Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD6

Snx27, Sorting nexin-27, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx27Q3UHD6 Zfp27-206ENSMUST00000172448 2460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Snx27Q3UHD6 Usp8-201ENSMUST00000028841 4145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Snx27Q3UHD6 Tm9sf4-201ENSMUST00000089027 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Snx27Q3UHD6 Gm4952-201ENSMUST00000092931 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Snx27Q3UHD6 Fmn1-209ENSMUST00000161731 4262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Snx27Q3UHD6 Prrg1-201ENSMUST00000114024 3900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Snx27Q3UHD6 Stra6l-203ENSMUST00000107783 3669 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Snx27Q3UHD6 Gm37077-201ENSMUST00000195723 3691 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Snx27Q3UHD6 Eaf2-202ENSMUST00000075946 1878 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Snx27Q3UHD6 Zfp870-201ENSMUST00000178401 5126 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Snx27Q3UHD6 Mbnl1-211ENSMUST00000192807 2906 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Snx27Q3UHD6 Nup93-203ENSMUST00000211822 2674 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Snx27Q3UHD6 Tcf7l2-210ENSMUST00000111657 4126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Snx27Q3UHD6 Gm43123-201ENSMUST00000201893 3471 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Snx27Q3UHD6 Ncor1-204ENSMUST00000101066 8852 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Snx27Q3UHD6 Nav1-201ENSMUST00000040599 12767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Snx27Q3UHD6 Tmem229b-202ENSMUST00000070174 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Snx27Q3UHD6 Gm13270-201ENSMUST00000149137 1686 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Snx27Q3UHD6 Ighv12-3-201ENSMUST00000103485 353 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Snx27Q3UHD6 Nr6a1os-201ENSMUST00000129089 645 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Snx27Q3UHD6 Gm22730-201ENSMUST00000158085 171 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Snx27Q3UHD6 Gm4202-201ENSMUST00000169025 733 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Snx27Q3UHD6 Mir3473a-201ENSMUST00000175011 78 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Snx27Q3UHD6 Gm22990-201ENSMUST00000175427 89 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Snx27Q3UHD6 Gm20685-201ENSMUST00000176654 489 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Snx27Q3UHD6 Gm9285-201ENSMUST00000177691 697 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Snx27Q3UHD6 Odaph-201ENSMUST00000178614 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Snx27Q3UHD6 Gm27972-201ENSMUST00000184720 137 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Snx27Q3UHD6 Ly6c2-203ENSMUST00000188214 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Snx27Q3UHD6 Gm28846-201ENSMUST00000189161 368 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Snx27Q3UHD6 Olfr1228-201ENSMUST00000190757 1094 ntAPPRIS P2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Snx27Q3UHD6 Gm28564-201ENSMUST00000190864 240 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Snx27Q3UHD6 Gm43235-201ENSMUST00000200121 297 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Snx27Q3UHD6 AC165349.1-201ENSMUST00000217896 424 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Snx27Q3UHD6 AC163660.1-201ENSMUST00000223696 818 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Snx27Q3UHD6 AC138329.1-201ENSMUST00000225040 471 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Snx27Q3UHD6 CT009711.2-201ENSMUST00000225352 934 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Snx27Q3UHD6 Rps19-ps4-201ENSMUST00000091925 438 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Snx27Q3UHD6 Apobec3-203ENSMUST00000165537 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Snx27Q3UHD6 Zfp59-201ENSMUST00000108331 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Snx27Q3UHD6 Pcmtd2-202ENSMUST00000108754 3499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Snx27Q3UHD6 Vmn1r22-201ENSMUST00000227342 3057 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Snx27Q3UHD6 Vmn1r22-204ENSMUST00000228257 3079 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Snx27Q3UHD6 Olfr15-202ENSMUST00000214238 6135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Snx27Q3UHD6 Zfp239-207ENSMUST00000172088 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Snx27Q3UHD6 Gm37595-201ENSMUST00000192668 1742 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Snx27Q3UHD6 AC165260.6-206ENSMUST00000223884 3698 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Snx27Q3UHD6 Ceacam2-203ENSMUST00000066503 3140 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Snx27Q3UHD6 C330024D21Rik-202ENSMUST00000202634 2020 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Snx27Q3UHD6 Prokr2-201ENSMUST00000049997 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Snx27Q3UHD6 Iqch-202ENSMUST00000080527 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Snx27Q3UHD6 Scd1-201ENSMUST00000041331 4836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Snx27Q3UHD6 Baz2b-201ENSMUST00000090925 7576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Snx27Q3UHD6 Msantd4-202ENSMUST00000212075 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Snx27Q3UHD6 Cmah-207ENSMUST00000224657 3124 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Snx27Q3UHD6 Chm-202ENSMUST00000113388 4749 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Snx27Q3UHD6 Zfp37-204ENSMUST00000220873 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Snx27Q3UHD6 AC164623.1-201ENSMUST00000217947 2709 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Snx27Q3UHD6 Gm28587-201ENSMUST00000187181 3005 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Snx27Q3UHD6 Nat8f4-201ENSMUST00000095757 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Snx27Q3UHD6 Rapgef5-201ENSMUST00000109691 6746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Snx27Q3UHD6 Mdc1-201ENSMUST00000082337 7335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Snx27Q3UHD6 Mir92b-201ENSMUST00000102300 83 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Snx27Q3UHD6 Ighv2-7-201ENSMUST00000103456 355 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Snx27Q3UHD6 Gm15000-201ENSMUST00000118275 1243 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Snx27Q3UHD6 Gm12713-201ENSMUST00000118404 764 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Snx27Q3UHD6 Gm11796-201ENSMUST00000120208 972 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Snx27Q3UHD6 1700027A07Rik-201ENSMUST00000150472 458 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Snx27Q3UHD6 Gm13322-201ENSMUST00000152803 246 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
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Snx27Q3UHD6 Mir199b-201ENSMUST00000175066 110 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Snx27Q3UHD6 Gm5871-201ENSMUST00000176461 718 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Snx27Q3UHD6 Klk1b7-ps-202ENSMUST00000183762 619 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Snx27Q3UHD6 Gm35323-201ENSMUST00000191836 499 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
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Snx27Q3UHD6 1700054O19Rik-201ENSMUST00000193604 868 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Snx27Q3UHD6 Gm37637-201ENSMUST00000195540 1256 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Snx27Q3UHD6 Gm43400-201ENSMUST00000197294 1254 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Snx27Q3UHD6 Gm38840-201ENSMUST00000204716 843 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Snx27Q3UHD6 Gm9367-201ENSMUST00000205703 546 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Snx27Q3UHD6 4933432G23Rik-201ENSMUST00000213675 840 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Snx27Q3UHD6 Gm5119-201ENSMUST00000215858 634 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Snx27Q3UHD6 AC160962.1-202ENSMUST00000225859 1116 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Snx27Q3UHD6 Ugt2b37-201ENSMUST00000075858 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Snx27Q3UHD6 Platr26-201ENSMUST00000079720 641 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Snx27Q3UHD6 Zfp560-201ENSMUST00000068079 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Snx27Q3UHD6 Lin54-204ENSMUST00000137750 4056 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Snx27Q3UHD6 Slmap-202ENSMUST00000090359 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Snx27Q3UHD6 Gm5361-201ENSMUST00000211041 1498 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Snx27Q3UHD6 Exoc2-201ENSMUST00000021785 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Snx27Q3UHD6 Serpinb6c-202ENSMUST00000172184 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Snx27Q3UHD6 Olfr1106-202ENSMUST00000213781 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Snx27Q3UHD6 Olfr1106-203ENSMUST00000217650 2573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Snx27Q3UHD6 Kmo-202ENSMUST00000097458 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Snx27Q3UHD6 9930111J21Rik2-201ENSMUST00000093152 2403 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Snx27Q3UHD6 9930111J21Rik1-201ENSMUST00000093153 2403 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Snx27Q3UHD6 Gm43769-201ENSMUST00000201871 4323 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Snx27Q3UHD6 Gja10-201ENSMUST00000056517 2117 ntAPPRIS P2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Snx27Q3UHD6 Mkl2-204ENSMUST00000149359 8295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
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