Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 1700006H21Rik-201ENSMUST00000188490 627 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Lrrtm2Q8BGA3 Gm28443-201ENSMUST00000189081 698 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Lrrtm2Q8BGA3 Gm37669-201ENSMUST00000192184 820 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43495-201ENSMUST00000200060 205 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Lrrtm2Q8BGA3 Gm42673-201ENSMUST00000202676 337 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Lrrtm2Q8BGA3 D730003K21Rik-202ENSMUST00000217456 533 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Lrrtm2Q8BGA3 Asf1a-204ENSMUST00000219271 725 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Lrrtm2Q8BGA3 Gm46231-201ENSMUST00000220152 314 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Lrrtm2Q8BGA3 AC138765.3-201ENSMUST00000227981 423 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Lrrtm2Q8BGA3 Nup43-201ENSMUST00000040135 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr424-201ENSMUST00000053941 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15500-201ENSMUST00000071523 894 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr1360-201ENSMUST00000079135 980 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Lrrtm2Q8BGA3 1700011I03Rik-201ENSMUST00000079738 1013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Lrrtm2Q8BGA3 n-R5s97-201ENSMUST00000082585 113 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Lrrtm2Q8BGA3 Mir7b-201ENSMUST00000083557 111 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Lrrtm2Q8BGA3 Lmbrd1-201ENSMUST00000095062 5228 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Lrrtm2Q8BGA3 Gm37967-201ENSMUST00000195634 2665 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Lrrtm2Q8BGA3 Atp13a5-201ENSMUST00000075806 4598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr1278-203ENSMUST00000213727 6744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Lrrtm2Q8BGA3 Csnk1g1-201ENSMUST00000034949 7208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Lrrtm2Q8BGA3 Nedd9-201ENSMUST00000021794 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Lrrtm2Q8BGA3 Gm44194-201ENSMUST00000204222 3229 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Lrrtm2Q8BGA3 Hydin-201ENSMUST00000043141 15783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45657-201ENSMUST00000211318 1349 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Lrrtm2Q8BGA3 Lilrb4a-201ENSMUST00000217706 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Lrrtm2Q8BGA3 Mpdz-202ENSMUST00000107258 7241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Lrrtm2Q8BGA3 Lhfpl3-201ENSMUST00000196406 2589 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43229-201ENSMUST00000201812 1850 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Lrrtm2Q8BGA3 Gm44620-201ENSMUST00000209183 2887 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr43-204ENSMUST00000215550 1854 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Lrrtm2Q8BGA3 Fbln5-203ENSMUST00000222587 2371 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Lrrtm2Q8BGA3 Rnf219-202ENSMUST00000227640 1632 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Lrrtm2Q8BGA3 Gimap9-201ENSMUST00000054050 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Lrrtm2Q8BGA3 Tcaf3-201ENSMUST00000069023 3110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Lrrtm2Q8BGA3 Lrrtm4-201ENSMUST00000074662 3383 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Lrrtm2Q8BGA3 Gm44677-201ENSMUST00000209151 3739 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Lrrtm2Q8BGA3 Slmap-202ENSMUST00000090359 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp748-202ENSMUST00000181892 5293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Lrrtm2Q8BGA3 Vmn2r-ps133-201ENSMUST00000176979 2569 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Lrrtm2Q8BGA3 Fam196b-201ENSMUST00000093192 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Lrrtm2Q8BGA3 Rsrc2-201ENSMUST00000050827 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp74-202ENSMUST00000108205 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Lrrtm2Q8BGA3 Slc22a6-201ENSMUST00000010250 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Lrrtm2Q8BGA3 Nyap2-204ENSMUST00000123720 3471 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp317-203ENSMUST00000213725 2354 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Lrrtm2Q8BGA3 Gm44231-201ENSMUST00000204106 4075 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Lrrtm2Q8BGA3 Stat4-202ENSMUST00000168302 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Lrrtm2Q8BGA3 Gm37945-201ENSMUST00000192536 4367 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Lrrtm2Q8BGA3 Plb1-201ENSMUST00000101376 4699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Lrrtm2Q8BGA3 Ighv1-18-201ENSMUST00000103504 306 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26016-201ENSMUST00000104403 129 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Lrrtm2Q8BGA3 Homer1-209ENSMUST00000109496 772 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Lrrtm2Q8BGA3 Fancl-202ENSMUST00000109509 1187 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp616-203ENSMUST00000116546 531 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13486-201ENSMUST00000119910 282 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Lrrtm2Q8BGA3 Amy2-ps1-201ENSMUST00000122117 1117 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Lrrtm2Q8BGA3 Gm8089-201ENSMUST00000122463 968 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Lrrtm2Q8BGA3 Gm14401-204ENSMUST00000134614 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Lrrtm2Q8BGA3 4930583P06Rik-201ENSMUST00000136658 706 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15935-202ENSMUST00000141656 298 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Lrrtm2Q8BGA3 Gm8550-201ENSMUST00000161621 653 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Lrrtm2Q8BGA3 Spink10-205ENSMUST00000162365 1076 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Lrrtm2Q8BGA3 Gm4373-201ENSMUST00000178571 556 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Lrrtm2Q8BGA3 Gm23139-201ENSMUST00000179454 132 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Lrrtm2Q8BGA3 Gm21304-201ENSMUST00000180568 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Lrrtm2Q8BGA3 Gm21293-202ENSMUST00000180664 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Lrrtm2Q8BGA3 Gm4340-202ENSMUST00000181036 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Lrrtm2Q8BGA3 Gm21312-203ENSMUST00000181239 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Lrrtm2Q8BGA3 Gm4340-203ENSMUST00000181615 1258 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Lrrtm2Q8BGA3 Gm20765-203ENSMUST00000181707 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Lrrtm2Q8BGA3 4930467D21Rik-202ENSMUST00000181724 570 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Lrrtm2Q8BGA3 Mir6989-201ENSMUST00000184812 65 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Lrrtm2Q8BGA3 Gm29464-201ENSMUST00000187692 513 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5103-201ENSMUST00000192081 1086 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Lrrtm2Q8BGA3 Fcer1a-202ENSMUST00000193017 826 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43057-201ENSMUST00000196789 429 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Lrrtm2Q8BGA3 Gm8182-201ENSMUST00000197863 769 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Lrrtm2Q8BGA3 Gm19590-201ENSMUST00000201551 1195 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Lrrtm2Q8BGA3 Gm42963-201ENSMUST00000202943 1217 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45045-201ENSMUST00000207368 218 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Lrrtm2Q8BGA3 4933402C06Rik-203ENSMUST00000207559 1227 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Lrrtm2Q8BGA3 Gm18789-201ENSMUST00000216115 550 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Lrrtm2Q8BGA3 Gm10037-203ENSMUST00000221620 636 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Lrrtm2Q8BGA3 CT009742.1-201ENSMUST00000222507 702 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Lrrtm2Q8BGA3 AC156790.1-201ENSMUST00000226572 559 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Lrrtm2Q8BGA3 Frg1-201ENSMUST00000033999 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Lrrtm2Q8BGA3 Klre1-201ENSMUST00000053708 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Lrrtm2Q8BGA3 Npm2-201ENSMUST00000062629 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Lrrtm2Q8BGA3 Vmn1r53-201ENSMUST00000076086 1122 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Lrrtm2Q8BGA3 Vmn1r37-201ENSMUST00000077482 909 ntAPPRIS P2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26130-201ENSMUST00000083171 138 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Lrrtm2Q8BGA3 Rnase6-201ENSMUST00000095923 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr633-201ENSMUST00000098188 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Lrrtm2Q8BGA3 Sult2a3-201ENSMUST00000098809 1018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem267-201ENSMUST00000099147 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr1044-201ENSMUST00000099906 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Lrrtm2Q8BGA3 Scn8a-205ENSMUST00000108910 11232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15448-201ENSMUST00000094911 1557 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Lrrtm2Q8BGA3 Rfx4-205ENSMUST00000166696 3332 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.4 ms