Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Gm45530-201ENSMUST00000211658 225 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Lrrc43Q3V0L5 CAAA01216754.4-202ENSMUST00000215276 610 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Lrrc43Q3V0L5 AL603745.1-201ENSMUST00000215473 532 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Lrrc43Q3V0L5 Gm34005-201ENSMUST00000215834 282 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Lrrc43Q3V0L5 Gm9289-201ENSMUST00000221269 606 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Lrrc43Q3V0L5 Gm36862-202ENSMUST00000222758 1051 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lrrc43Q3V0L5 A930023M06Rik-201ENSMUST00000223270 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Lrrc43Q3V0L5 AC139209.2-201ENSMUST00000227680 1208 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Lrrc43Q3V0L5 Prl2c1-201ENSMUST00000054932 681 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lrrc43Q3V0L5 Tcaf1-203ENSMUST00000121083 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lrrc43Q3V0L5 Amotl1-206ENSMUST00000223132 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Lrrc43Q3V0L5 Cacna1c-217ENSMUST00000188865 6519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lrrc43Q3V0L5 9130221F21Rik-201ENSMUST00000206867 2631 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lrrc43Q3V0L5 Hdac7-208ENSMUST00000121514 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lrrc43Q3V0L5 Lipg-201ENSMUST00000066532 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lrrc43Q3V0L5 Rp1l1-201ENSMUST00000058229 6684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Lrrc43Q3V0L5 Zfp82-207ENSMUST00000183190 1906 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lrrc43Q3V0L5 Ipo11-202ENSMUST00000080856 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lrrc43Q3V0L5 Scml2-204ENSMUST00000087090 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lrrc43Q3V0L5 Vmn1r-ps128-201ENSMUST00000121211 1739 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
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Lrrc43Q3V0L5 Zfp936-203ENSMUST00000202535 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lrrc43Q3V0L5 Gimap8-203ENSMUST00000203509 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lrrc43Q3V0L5 Trim39-205ENSMUST00000173369 2914 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Lrrc43Q3V0L5 Greb1-201ENSMUST00000048064 7940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Lrrc43Q3V0L5 Zfp667-205ENSMUST00000170776 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Lrrc43Q3V0L5 A630012P03Rik-202ENSMUST00000114854 1974 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
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Lrrc43Q3V0L5 Wnk1-224ENSMUST00000203030 8163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
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Lrrc43Q3V0L5 Snx32-201ENSMUST00000070172 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Lrrc43Q3V0L5 Adcy4-201ENSMUST00000002398 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Lrrc43Q3V0L5 Stx8-203ENSMUST00000108675 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
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Lrrc43Q3V0L5 Rtp1-201ENSMUST00000038730 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Lrrc43Q3V0L5 Gm37170-201ENSMUST00000194488 1934 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Lrrc43Q3V0L5 Ednrb-201ENSMUST00000022718 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
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Lrrc43Q3V0L5 Olfr402-201ENSMUST00000073675 1012 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
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Lrrc43Q3V0L5 Acbd5-201ENSMUST00000028121 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Lrrc43Q3V0L5 Zfp541-203ENSMUST00000210805 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Lrrc43Q3V0L5 Kif1b-203ENSMUST00000060537 10233 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Lrrc43Q3V0L5 4921511C20Rik-201ENSMUST00000051530 1606 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Lrrc43Q3V0L5 Myo9a-206ENSMUST00000136740 12252 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Lrrc43Q3V0L5 Cops2-201ENSMUST00000028635 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
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Lrrc43Q3V0L5 Nlgn1-205ENSMUST00000193603 11807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Lrrc43Q3V0L5 Gm26797-202ENSMUST00000213132 2562 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Lrrc43Q3V0L5 Gm44553-201ENSMUST00000206316 2037 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Lrrc43Q3V0L5 4933415A04Rik-201ENSMUST00000056256 2009 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Lrrc43Q3V0L5 C230057M02Rik-201ENSMUST00000212334 3306 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Lrrc43Q3V0L5 Gm18432-201ENSMUST00000195568 1451 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Lrrc43Q3V0L5 Kin-201ENSMUST00000042512 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Lrrc43Q3V0L5 Gm5114-201ENSMUST00000108017 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Lrrc43Q3V0L5 Fxr1-208ENSMUST00000200392 3014 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Lrrc43Q3V0L5 Lhx6-202ENSMUST00000112961 3292 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Lrrc43Q3V0L5 Ptprc-207ENSMUST00000183301 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Lrrc43Q3V0L5 Gm7919-201ENSMUST00000202043 1389 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Lrrc43Q3V0L5 Daam1-205ENSMUST00000223272 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
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