Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Iglc2-201ENSMUST00000103749 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Rpl35a-ps5-201ENSMUST00000137013 333 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Gm5353-201ENSMUST00000139800 793 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Tbata-207ENSMUST00000140456 953 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Tbata-208ENSMUST00000143207 982 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Gm8439-201ENSMUST00000171482 420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Gm44-201ENSMUST00000172155 993 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Mir3110-201ENSMUST00000175053 80 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Gm29470-201ENSMUST00000188007 696 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Gm35323-201ENSMUST00000191836 499 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Olrf445-ps1-201ENSMUST00000204960 314 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 4921513I08Rik-201ENSMUST00000206993 866 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Gm2788-207ENSMUST00000211055 1078 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Gm45391-201ENSMUST00000211563 576 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 AC155941.1-201ENSMUST00000220223 529 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 AC107663.1-201ENSMUST00000224257 468 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Prl2c3-201ENSMUST00000099805 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Trim30b-204ENSMUST00000164410 3042 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Pde10a-207ENSMUST00000115722 3673 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Myo7a-202ENSMUST00000107122 6867 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Abhd2-201ENSMUST00000037315 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Gm43880-201ENSMUST00000203635 2162 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Oasl2-201ENSMUST00000031542 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Gm3510-201ENSMUST00000180447 1455 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Gm45182-201ENSMUST00000207579 2404 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Eps15-201ENSMUST00000030281 2980 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Dglucy-208ENSMUST00000167322 2941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Med13l-202ENSMUST00000201010 7781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Lyg2-201ENSMUST00000078307 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Ptprr-202ENSMUST00000105271 2856 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Stt3a-201ENSMUST00000120381 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Gm12051-201ENSMUST00000147771 1341 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Ufm1-202ENSMUST00000122330 637 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Gm12531-201ENSMUST00000126099 487 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Gm16157-202ENSMUST00000135564 1082 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Gm28846-201ENSMUST00000189161 368 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Gm38022-201ENSMUST00000191762 403 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Gm37336-201ENSMUST00000192794 760 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Gm33601-201ENSMUST00000210001 961 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Gm4510-201ENSMUST00000218265 427 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 AC138329.1-201ENSMUST00000225040 471 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Tceal8-201ENSMUST00000060101 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Mir135a-1-201ENSMUST00000083473 90 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 A330076H08Rik-202ENSMUST00000207694 1836 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Gm6614-202ENSMUST00000181628 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Gm37121-201ENSMUST00000192219 2556 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Ddb1-201ENSMUST00000025649 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Xlr5a-203ENSMUST00000114521 1474 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Inpp5d-208ENSMUST00000167032 4125 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Gm44101-201ENSMUST00000203951 2221 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Pfkfb3-214ENSMUST00000179584 4756 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Sc5d-201ENSMUST00000052725 4787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Inpp5f-203ENSMUST00000118605 3220 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Zfp780b-203ENSMUST00000205874 1907 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Slc38a1-203ENSMUST00000100262 7752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Tmem232-201ENSMUST00000062161 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Fam205a1-201ENSMUST00000107979 4146 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 AC123629.1-201ENSMUST00000225669 1364 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Celf1-208ENSMUST00000111455 7579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Golph3l-207ENSMUST00000177390 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 4930509K18Rik-201ENSMUST00000144039 1810 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Grm8-203ENSMUST00000115324 3299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Ctnnd1-217ENSMUST00000111691 5380 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Gm45407-201ENSMUST00000209499 3676 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Ugt1a6b-201ENSMUST00000113137 2249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 C1s1-203ENSMUST00000160505 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Olfr259-203ENSMUST00000215828 4095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Gm24790-201ENSMUST00000104285 132 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Gm24473-201ENSMUST00000104483 131 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Gm8812-201ENSMUST00000118496 412 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Gm15763-201ENSMUST00000120136 403 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Dnajc19-ps-201ENSMUST00000120890 351 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Gm6451-201ENSMUST00000121488 717 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Gm11804-201ENSMUST00000121663 468 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Gm17472-201ENSMUST00000167638 352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Gm7426-201ENSMUST00000179046 404 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Gm29234-201ENSMUST00000187452 1262 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Gm38250-201ENSMUST00000192691 766 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Gm18600-201ENSMUST00000207205 505 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
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NipblQ6KCD5 Gm45589-201ENSMUST00000209366 895 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Gm17999-201ENSMUST00000211568 542 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Gm39348-202ENSMUST00000217239 375 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Gm33728-201ENSMUST00000217285 546 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Gm40658-202ENSMUST00000221900 701 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 FAM237A-201ENSMUST00000226288 1105 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Snhg17-209ENSMUST00000186993 3144 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Gm4951-201ENSMUST00000031549 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Gm42669-202ENSMUST00000160160 3080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Gm37410-201ENSMUST00000193623 3039 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Vmn2r114-201ENSMUST00000168033 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Greb1-203ENSMUST00000159120 6346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Fmr1-202ENSMUST00000114653 4058 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Arpp21-202ENSMUST00000070218 3181 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Ppp1r7-201ENSMUST00000027494 10315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Tbc1d24-203ENSMUST00000097376 7265 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Polk-204ENSMUST00000221645 1644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Klhl23-201ENSMUST00000053087 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Col6a6-201ENSMUST00000060896 3954 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Gm17751-201ENSMUST00000189132 2004 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
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