056 63 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Gm27185-201ENSMUST00000184296 247 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Gm34342-201ENSMUST00000192139 335 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Gm37679-201ENSMUST00000192868 1192 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Gm5711-201ENSMUST00000197896 421 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Gm32585-201ENSMUST00000198586 764 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Olfr793-ps1-201ENSMUST00000205161 895 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Gm4585-201ENSMUST00000207218 452 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 AC165256.1-201ENSMUST00000216687 670 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 1700021G15Rik-201ENSMUST00000217671 528 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 AC113204.1-203ENSMUST00000219475 375 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 AC131795.1-201ENSMUST00000219632 426 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Olfr303-201ENSMUST00000053958 1040 ntAPPRIS P1 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 1700057G04Rik-201ENSMUST00000098477 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Gpr119-201ENSMUST00000053970 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Gm43335-201ENSMUST00000198299 3276 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 AC138284.1-201ENSMUST00000214258 3236 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Myot-201ENSMUST00000025349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Ksr2-202ENSMUST00000180430 13125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Vmn1r51-213ENSMUST00000228880 4353 ntAPPRIS P1 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Gm10855-201ENSMUST00000100426 2541 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Npy2r-201ENSMUST00000029633 3364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Prkd3-201ENSMUST00000003191 5517 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Gm29824-201ENSMUST00000213183 3285 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Trim75-201ENSMUST00000095295 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Olfr976-201ENSMUST00000169307 2813 ntAPPRIS P2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Pln-201ENSMUST00000046221 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Gm11590-201ENSMUST00000118999 1455 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Gm28173-201ENSMUST00000191190 1496 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Gm28175-202ENSMUST00000209336 1477 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Gdpd4-201ENSMUST00000041860 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Olfr62-202ENSMUST00000213189 2570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Vmn1r181-208ENSMUST00000228842 4491 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Vcam1-203ENSMUST00000196449 2532 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Pde1c-208ENSMUST00000170774 2132 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Gm9575-201ENSMUST00000122140 1339 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Dsg1b-201ENSMUST00000076737 3965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Gm8765-201ENSMUST00000099518 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Gm906-201ENSMUST00000099521 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Nsrp1-201ENSMUST00000102494 3114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Gm8281-201ENSMUST00000100893 612 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Gm22256-201ENSMUST00000102291 107 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Gstm6-203ENSMUST00000106683 745 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Gm13732-201ENSMUST00000117753 535 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Gm5133-201ENSMUST00000118940 1255 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Gm5319-201ENSMUST00000118965 873 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Gm15007-201ENSMUST00000119982 710 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Gm15096-201ENSMUST00000121918 878 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Gm21990-201ENSMUST00000124692 383 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Ctcflos-202ENSMUST00000142207 918 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 1700086P04Rik-201ENSMUST00000149472 1009 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Gm25556-201ENSMUST00000158077 144 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Gm9359-201ENSMUST00000163721 1221 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Gm4141-201ENSMUST00000174364 921 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Gm4201-201ENSMUST00000174775 921 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Gm8237-202ENSMUST00000178594 447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Gm21392-201ENSMUST00000182950 972 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Gm27468-201ENSMUST00000183577 106 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Gm28439-201ENSMUST00000187714 876 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Gm7867-201ENSMUST00000189856 546 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Gm29141-201ENSMUST00000190357 882 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Gm3841-201ENSMUST00000191399 451 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Gm44342-201ENSMUST00000196874 129 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Gm44383-201ENSMUST00000198940 129 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Gm36231-201ENSMUST00000211183 217 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 AC154248.2-201ENSMUST00000221964 659 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 AC131033.1-201ENSMUST00000228223 279 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Olfr691-201ENSMUST00000057528 969 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Vmn1r183-201ENSMUST00000086012 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Muc5b-201ENSMUST00000165147 14964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Tmem68-201ENSMUST00000029891 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Kmo-201ENSMUST00000040250 2695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Zfp712-201ENSMUST00000167565 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Zfp804b-201ENSMUST00000164784 3924 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Gm43876-201ENSMUST00000203831 3229 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Gm43029-201ENSMUST00000201829 1535 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Olfr1426-205ENSMUST00000219155 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Gm43789-201ENSMUST00000199275 2472 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Plk4-202ENSMUST00000167556 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Adsl-201ENSMUST00000023043 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Gm38394-201ENSMUST00000179598 10156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Olfr1412-202ENSMUST00000190505 3663 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Mrpl48-208ENSMUST00000150042 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Apobec3-203ENSMUST00000165537 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 C030029H02Rik-202ENSMUST00000210356 2980 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Lctl-202ENSMUST00000118215 1380 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Zmat3-201ENSMUST00000029199 7797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Zfp266-201ENSMUST00000068296 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Zfp729a-201ENSMUST00000012314 9455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Brd8-201ENSMUST00000003876 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Spire1-201ENSMUST00000045105 5033 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Olfr457-202ENSMUST00000203396 4404 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Bbx-205ENSMUST00000114488 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms