Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Aass-201ENSMUST00000031707 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Gm17203-201ENSMUST00000164379 4017 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Gm37863-201ENSMUST00000194911 1457 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Sin3a-201ENSMUST00000049169 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 9430098F02Rik-201ENSMUST00000180832 2986 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Tnik-215ENSMUST00000162777 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Gm11397-201ENSMUST00000050276 1862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Plch1-206ENSMUST00000159676 6560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Mettl6-201ENSMUST00000055303 3946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Gm22774-201ENSMUST00000102084 109 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Ighv14-1-201ENSMUST00000103463 351 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 n-R5s172-201ENSMUST00000104508 114 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Gm14466-201ENSMUST00000119028 451 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Gm12027-201ENSMUST00000146531 949 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Gm24756-201ENSMUST00000177002 96 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 1500004A13Rik-207ENSMUST00000184640 610 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Stpg4-203ENSMUST00000187078 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Gm37383-201ENSMUST00000191750 745 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Gm38373-201ENSMUST00000192042 288 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Gm43147-201ENSMUST00000196944 542 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 2210412B16Rik-201ENSMUST00000201281 498 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Gm21054-201ENSMUST00000203981 380 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Gm44613-201ENSMUST00000205637 877 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Gm44613-202ENSMUST00000205962 691 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Olfr809-203ENSMUST00000218237 1100 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 AC122486.1-201ENSMUST00000221562 196 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 AC154834.1-201ENSMUST00000224697 358 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Olfr809-201ENSMUST00000059891 1100 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Olfr1457-201ENSMUST00000075170 954 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Gm10108-201ENSMUST00000078246 319 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Gm23238-201ENSMUST00000083007 164 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Enpp6-201ENSMUST00000039840 4970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Vmn2r111-201ENSMUST00000092491 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Celf2-202ENSMUST00000100429 7491 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Oprk1-203ENSMUST00000160339 2481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Adgb-204ENSMUST00000172530 5215 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Abca6-201ENSMUST00000044003 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Dsg1c-201ENSMUST00000054128 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 A230028O05Rik-201ENSMUST00000181655 2793 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 6430584L05Rik-201ENSMUST00000204412 3151 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Slc7a12-201ENSMUST00000037321 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Gm14548-201ENSMUST00000070639 2128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Pcdh15-217ENSMUST00000134009 3300 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Clrn3-201ENSMUST00000053716 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Golga3-202ENSMUST00000112512 8132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Cast-210ENSMUST00000223126 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Gnb1-208ENSMUST00000176637 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Gm37621-201ENSMUST00000194716 5531 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Iars-202ENSMUST00000164260 3789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Cmah-207ENSMUST00000224657 3124 ntAPPRIS P1 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Myt1l-202ENSMUST00000049784 7202 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Cenpw-202ENSMUST00000216853 4143 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Olfr90-203ENSMUST00000215195 3060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Trappc8-206ENSMUST00000225661 5191 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Gm25724-201ENSMUST00000104531 117 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Lage3-202ENSMUST00000114152 746 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Gm11903-201ENSMUST00000118958 727 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Gm14531-201ENSMUST00000120845 285 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Gm13237-201ENSMUST00000122151 635 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Crisp2-203ENSMUST00000131699 538 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Gm10130-201ENSMUST00000133235 303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Gm13715-201ENSMUST00000136578 411 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Gm14664-201ENSMUST00000142919 437 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Gm15624-202ENSMUST00000154953 713 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Gm25969-201ENSMUST00000157166 132 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Gm26025-201ENSMUST00000158655 271 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Gm6264-201ENSMUST00000160802 624 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Dcaf1-203ENSMUST00000161758 5539 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Gm28991-201ENSMUST00000186584 543 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Gm28817-201ENSMUST00000187598 830 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Gm43906-201ENSMUST00000203194 906 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Gm45122-201ENSMUST00000206376 784 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 4930465I24Rik-201ENSMUST00000209697 426 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Gm35454-202ENSMUST00000214817 1101 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 AC122327.2-201ENSMUST00000220883 120 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 AC122327.3-201ENSMUST00000221852 120 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 AC127242.3-201ENSMUST00000222009 580 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 AC165157.1-201ENSMUST00000222981 580 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 AC132239.1-201ENSMUST00000223157 773 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 AC166341.1-201ENSMUST00000223360 105 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 AC130217.2-201ENSMUST00000224009 2990 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 AC122459.3-201ENSMUST00000228508 1042 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Rhox3h-201ENSMUST00000096457 1053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Ermard-201ENSMUST00000040594 1571 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Tmcc3-203ENSMUST00000117929 3317 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Gm10309-201ENSMUST00000095186 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Celf1-207ENSMUST00000111452 7800 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Spag17os-202ENSMUST00000145279 3219 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Gm10307-201ENSMUST00000189839 1337 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Gm38276-201ENSMUST00000192446 1343 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Zc3h12c-202ENSMUST00000213645 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Usp8-201ENSMUST00000028841 4145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Zranb3-203ENSMUST00000112538 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 AC163354.1-201ENSMUST00000220620 1630 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Gm43285-201ENSMUST00000196563 3592 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Olfr432-203ENSMUST00000213381 4533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Gm9268-202ENSMUST00000173815 2565 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Olfr1348-210ENSMUST00000214383 2582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Gm43029-201ENSMUST00000201829 1535 ntBASIC6.71□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Prkacb-204ENSMUST00000106138 3999 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 138.1 ms