Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 AC153567.1-201ENSMUST00000218424 1263 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Q3U6N9 9130015A21Rik-202ENSMUST00000222153 837 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Gm18620-201ENSMUST00000222295 324 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Gm18955-201ENSMUST00000223173 649 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Q3U6N9 AC163660.1-201ENSMUST00000223696 818 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Q3U6N9 AC091237.1-201ENSMUST00000224911 637 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Q3U6N9 AC159267.1-201ENSMUST00000226702 678 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Q3U6N9 1700011L22Rik-201ENSMUST00000034109 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Nup43-201ENSMUST00000040135 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Mir425-201ENSMUST00000083645 85 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Mup8-201ENSMUST00000095058 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Gm43789-201ENSMUST00000199275 2472 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Bnip3l-201ENSMUST00000022634 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Qsox2-202ENSMUST00000091263 4011 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Tmem87a-203ENSMUST00000110729 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Lrrtm3-201ENSMUST00000105439 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Alcam-207ENSMUST00000170035 1917 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Gm26806-201ENSMUST00000180403 1519 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Q3U6N9 AC134577.3-201ENSMUST00000226490 3000 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Q3U6N9 C230057A21Rik-201ENSMUST00000194944 3331 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Atp2b4-207ENSMUST00000165602 8101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Lgi1-206ENSMUST00000198045 1483 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Gm37915-201ENSMUST00000195134 3261 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Itpr2-201ENSMUST00000053273 8331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Arhgap1-201ENSMUST00000090614 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Gm14418-201ENSMUST00000108955 1415 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Dcn-202ENSMUST00000163448 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Clasp1-210ENSMUST00000188710 10265 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Ctage5-223ENSMUST00000219140 4194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Q3U6N9 A730091E23Rik-201ENSMUST00000221700 3825 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Olfr1364-203ENSMUST00000213912 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Olfr1198-203ENSMUST00000215529 3413 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Olfr1426-203ENSMUST00000217952 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Olfr678-202ENSMUST00000213622 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Zfp143-204ENSMUST00000209505 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Ikzf3-201ENSMUST00000103141 3658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Acp2-201ENSMUST00000002172 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Vmn1r12-202ENSMUST00000226866 6639 ntAPPRIS P2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Skil-203ENSMUST00000118204 2904 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Nxpe4-203ENSMUST00000216998 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Gm43612-201ENSMUST00000196087 3207 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Slc25a53-214ENSMUST00000171738 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Trdv2-2-201ENSMUST00000103678 397 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Gm25785-201ENSMUST00000104129 125 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Gm11445-201ENSMUST00000119101 532 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Gm12135-201ENSMUST00000119170 466 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Gm15149-201ENSMUST00000119370 360 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Q3U6N9 1700047F07Rik-201ENSMUST00000140321 543 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Gm12160-201ENSMUST00000146372 342 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Speer4cos-201ENSMUST00000162113 1083 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Gm3326-201ENSMUST00000164656 1043 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Tnfsf10-202ENSMUST00000174840 989 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Mir5617-201ENSMUST00000176786 57 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Gm5930-202ENSMUST00000178002 489 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Gm29206-201ENSMUST00000189321 827 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Gm28413-201ENSMUST00000189369 291 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Gm43391-201ENSMUST00000196145 883 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Gm21847-202ENSMUST00000198681 883 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Q3U6N9 U90926-202ENSMUST00000201332 524 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Gm44296-201ENSMUST00000204689 681 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Gm32816-202ENSMUST00000206497 496 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Gm44982-201ENSMUST00000208795 471 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Q3U6N9 AL713985.1-201ENSMUST00000219030 420 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Q3U6N9 AC174082.2-201ENSMUST00000222094 543 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Q3U6N9 AC150661.1-201ENSMUST00000222563 495 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Q3U6N9 4933412O06Rik-201ENSMUST00000222681 1123 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Lalba-201ENSMUST00000023726 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Olfr491-201ENSMUST00000053179 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Olfr1456-ps1-201ENSMUST00000087769 518 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Ppp2r5c-202ENSMUST00000109832 4108 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Lrp2-201ENSMUST00000080953 15460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Cops2-202ENSMUST00000110462 1853 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Gm38386-201ENSMUST00000194293 3421 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Gm13301-201ENSMUST00000121728 2446 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Alkbh8-201ENSMUST00000053407 3603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Zmat4-206ENSMUST00000207301 4207 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Rps15a-207ENSMUST00000172457 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Gm26518-201ENSMUST00000181328 3270 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Gm42549-201ENSMUST00000202392 7004 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Zc3h11a-204ENSMUST00000191896 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Slc25a53-202ENSMUST00000113069 3189 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Gm38244-201ENSMUST00000191737 2586 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Plch1-210ENSMUST00000162269 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Gm39327-201ENSMUST00000213594 1982 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Oas2-201ENSMUST00000053909 3869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Q3U6N9 A730017C20Rik-205ENSMUST00000165666 1911 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Gm29670-201ENSMUST00000190228 2491 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Q3U6N9 D030045P18Rik-203ENSMUST00000214947 1938 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Rpp40-201ENSMUST00000171686 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Arhgap32-201ENSMUST00000168954 8703 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Dst-209ENSMUST00000182697 2704 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Gm28395-201ENSMUST00000187794 2168 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Gm28571-201ENSMUST00000188922 2168 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Trp53cor1-201ENSMUST00000133221 2956 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Sla-202ENSMUST00000164163 2952 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Nbas-201ENSMUST00000042953 7234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Dock7-214ENSMUST00000205650 6297 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Aph1c-202ENSMUST00000169282 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Olfr1366-203ENSMUST00000205976 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Q3U6N9 Gm38070-201ENSMUST00000191850 6480 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
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