Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 Gm37024-201ENSMUST00000192224 868 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Puf60Q3UEB3 Gm37285-201ENSMUST00000194465 1139 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Puf60Q3UEB3 Gm43033-201ENSMUST00000199682 425 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Puf60Q3UEB3 Gm31305-202ENSMUST00000200435 761 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Puf60Q3UEB3 Gm42673-201ENSMUST00000202676 337 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Puf60Q3UEB3 Gm44538-201ENSMUST00000205615 348 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Puf60Q3UEB3 Olfr574-202ENSMUST00000211329 1039 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Puf60Q3UEB3 4930455C13Rik-201ENSMUST00000218108 1018 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Puf60Q3UEB3 AC125190.2-201ENSMUST00000221160 497 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Puf60Q3UEB3 AC192334.1-201ENSMUST00000221832 1268 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Puf60Q3UEB3 AC159301.1-202ENSMUST00000225860 2133 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Puf60Q3UEB3 AC172989.1-201ENSMUST00000226387 513 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Puf60Q3UEB3 Il20-201ENSMUST00000027673 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Puf60Q3UEB3 Dpm2-201ENSMUST00000028151 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Puf60Q3UEB3 1700011L22Rik-201ENSMUST00000034109 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Puf60Q3UEB3 Olfr399-201ENSMUST00000059440 1003 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Puf60Q3UEB3 Olfr1469-201ENSMUST00000077538 930 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Puf60Q3UEB3 Ssxb5-201ENSMUST00000089370 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Puf60Q3UEB3 Lrrc51-202ENSMUST00000098236 949 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Puf60Q3UEB3 Garnl3-201ENSMUST00000049618 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Puf60Q3UEB3 Naalad2-201ENSMUST00000001826 2831 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Puf60Q3UEB3 Gm15789-201ENSMUST00000118992 1359 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Puf60Q3UEB3 Gm37534-201ENSMUST00000194483 5222 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Puf60Q3UEB3 Slfn9-201ENSMUST00000038211 5769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Puf60Q3UEB3 Gm36380-201ENSMUST00000210339 4379 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Puf60Q3UEB3 Alkbh8-206ENSMUST00000212294 2584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Puf60Q3UEB3 Gm37321-201ENSMUST00000195742 1872 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Puf60Q3UEB3 AC161247.1-201ENSMUST00000217744 2295 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Puf60Q3UEB3 Gm14548-201ENSMUST00000070639 2128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Puf60Q3UEB3 Pfkfb3-206ENSMUST00000114846 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Puf60Q3UEB3 Smurf2-206ENSMUST00000167787 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Puf60Q3UEB3 Ralgapa1-212ENSMUST00000226244 8841 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Puf60Q3UEB3 Slc7a2-204ENSMUST00000118432 3681 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Puf60Q3UEB3 Snhg17-209ENSMUST00000186993 3144 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Puf60Q3UEB3 Eps15-201ENSMUST00000030281 2980 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Puf60Q3UEB3 Scn2b-201ENSMUST00000093855 3958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Puf60Q3UEB3 Gm21671-201ENSMUST00000162387 2421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Puf60Q3UEB3 Eri2-203ENSMUST00000106523 973 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Puf60Q3UEB3 Mir1192-201ENSMUST00000116976 121 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Puf60Q3UEB3 Lrrc72-202ENSMUST00000122115 934 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Puf60Q3UEB3 2210411M09Rik-201ENSMUST00000128545 643 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Puf60Q3UEB3 Gm14272-201ENSMUST00000133525 484 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Puf60Q3UEB3 Olfr760-ps1-201ENSMUST00000172563 748 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Puf60Q3UEB3 Znrf1-215ENSMUST00000174454 494 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Puf60Q3UEB3 Tnfsf10-202ENSMUST00000174840 989 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Puf60Q3UEB3 Ms4a5-202ENSMUST00000186937 816 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Puf60Q3UEB3 Gm37065-201ENSMUST00000191636 444 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Puf60Q3UEB3 Gm37231-201ENSMUST00000191716 621 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Puf60Q3UEB3 Gm38159-202ENSMUST00000194145 621 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Puf60Q3UEB3 Gm37734-201ENSMUST00000194294 621 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Puf60Q3UEB3 Gm36941-202ENSMUST00000194799 621 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Puf60Q3UEB3 Gm37378-202ENSMUST00000195795 621 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Puf60Q3UEB3 Gm37130-202ENSMUST00000195874 621 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Puf60Q3UEB3 Obox4-ps7-201ENSMUST00000196144 505 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Puf60Q3UEB3 Gm43576-201ENSMUST00000197937 871 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Puf60Q3UEB3 AC153729.3-201ENSMUST00000213319 781 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Puf60Q3UEB3 4930401A07Rik-202ENSMUST00000216155 360 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Puf60Q3UEB3 Gm46191-201ENSMUST00000218899 433 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Puf60Q3UEB3 AC211878.6-201ENSMUST00000221896 358 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Puf60Q3UEB3 Olfr1509-201ENSMUST00000045066 1010 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Puf60Q3UEB3 Eri2-202ENSMUST00000063902 1241 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Puf60Q3UEB3 AC165260.6-206ENSMUST00000223884 3698 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Puf60Q3UEB3 Pax6-208ENSMUST00000111088 4427 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Puf60Q3UEB3 Gm37465-201ENSMUST00000192845 3290 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Puf60Q3UEB3 Prpf18-201ENSMUST00000035721 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Puf60Q3UEB3 Gm5177-202ENSMUST00000183337 3785 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Puf60Q3UEB3 Unc79-201ENSMUST00000085079 7762 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Puf60Q3UEB3 Exoc2-202ENSMUST00000102946 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Puf60Q3UEB3 Nphp3-207ENSMUST00000194774 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Puf60Q3UEB3 Pdzd2-201ENSMUST00000075317 10756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Puf60Q3UEB3 C330024D21Rik-203ENSMUST00000202828 1714 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Puf60Q3UEB3 Ctsm-201ENSMUST00000099451 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Puf60Q3UEB3 Ppp1r9a-201ENSMUST00000035813 9547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Puf60Q3UEB3 Gm17203-201ENSMUST00000164379 4017 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Puf60Q3UEB3 Senp1-201ENSMUST00000044189 6575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Puf60Q3UEB3 Adgrl3-205ENSMUST00000117985 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Puf60Q3UEB3 Gatad2b-204ENSMUST00000199607 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Puf60Q3UEB3 4930545L23Rik-201ENSMUST00000138303 2502 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Puf60Q3UEB3 Gm10558-201ENSMUST00000147494 1661 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Puf60Q3UEB3 Pnisr-202ENSMUST00000098238 4407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Puf60Q3UEB3 Olfr1232-203ENSMUST00000215679 2389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Puf60Q3UEB3 Olfr1285-202ENSMUST00000220153 1430 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Puf60Q3UEB3 Gm26807-201ENSMUST00000181132 4363 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Puf60Q3UEB3 Vwde-201ENSMUST00000054530 3979 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Puf60Q3UEB3 Kat6b-203ENSMUST00000112458 997 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Puf60Q3UEB3 Rps12-ps19-201ENSMUST00000119773 400 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Puf60Q3UEB3 Gm12088-201ENSMUST00000137364 520 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Puf60Q3UEB3 Gm12279-201ENSMUST00000142533 294 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Puf60Q3UEB3 Trat1-201ENSMUST00000170861 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Puf60Q3UEB3 Obox6-ps1-201ENSMUST00000176658 1042 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Puf60Q3UEB3 Esp18-201ENSMUST00000179848 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Puf60Q3UEB3 Gm28925-201ENSMUST00000188586 168 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Puf60Q3UEB3 4930540E01Rik-201ENSMUST00000192569 1146 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Puf60Q3UEB3 Gm43351-201ENSMUST00000198737 326 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Puf60Q3UEB3 Gm39463-201ENSMUST00000214575 735 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Puf60Q3UEB3 Gm18914-201ENSMUST00000214625 616 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Puf60Q3UEB3 Gm40932-202ENSMUST00000221315 511 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Puf60Q3UEB3 Gm6575-201ENSMUST00000222946 697 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Puf60Q3UEB3 AC154252.1-201ENSMUST00000226041 473 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Puf60Q3UEB3 Orm1-201ENSMUST00000030044 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.9 ms