Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Krtdap-209ENSMUST00000190990 403 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Gm43203-201ENSMUST00000200130 558 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Agr2-201ENSMUST00000020898 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Gm20751-201ENSMUST00000210260 1270 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Gm33586-201ENSMUST00000210768 892 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Olfr923-204ENSMUST00000219798 1068 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 AC123917.1-201ENSMUST00000228063 1048 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Olfr923-201ENSMUST00000051238 1068 ntAPPRIS P1 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Vmn1r53-201ENSMUST00000076086 1122 ntAPPRIS P1 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Krtdap-201ENSMUST00000098559 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Bmi1-202ENSMUST00000051929 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Olfr959-203ENSMUST00000216298 5616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Mapre2-202ENSMUST00000115830 2496 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Cmah-209ENSMUST00000224953 2221 ntAPPRIS P1 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Dlg1-206ENSMUST00000115205 4364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Ankrd17-205ENSMUST00000197021 8067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Mcm7-208ENSMUST00000148879 1351 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Kcnj6-203ENSMUST00000165538 3637 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Olfr1272-202ENSMUST00000117141 2442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 CAAA01119292.1-201ENSMUST00000226763 2766 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Gm6093-202ENSMUST00000222963 2163 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Pole-201ENSMUST00000007296 7163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Serpinb8-201ENSMUST00000000514 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Gm3512-202ENSMUST00000172431 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Zfp799-205ENSMUST00000202988 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Tshr-204ENSMUST00000221216 1638 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 5430401H09Rik-202ENSMUST00000218836 2620 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Gm13983-201ENSMUST00000118018 865 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Gm13265-201ENSMUST00000118090 421 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Smim24-202ENSMUST00000118206 949 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Gm5601-201ENSMUST00000118909 972 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Gm13222-201ENSMUST00000119638 138 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Gm14741-201ENSMUST00000120777 1009 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Sp3os-203ENSMUST00000137941 628 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Gm13179-202ENSMUST00000151994 978 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Gm10364-202ENSMUST00000153034 1001 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Gm11940-201ENSMUST00000153599 417 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 1700021L23Rik-201ENSMUST00000153719 726 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Gm42421-201ENSMUST00000172367 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Gm20738-201ENSMUST00000177666 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Gm20823-201ENSMUST00000179949 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Gm20865-202ENSMUST00000181163 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Gm21868-201ENSMUST00000185623 1230 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Gm29049-201ENSMUST00000185705 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Gm20924-202ENSMUST00000186910 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Gm20816-202ENSMUST00000187846 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Gm20809-202ENSMUST00000187943 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Gm21728-201ENSMUST00000188442 695 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Gm21889-201ENSMUST00000188487 695 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Gm20932-201ENSMUST00000189115 694 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Gm21721-202ENSMUST00000189253 1225 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Gm21920-201ENSMUST00000190042 695 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Gm28171-201ENSMUST00000190100 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Gm10640-202ENSMUST00000190947 1134 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Gm20803-202ENSMUST00000190968 1230 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Gm20867-202ENSMUST00000190987 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Gm34144-201ENSMUST00000197039 259 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Gm42963-201ENSMUST00000202943 1217 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Gm18781-201ENSMUST00000211252 924 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Gm45693-201ENSMUST00000211391 1157 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Gm39317-201ENSMUST00000213360 1138 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Gm36278-201ENSMUST00000217030 918 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Zp4-ps-202ENSMUST00000222293 922 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 AC123656.1-201ENSMUST00000227121 581 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 AC140280.1-201ENSMUST00000227826 1847 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Gm10735-201ENSMUST00000099162 2943 ntAPPRIS P1 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 A130050O07Rik-201ENSMUST00000191963 3023 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Gm37077-201ENSMUST00000195723 3691 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Specc1-201ENSMUST00000049836 6091 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Rslcan18-201ENSMUST00000091526 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Phc3-204ENSMUST00000108255 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Nyap2-203ENSMUST00000123285 7501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Adar-201ENSMUST00000029563 3753 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Gm8177-201ENSMUST00000181591 1336 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Zbbx-201ENSMUST00000039269 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Itch-202ENSMUST00000109685 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Gm26806-201ENSMUST00000180403 1519 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Chil3-201ENSMUST00000063062 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Gm39465-201ENSMUST00000213810 9813 ntTSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Arhgef3-202ENSMUST00000224981 3618 ntAPPRIS P1 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Gm16142-201ENSMUST00000130584 2850 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 4921539H07Rik-201ENSMUST00000197200 2985 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Olfr1340-202ENSMUST00000213436 1948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 D030068K23Rik-202ENSMUST00000180524 3677 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Lats1-203ENSMUST00000217931 4186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Lats1-201ENSMUST00000040043 4155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Gm37877-201ENSMUST00000191630 2709 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Gm16052-201ENSMUST00000129681 505 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 0610043K17Rik-202ENSMUST00000142581 372 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Gm24781-201ENSMUST00000157636 117 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Gm5456-201ENSMUST00000170706 844 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Gm20491-201ENSMUST00000173765 1241 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Gm20691-201ENSMUST00000176889 333 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Gm9285-201ENSMUST00000177691 697 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Gm17045-201ENSMUST00000178600 844 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Gm28665-201ENSMUST00000189269 670 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Gm9367-201ENSMUST00000205703 546 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Gm45345-201ENSMUST00000211427 555 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 AC122273.1-202ENSMUST00000213884 695 ntTSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 AC165349.1-201ENSMUST00000217896 424 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.6 ms