Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU3

Riok3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok3Q9DBU3 AC125399.1-201ENSMUST00000224236 595 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 AC154595.2-201ENSMUST00000225067 310 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 AC123533.3-201ENSMUST00000228056 454 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Prss1-201ENSMUST00000031910 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Fthl17a-201ENSMUST00000048382 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Olfr609-201ENSMUST00000055787 965 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Gm26447-201ENSMUST00000082448 129 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 n-R5s25-201ENSMUST00000082923 119 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Nalcn-201ENSMUST00000000201 7122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Gm12014-201ENSMUST00000120164 1620 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Olfr1261-203ENSMUST00000213909 2912 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Srsf7-201ENSMUST00000063417 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Gpr156-201ENSMUST00000061274 4581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 5830444F18Rik-201ENSMUST00000194009 1992 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Zwilch-201ENSMUST00000122091 2957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Gm11756-201ENSMUST00000107310 1312 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Gdpd1-201ENSMUST00000020804 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Gm37161-201ENSMUST00000191994 2697 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Gm3519-201ENSMUST00000196113 1676 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Gm46404-201ENSMUST00000221461 4114 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Gm42864-201ENSMUST00000198371 1436 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Slc25a14-204ENSMUST00000134257 1805 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Adam21-201ENSMUST00000008582 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Gm498-207ENSMUST00000207630 1483 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Prdx3-201ENSMUST00000025961 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Prpf40a-201ENSMUST00000076313 7374 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 AC162181.1-201ENSMUST00000221643 3728 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Gm16204-201ENSMUST00000117864 1897 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Rbm12-202ENSMUST00000109604 6635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Nupl1-202ENSMUST00000041905 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Rtp4-201ENSMUST00000038423 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 4921529L05Rik-201ENSMUST00000203047 1997 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Snrnp200-201ENSMUST00000103220 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Zfp264-202ENSMUST00000208781 2801 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Ispd-206ENSMUST00000223068 2808 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Mill2-206ENSMUST00000228493 2043 ntAPPRIS P4 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 4933431K23Rik-204ENSMUST00000209273 2857 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Olfr1513-202ENSMUST00000215147 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Wee2-201ENSMUST00000038907 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Gm20110-201ENSMUST00000218263 2095 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Egf-202ENSMUST00000197079 3346 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Rpa1-201ENSMUST00000000767 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Nrf1-202ENSMUST00000069808 1658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Gm9-201ENSMUST00000101636 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Eppin-201ENSMUST00000103100 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Igkv1-132-201ENSMUST00000103305 362 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Sat1-202ENSMUST00000112551 896 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Gm14815-201ENSMUST00000120060 488 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Gm14911-201ENSMUST00000120803 989 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Gm22482-201ENSMUST00000122563 359 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Gm16014-201ENSMUST00000123363 544 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Gm13905-201ENSMUST00000140009 579 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Gm11697-201ENSMUST00000149226 525 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Gm10364-202ENSMUST00000153034 1001 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 1700025N21Rik-201ENSMUST00000160997 686 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Gm25194-201ENSMUST00000177987 79 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Gm5561-201ENSMUST00000178932 480 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Gm17797-201ENSMUST00000182175 997 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Gm8307-201ENSMUST00000187682 1150 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Gm38316-201ENSMUST00000194838 469 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Gm42767-201ENSMUST00000198583 632 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Gm42205-201ENSMUST00000199244 804 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Igkv11-114-201ENSMUST00000200013 346 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Gm43500-201ENSMUST00000201067 312 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 2610318N02Rik-202ENSMUST00000207116 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Gm44787-202ENSMUST00000208339 1069 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Gm42402-201ENSMUST00000208341 1054 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Gm32983-201ENSMUST00000208500 505 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 E230029C05Rik-206ENSMUST00000208547 814 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 AC159635.1-201ENSMUST00000220905 2102 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Gm46389-201ENSMUST00000223199 392 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 AC154788.1-201ENSMUST00000225003 340 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 AC154563.1-201ENSMUST00000228317 442 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 AC123665.6-201ENSMUST00000228568 538 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 AC161581.1-201ENSMUST00000228696 318 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 8030411F24Rik-201ENSMUST00000028933 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 1700001C19Rik-202ENSMUST00000073143 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Ctse-201ENSMUST00000073350 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Gm6043-201ENSMUST00000099961 492 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Alkbh1-209ENSMUST00000162961 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 1700110I01Rik-202ENSMUST00000112812 1737 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Gm15550-201ENSMUST00000120824 1748 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 4930453H23Rik-201ENSMUST00000125569 1719 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Hgd-203ENSMUST00000160847 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Olfr615-203ENSMUST00000215673 3469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Gm45117-201ENSMUST00000207250 1774 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Nek6-201ENSMUST00000054234 10338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Gm38339-201ENSMUST00000195479 1829 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Ccdc80-202ENSMUST00000099498 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 1700034I23Rik-201ENSMUST00000099123 2348 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Gtf2a1-201ENSMUST00000021345 6064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Il6st-209ENSMUST00000184445 1870 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Gemin8-201ENSMUST00000056410 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Rabgef1-201ENSMUST00000026390 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Map2-204ENSMUST00000114013 6258 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Mcm10-202ENSMUST00000102985 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Dpysl2-201ENSMUST00000022629 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Rab3il1-203ENSMUST00000121418 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Katnal2-211ENSMUST00000154665 1515 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Wdr27-201ENSMUST00000170386 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.9 ms