Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Gm36756-201ENSMUST00000222011 1214 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CtifQ6PEE2 Gm19154-201ENSMUST00000223330 940 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CtifQ6PEE2 AC124715.2-201ENSMUST00000226762 617 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CtifQ6PEE2 H2-M11-201ENSMUST00000041964 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
CtifQ6PEE2 9230110F15Rik-201ENSMUST00000054175 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
CtifQ6PEE2 Gm5341-201ENSMUST00000058881 489 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CtifQ6PEE2 Olfr432-201ENSMUST00000062665 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CtifQ6PEE2 Nme5-201ENSMUST00000079287 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
CtifQ6PEE2 Glra4-201ENSMUST00000018739 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
CtifQ6PEE2 Kcnrg-202ENSMUST00000225582 1821 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CtifQ6PEE2 Zfp930-204ENSMUST00000212681 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CtifQ6PEE2 Nfatc3-206ENSMUST00000212742 3207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
CtifQ6PEE2 Serpinb5-203ENSMUST00000112730 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
CtifQ6PEE2 Sytl5-202ENSMUST00000086165 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
CtifQ6PEE2 Vmn2r42-201ENSMUST00000086282 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
CtifQ6PEE2 Dclre1c-204ENSMUST00000115066 3828 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
CtifQ6PEE2 Rpgr-201ENSMUST00000044598 3805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
CtifQ6PEE2 AC153501.1-201ENSMUST00000218156 1860 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CtifQ6PEE2 Nyap2-204ENSMUST00000123720 3471 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
CtifQ6PEE2 Tshr-202ENSMUST00000021346 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
CtifQ6PEE2 Olfr20-202ENSMUST00000120137 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.24
CtifQ6PEE2 4933406L23Rik-201ENSMUST00000203567 1509 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CtifQ6PEE2 Clec1a-202ENSMUST00000203162 5128 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
CtifQ6PEE2 Gm37775-201ENSMUST00000194120 2313 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CtifQ6PEE2 Ranbp17-201ENSMUST00000037522 3950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
CtifQ6PEE2 Pole-201ENSMUST00000007296 7163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
CtifQ6PEE2 Rs1-201ENSMUST00000033650 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
CtifQ6PEE2 Gm32736-201ENSMUST00000200427 2701 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
CtifQ6PEE2 Gm12604-201ENSMUST00000118382 380 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CtifQ6PEE2 Gm11907-201ENSMUST00000118918 1007 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CtifQ6PEE2 Zfp113-202ENSMUST00000132318 488 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CtifQ6PEE2 Gm15792-201ENSMUST00000137099 769 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CtifQ6PEE2 Gm16573-201ENSMUST00000160334 801 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CtifQ6PEE2 Gm7247-201ENSMUST00000162998 1157 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CtifQ6PEE2 Gm25026-201ENSMUST00000175017 188 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CtifQ6PEE2 Vmn1r-ps18-201ENSMUST00000176901 876 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CtifQ6PEE2 Gm27019-201ENSMUST00000183056 404 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CtifQ6PEE2 Gm18970-201ENSMUST00000186040 938 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CtifQ6PEE2 4930599A14Rik-201ENSMUST00000186724 387 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
CtifQ6PEE2 1700096J18Rik-201ENSMUST00000190043 482 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
CtifQ6PEE2 B230110G15Rik-201ENSMUST00000190868 772 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
CtifQ6PEE2 Gm43243-201ENSMUST00000199964 278 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CtifQ6PEE2 Gm43894-201ENSMUST00000203274 688 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CtifQ6PEE2 Gm20177-201ENSMUST00000203705 334 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CtifQ6PEE2 Gm44176-201ENSMUST00000204336 276 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CtifQ6PEE2 AC133598.4-201ENSMUST00000224577 454 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CtifQ6PEE2 Gm28392-201ENSMUST00000077630 393 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CtifQ6PEE2 Olfr1510-201ENSMUST00000079459 1014 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CtifQ6PEE2 Olfr224-201ENSMUST00000081102 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CtifQ6PEE2 CT025639.1-201ENSMUST00000223906 1375 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CtifQ6PEE2 Fbxo3-204ENSMUST00000111136 4211 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
CtifQ6PEE2 Psg20-202ENSMUST00000108482 1871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CtifQ6PEE2 Fap-209ENSMUST00000174448 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CtifQ6PEE2 Spag9-203ENSMUST00000075695 6910 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
CtifQ6PEE2 Fundc2-201ENSMUST00000033541 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
CtifQ6PEE2 Ctage5-217ENSMUST00000176892 2784 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
CtifQ6PEE2 Npy2r-201ENSMUST00000029633 3364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CtifQ6PEE2 Serpinb9-202ENSMUST00000063191 3472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CtifQ6PEE2 Rnf24-204ENSMUST00000165420 5833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CtifQ6PEE2 Gm45520-201ENSMUST00000210109 2031 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CtifQ6PEE2 Gm6823-201ENSMUST00000120791 1839 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CtifQ6PEE2 Obox3-202ENSMUST00000095217 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
CtifQ6PEE2 Olfr570-202ENSMUST00000209778 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CtifQ6PEE2 Gm11346-204ENSMUST00000149751 2893 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
CtifQ6PEE2 Gm5546-201ENSMUST00000056145 2777 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
CtifQ6PEE2 Arhgef12-201ENSMUST00000072767 10059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
CtifQ6PEE2 Cps1-201ENSMUST00000027144 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
CtifQ6PEE2 Pramel7-201ENSMUST00000026957 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
CtifQ6PEE2 Itch-202ENSMUST00000109685 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
CtifQ6PEE2 Slc26a3-201ENSMUST00000001254 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
CtifQ6PEE2 Gm37876-201ENSMUST00000194490 1591 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
CtifQ6PEE2 Olfr488-202ENSMUST00000211508 4624 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CtifQ6PEE2 Olfr488-203ENSMUST00000215173 4605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CtifQ6PEE2 Vmn1r90-203ENSMUST00000226510 6674 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CtifQ6PEE2 Mir708-201ENSMUST00000102189 109 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CtifQ6PEE2 Ighv9-1-201ENSMUST00000103471 294 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CtifQ6PEE2 Ighv9-2-201ENSMUST00000103472 351 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CtifQ6PEE2 Gm25273-201ENSMUST00000104295 115 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CtifQ6PEE2 Smt3h1-ps-201ENSMUST00000117126 280 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CtifQ6PEE2 Gm11462-201ENSMUST00000117749 562 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CtifQ6PEE2 Gm13038-201ENSMUST00000119886 459 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CtifQ6PEE2 Gm13338-201ENSMUST00000120235 361 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CtifQ6PEE2 Gm15049-201ENSMUST00000120474 463 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CtifQ6PEE2 Tmem216-203ENSMUST00000123788 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CtifQ6PEE2 1700054M17Rik-201ENSMUST00000125654 445 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
CtifQ6PEE2 4930594O21Rik-202ENSMUST00000144981 682 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CtifQ6PEE2 Gm15445-201ENSMUST00000146700 603 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CtifQ6PEE2 Zfp652os-201ENSMUST00000155531 537 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
CtifQ6PEE2 Gm24647-201ENSMUST00000157112 113 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CtifQ6PEE2 Gm22730-201ENSMUST00000158085 171 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CtifQ6PEE2 Gm17217-201ENSMUST00000166613 469 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CtifQ6PEE2 4930445B16Rik-201ENSMUST00000170085 1123 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
CtifQ6PEE2 4833412C05Rik-201ENSMUST00000181235 1083 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
CtifQ6PEE2 Gm21430-201ENSMUST00000182998 998 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CtifQ6PEE2 Gm28006-201ENSMUST00000183841 122 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CtifQ6PEE2 1700029B22Rik-202ENSMUST00000186532 694 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
CtifQ6PEE2 9930111H07Rik-201ENSMUST00000187270 821 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
CtifQ6PEE2 1700029M03Rik-202ENSMUST00000187517 357 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
CtifQ6PEE2 1700122H20Rik-201ENSMUST00000188950 421 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
CtifQ6PEE2 Gm29036-201ENSMUST00000189967 877 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.9 ms