Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Gm25717-201ENSMUST00000158631 353 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Gm6726-201ENSMUST00000172786 681 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Sbp-206ENSMUST00000183155 882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 6030442E23Rik-201ENSMUST00000186618 642 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Nabp1-206ENSMUST00000188051 680 ntTSL 3 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Gm21301-201ENSMUST00000189476 699 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 1700020G17Rik-203ENSMUST00000191286 723 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Gm37679-201ENSMUST00000192868 1192 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Gm38170-201ENSMUST00000195404 816 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Gm43141-201ENSMUST00000199695 274 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Gm9652-201ENSMUST00000209345 163 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 9230112D13Rik-201ENSMUST00000022325 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 AC125117.2-201ENSMUST00000228344 1140 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Gm21051-201ENSMUST00000221757 1688 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Eif4a2-203ENSMUST00000115341 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 4930449A18Rik-201ENSMUST00000094228 2071 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Gm26786-201ENSMUST00000180410 6243 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Vmn1r86-203ENSMUST00000227220 6445 ntAPPRIS P2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Emsy-207ENSMUST00000205911 5079 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Zfp345-201ENSMUST00000109914 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Gm15448-205ENSMUST00000189095 1905 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Cyp2c68-201ENSMUST00000099472 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Ube4a-201ENSMUST00000117506 6039 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Tenm4-203ENSMUST00000107166 13172 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Pard3-212ENSMUST00000160717 4214 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 AC138765.2-202ENSMUST00000228418 3435 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Gm15930-201ENSMUST00000156603 2037 ntBASIC7.96□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Zhx1-203ENSMUST00000175805 4839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 5430421F17Rik-202ENSMUST00000210268 2295 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Tmem182-201ENSMUST00000114765 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Nxt2-204ENSMUST00000112916 2532 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Vmn2r45-201ENSMUST00000164845 3619 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Mllt10-202ENSMUST00000114669 3865 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 AC139350.2-201ENSMUST00000226508 2331 ntBASIC7.96□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Gm20877-201ENSMUST00000100105 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Rbpsuh-ps1-201ENSMUST00000119456 1006 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm15316-201ENSMUST00000121082 421 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm15743-201ENSMUST00000129645 242 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 4930583P06Rik-201ENSMUST00000136658 706 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm12031-201ENSMUST00000156150 627 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm22533-201ENSMUST00000158821 274 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Lrrc51-210ENSMUST00000163903 939 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm9672-201ENSMUST00000166437 425 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm20917-201ENSMUST00000179922 990 ntAPPRIS P1 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm27507-201ENSMUST00000184199 93 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm5334-201ENSMUST00000187472 720 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 1700011B04Rik-201ENSMUST00000189140 651 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Zfp799-202ENSMUST00000201499 651 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm26911-202ENSMUST00000204244 763 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm17822-201ENSMUST00000204307 351 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Pde6h-203ENSMUST00000204382 211 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm2398-201ENSMUST00000218347 883 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 1700011B04Rik-205ENSMUST00000220995 831 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 1700011B04Rik-207ENSMUST00000221256 800 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 1700011B04Rik-208ENSMUST00000221261 628 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 1700011B04Rik-210ENSMUST00000222668 821 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
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Ccdc47Q9D024 Fsip1-201ENSMUST00000028820 1025 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
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Ccdc47Q9D024 Gm5446-201ENSMUST00000091762 784 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 AC135119.1-204ENSMUST00000228036 2663 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
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Ccdc47Q9D024 Gm15681-201ENSMUST00000137501 2704 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
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Ccdc47Q9D024 Kcne3-203ENSMUST00000178946 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Bglap3-202ENSMUST00000107542 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Galnt15-202ENSMUST00000164208 3563 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Plxdc2-202ENSMUST00000114702 2146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 AC153962.2-202ENSMUST00000219391 1382 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 AC120347.1-201ENSMUST00000223326 1639 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm3608-201ENSMUST00000086725 2858 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Ubtfl1-201ENSMUST00000098973 1649 ntAPPRIS P1 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Mfap3-201ENSMUST00000020830 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm18409-201ENSMUST00000218988 2506 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Olfr1564-202ENSMUST00000208645 5213 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm28407-201ENSMUST00000185630 1497 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm28108-201ENSMUST00000186747 1497 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm28218-202ENSMUST00000186782 1498 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm29511-201ENSMUST00000187580 1497 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm28367-201ENSMUST00000187942 1496 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm29549-202ENSMUST00000189569 1497 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Tnfrsf22-201ENSMUST00000075588 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Acpp-201ENSMUST00000062723 4483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Bcas3os1-202ENSMUST00000151652 3138 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Zfp78-202ENSMUST00000108559 1539 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Trbv1-201ENSMUST00000103262 417 ntAPPRIS P1 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm25916-201ENSMUST00000104263 131 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Tpk1-203ENSMUST00000114644 2148 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Rpl22-ps1-201ENSMUST00000118652 386 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm14503-201ENSMUST00000130337 1164 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm15407-201ENSMUST00000136919 634 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 AC122263.2-201ENSMUST00000145909 586 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 A430048G15Rik-201ENSMUST00000149965 627 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm22728-201ENSMUST00000158087 129 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm24680-201ENSMUST00000158759 126 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm25574-201ENSMUST00000175245 249 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
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