Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Olfr108-201ENSMUST00000078207 1038 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r30-201ENSMUST00000078890 1053 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Yae1d1-201ENSMUST00000099735 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm20356-201ENSMUST00000193390 2477 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm12043-201ENSMUST00000131570 2788 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1204-202ENSMUST00000213283 6935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 A230108P19Rik-201ENSMUST00000151782 2500 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 1700071M16Rik-203ENSMUST00000169733 2504 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Zfy2-202ENSMUST00000187148 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm26603-201ENSMUST00000181380 2861 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Spag17os-202ENSMUST00000145279 3219 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm37880-201ENSMUST00000192216 3257 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Naip3-201ENSMUST00000118082 4208 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Psd3-214ENSMUST00000212960 4562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Cd200r3-203ENSMUST00000114611 1407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Gp6-202ENSMUST00000206928 5900 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm6356-201ENSMUST00000166618 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 AC117608.1-201ENSMUST00000225500 3418 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Pcdh11x-203ENSMUST00000113364 4454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Clec4e-201ENSMUST00000032239 2518 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r6-202ENSMUST00000226689 8453 ntAPPRIS P2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Trav8d-1-201ENSMUST00000103580 400 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm23358-201ENSMUST00000103887 110 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm25760-201ENSMUST00000103989 132 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Smim8-205ENSMUST00000108134 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Mir669e-201ENSMUST00000117003 119 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm6491-201ENSMUST00000118273 990 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm13254-201ENSMUST00000118295 654 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm11761-201ENSMUST00000121392 445 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 n-R5s76-201ENSMUST00000122700 113 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 0610043K17Rik-201ENSMUST00000123107 614 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm12665-201ENSMUST00000126063 541 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm13663-202ENSMUST00000145563 643 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Ntpcr-208ENSMUST00000152189 822 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm22811-201ENSMUST00000157468 154 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm25721-201ENSMUST00000157496 171 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm25266-201ENSMUST00000158521 304 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm24057-201ENSMUST00000158616 302 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm9141-201ENSMUST00000159355 1007 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm3585-201ENSMUST00000173438 875 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm20617-201ENSMUST00000177082 717 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 1700029M03Rik-202ENSMUST00000187517 357 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm28728-201ENSMUST00000189087 405 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Avpr1b-202ENSMUST00000190410 623 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Ccl24-202ENSMUST00000201401 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm26911-203ENSMUST00000204781 369 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 BC024386-202ENSMUST00000209496 851 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm45335-201ENSMUST00000210618 401 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm6581-201ENSMUST00000214545 260 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1065-203ENSMUST00000216165 992 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 AC151971.2-201ENSMUST00000217540 909 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 AC152819.1-201ENSMUST00000220435 871 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 AC124450.1-201ENSMUST00000225569 495 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Ppbp-201ENSMUST00000031319 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 1700011L22Rik-201ENSMUST00000034109 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 n-R5s60-201ENSMUST00000083299 119 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 n-R5s89-201ENSMUST00000083532 104 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Olfr461-201ENSMUST00000089490 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1330-201ENSMUST00000094830 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1087-201ENSMUST00000099877 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1087-202ENSMUST00000214141 3861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Anxa1-201ENSMUST00000025561 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Zfp850-202ENSMUST00000180024 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm26730-201ENSMUST00000181270 1338 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm10258-201ENSMUST00000091270 2123 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 CT009757.4-201ENSMUST00000221520 2541 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm9938-201ENSMUST00000067077 1756 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Mug1-201ENSMUST00000032228 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Pln-206ENSMUST00000220197 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Fbxw25-201ENSMUST00000163839 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Atf2-205ENSMUST00000112010 4037 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Atf2-202ENSMUST00000090802 4016 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Syt14-205ENSMUST00000215093 9274 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Spag17os-201ENSMUST00000137776 2437 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm5286-201ENSMUST00000159524 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Mttp-201ENSMUST00000029805 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Zim1-202ENSMUST00000122432 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Fam26d-202ENSMUST00000218239 3075 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Ipo5-201ENSMUST00000032898 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1273-ps-201ENSMUST00000214356 4698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Vmn2r28-201ENSMUST00000086297 3785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Mir675-201ENSMUST00000102320 84 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Ighv1-53-201ENSMUST00000103523 351 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Ighv1-69-201ENSMUST00000103539 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm25276-201ENSMUST00000104300 124 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm17184-201ENSMUST00000111864 462 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm11951-201ENSMUST00000116005 431 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Gstm2-201ENSMUST00000012348 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc142os-201ENSMUST00000125657 891 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm13206-201ENSMUST00000129579 1090 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm13838-201ENSMUST00000132130 531 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 1700034H15Rik-205ENSMUST00000154116 926 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm25722-201ENSMUST00000157498 279 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm17122-201ENSMUST00000166047 372 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Vmn2r-ps131-201ENSMUST00000176094 1046 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm4373-201ENSMUST00000178571 556 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 6030442E23Rik-201ENSMUST00000186618 642 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 1700025H01Rik-201ENSMUST00000187479 547 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm19124-201ENSMUST00000191041 832 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Txndc9-203ENSMUST00000192960 472 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms