Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

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Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Zfp78-203ENSMUST00000207314 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Usp49Q6P9L4 Slc6a14-201ENSMUST00000033414 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Usp49Q6P9L4 Satb1-214ENSMUST00000176669 4407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Usp49Q6P9L4 Ccdc191-203ENSMUST00000132859 3779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Olfr458-202ENSMUST00000216650 1799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Mcm7-208ENSMUST00000148879 1351 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Kcnj16-201ENSMUST00000106635 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Vmn1r86-202ENSMUST00000226604 6378 ntAPPRIS P2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 CT025535.2-201ENSMUST00000228572 7441 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Zfp266-201ENSMUST00000068296 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Olfr1038-ps-202ENSMUST00000216665 4530 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Pabpc4l-202ENSMUST00000192793 5252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Gm43410-201ENSMUST00000197510 2234 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Mbd5-201ENSMUST00000047413 8543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Gm37863-201ENSMUST00000194911 1457 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Trim43b-202ENSMUST00000189557 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Mir674-201ENSMUST00000102421 100 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Sult2a7-201ENSMUST00000108524 897 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Gm14503-201ENSMUST00000130337 1164 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Gm12629-201ENSMUST00000145751 711 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 E130111B04Rik-201ENSMUST00000156781 450 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Gm26353-201ENSMUST00000158224 255 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Gm15809-201ENSMUST00000159361 661 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Obox4-ps30-201ENSMUST00000176032 948 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 4930532G15Rik-201ENSMUST00000180632 699 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Gm27207-201ENSMUST00000184995 878 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 6030442E23Rik-201ENSMUST00000186618 642 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 1810041H14Rik-203ENSMUST00000187773 416 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Gm29383-201ENSMUST00000188284 480 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Gm37493-201ENSMUST00000193167 433 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Gm32585-201ENSMUST00000198586 764 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Gm43849-201ENSMUST00000201086 215 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Gm43124-201ENSMUST00000201878 278 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 9530003J23Rik-201ENSMUST00000020392 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Ndufa4-204ENSMUST00000204714 452 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Gm45279-201ENSMUST00000210315 391 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Sult2a7-204ENSMUST00000211740 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Gm31013-201ENSMUST00000213576 715 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 4933432G23Rik-201ENSMUST00000213675 840 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 AC151904.5-201ENSMUST00000218975 549 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 9230112D13Rik-201ENSMUST00000022325 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 AC133958.1-201ENSMUST00000227085 961 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Tpx2-207ENSMUST00000178997 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Gsdmc4-201ENSMUST00000063530 1988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Pik3c2g-212ENSMUST00000190962 1774 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Zfp110-205ENSMUST00000168247 2499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Xrn1-201ENSMUST00000034981 5499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Olfr115-202ENSMUST00000221552 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Olfr115-203ENSMUST00000223366 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Dpcr1-201ENSMUST00000095467 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Adgrl3-207ENSMUST00000118078 4871 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Bcas3os1-202ENSMUST00000151652 3138 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Gm45528-201ENSMUST00000209854 3145 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Nlrp1a-202ENSMUST00000108518 3767 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Pecam1-204ENSMUST00000106796 3441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Gm37347-201ENSMUST00000193969 3071 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 A230028O05Rik-201ENSMUST00000181655 2793 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Ampd3-201ENSMUST00000005829 4094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Olfr1160-202ENSMUST00000215457 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Itch-201ENSMUST00000029126 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Vmn2r-ps159-203ENSMUST00000189559 2560 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Zfp607a-202ENSMUST00000205534 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Gm8281-201ENSMUST00000100893 612 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Gm24048-201ENSMUST00000102411 106 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Gm9311-201ENSMUST00000118042 1269 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Gm13333-201ENSMUST00000119424 781 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Gm6461-201ENSMUST00000120015 633 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
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Usp49Q6P9L4 Six3os1-204ENSMUST00000161688 567 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Gm23810-201ENSMUST00000175150 74 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
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Usp49Q6P9L4 Gm26238-201ENSMUST00000175538 117 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Gm8237-202ENSMUST00000178594 447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Gm27156-201ENSMUST00000184589 754 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Gm29197-201ENSMUST00000185922 702 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 1110003F10Rik-201ENSMUST00000199441 767 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Olfr1289-202ENSMUST00000207494 1014 ntAPPRIS P2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Gm44812-202ENSMUST00000208999 1285 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Olfr976-203ENSMUST00000217360 1164 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Gm7252-201ENSMUST00000223284 456 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 AC165106.1-201ENSMUST00000227580 408 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Cd48-202ENSMUST00000068584 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Vmn1r218-201ENSMUST00000074992 897 ntAPPRIS P2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Gm26899-201ENSMUST00000181963 3328 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Vmn1r52-204ENSMUST00000227578 2370 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Olfr1440-202ENSMUST00000213657 7588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Zfp804b-201ENSMUST00000164784 3924 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Gm10309-201ENSMUST00000095186 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Olfr1254-203ENSMUST00000216587 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Adam28-203ENSMUST00000224039 2638 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Tph1-201ENSMUST00000049298 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Heph-201ENSMUST00000033553 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Gm5084-202ENSMUST00000224064 3609 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Clasp1-201ENSMUST00000049404 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 2310039L15Rik-202ENSMUST00000219492 3743 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Gm37940-201ENSMUST00000194243 3251 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Gm42763-201ENSMUST00000199595 2087 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Gm15448-205ENSMUST00000189095 1905 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Smim15-201ENSMUST00000095458 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
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