Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Dicer1-201ENSMUST00000041987 9851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gtpbp6Q3U6U5 Tomm20-201ENSMUST00000179857 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gtpbp6Q3U6U5 Otog-202ENSMUST00000209802 3558 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gtpbp6Q3U6U5 Ano4-204ENSMUST00000182341 3959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gtpbp6Q3U6U5 Ano9-201ENSMUST00000067836 3019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gtpbp6Q3U6U5 Cypt3-202ENSMUST00000112573 669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gtpbp6Q3U6U5 Cav1-203ENSMUST00000115454 613 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12604-201ENSMUST00000118382 380 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Gtpbp6Q3U6U5 Gm6587-201ENSMUST00000120219 613 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Gtpbp6Q3U6U5 Rpl23a-ps4-201ENSMUST00000121008 455 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5383-201ENSMUST00000121177 617 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12665-201ENSMUST00000126063 541 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gtpbp6Q3U6U5 Gm25551-201ENSMUST00000158082 103 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Gtpbp6Q3U6U5 2310005E17Rik-201ENSMUST00000186644 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gtpbp6Q3U6U5 Gm38183-201ENSMUST00000193189 205 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37619-201ENSMUST00000193219 724 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Gtpbp6Q3U6U5 Vamp4-208ENSMUST00000194810 600 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gtpbp6Q3U6U5 Gm18340-201ENSMUST00000196342 609 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43467-201ENSMUST00000197441 437 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Gtpbp6Q3U6U5 Gm18213-201ENSMUST00000207850 178 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Gtpbp6Q3U6U5 AC153141.1-201ENSMUST00000218636 501 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Gtpbp6Q3U6U5 Gm40421-201ENSMUST00000218991 658 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gtpbp6Q3U6U5 AC138667.2-201ENSMUST00000224880 598 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Gtpbp6Q3U6U5 5330417H12Rik-201ENSMUST00000060348 1191 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
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Gtpbp6Q3U6U5 1700109H08Rik-201ENSMUST00000008451 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gtpbp6Q3U6U5 Ifi202b-201ENSMUST00000000266 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gtpbp6Q3U6U5 Nrf1-202ENSMUST00000069808 1658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
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Gtpbp6Q3U6U5 L3mbtl3-201ENSMUST00000040219 4572 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gtpbp6Q3U6U5 Slc2a9-201ENSMUST00000005238 3243 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gtpbp6Q3U6U5 Srpx2-202ENSMUST00000113304 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gtpbp6Q3U6U5 Gm36988-201ENSMUST00000194090 2408 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Gtpbp6Q3U6U5 AU021092-201ENSMUST00000050160 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gtpbp6Q3U6U5 Odf2-210ENSMUST00000113765 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10933-201ENSMUST00000221891 1861 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr173-202ENSMUST00000206205 2778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gtpbp6Q3U6U5 Samhd1-201ENSMUST00000057725 3926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gtpbp6Q3U6U5 2410089E03Rik-201ENSMUST00000110617 10469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gtpbp6Q3U6U5 Pcdh15-233ENSMUST00000191709 5346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gtpbp6Q3U6U5 Mcm5-203ENSMUST00000212426 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
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Gtpbp6Q3U6U5 Tcaf2-201ENSMUST00000031879 4497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
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Gtpbp6Q3U6U5 Atp2a1-201ENSMUST00000032974 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
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Gtpbp6Q3U6U5 Gm15627-201ENSMUST00000140421 437 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15340-201ENSMUST00000144984 704 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
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Gtpbp6Q3U6U5 Glycam1-201ENSMUST00000023134 628 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
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Gtpbp6Q3U6U5 Ercc3-201ENSMUST00000025241 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gtpbp6Q3U6U5 Arhgap12-201ENSMUST00000062584 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gtpbp6Q3U6U5 Padi3-202ENSMUST00000172098 3310 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gtpbp6Q3U6U5 2610028H24Rik-201ENSMUST00000092406 1640 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gtpbp6Q3U6U5 Myzap-204ENSMUST00000169573 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gtpbp6Q3U6U5 R3hcc1l-201ENSMUST00000026188 4112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gtpbp6Q3U6U5 4921515E04Rik-202ENSMUST00000226383 1738 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Gtpbp6Q3U6U5 Polr3c-206ENSMUST00000154679 2406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gtpbp6Q3U6U5 Gm6787-201ENSMUST00000123120 1454 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gtpbp6Q3U6U5 1700007E05Rik-202ENSMUST00000190494 1499 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45062-201ENSMUST00000162564 5842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gtpbp6Q3U6U5 Dclk1-203ENSMUST00000167204 6025 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gtpbp6Q3U6U5 Gm16239-201ENSMUST00000160182 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gtpbp6Q3U6U5 AI427809-203ENSMUST00000123127 2033 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gtpbp6Q3U6U5 Fetub-202ENSMUST00000116625 1338 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gtpbp6Q3U6U5 Lrrfip1-203ENSMUST00000097649 3645 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms