Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 1700016L21Rik-201ENSMUST00000187497 394 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Pkp1P97350 Nabp1-206ENSMUST00000188051 680 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Pkp1P97350 Gm38232-201ENSMUST00000193602 411 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Pkp1P97350 Gm36965-201ENSMUST00000193797 394 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Pkp1P97350 Igkv4-77-201ENSMUST00000199410 352 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Pkp1P97350 Gm20559-202ENSMUST00000201831 2993 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Pkp1P97350 Mgam-206ENSMUST00000202779 3821 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Pkp1P97350 Gm43867-201ENSMUST00000203860 525 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Pkp1P97350 Gm34368-201ENSMUST00000209512 1111 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Pkp1P97350 Gm33586-201ENSMUST00000210768 892 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Pkp1P97350 Gm45307-201ENSMUST00000211122 751 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Pkp1P97350 AC151904.5-201ENSMUST00000218975 549 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Pkp1P97350 AC154558.1-201ENSMUST00000222278 415 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Pkp1P97350 AC161275.1-201ENSMUST00000224668 208 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Pkp1P97350 Fsip1-201ENSMUST00000028820 1025 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Pkp1P97350 Gm24405-201ENSMUST00000083033 167 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Pkp1P97350 Olfr1305-201ENSMUST00000099608 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Pkp1P97350 Prdm11-202ENSMUST00000111274 11678 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Pkp1P97350 Olfr675-202ENSMUST00000210113 3671 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Pkp1P97350 Ifi207-201ENSMUST00000042610 3422 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Pkp1P97350 Lctl-202ENSMUST00000118215 1380 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Pkp1P97350 Gm44046-201ENSMUST00000203145 2678 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Pkp1P97350 Ttc41-201ENSMUST00000061458 1815 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Pkp1P97350 Pdlim5-205ENSMUST00000170361 2010 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Pkp1P97350 Sptlc3-201ENSMUST00000047370 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Pkp1P97350 Adsl-201ENSMUST00000023043 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Pkp1P97350 Gm11858-201ENSMUST00000117935 838 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Pkp1P97350 1700086P04Rik-201ENSMUST00000149472 1009 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Pkp1P97350 Gm15239-201ENSMUST00000150690 603 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Pkp1P97350 Rps19-ps8-201ENSMUST00000180714 422 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Pkp1P97350 1700011B04Rik-201ENSMUST00000189140 651 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Pkp1P97350 Gm29496-201ENSMUST00000189854 693 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Pkp1P97350 Gm7867-201ENSMUST00000189856 546 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Pkp1P97350 Gm10640-202ENSMUST00000190947 1134 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Pkp1P97350 Gm44911-201ENSMUST00000208436 1062 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Pkp1P97350 AC124184.1-201ENSMUST00000218167 283 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Pkp1P97350 1700011B04Rik-205ENSMUST00000220995 831 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Pkp1P97350 1700011B04Rik-207ENSMUST00000221256 800 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Pkp1P97350 1700011B04Rik-208ENSMUST00000221261 628 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Pkp1P97350 1700011B04Rik-210ENSMUST00000222668 821 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Pkp1P97350 AC154849.2-201ENSMUST00000223781 974 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Pkp1P97350 AC124395.1-201ENSMUST00000225940 707 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Pkp1P97350 AC154640.1-202ENSMUST00000227828 496 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Pkp1P97350 Elavl2-209ENSMUST00000107124 4127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Pkp1P97350 Vmn1r22-203ENSMUST00000228076 3011 ntAPPRIS P1 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Pkp1P97350 A330023F24Rik-202ENSMUST00000181273 4217 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Pkp1P97350 Zfp280d-203ENSMUST00000183410 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Pkp1P97350 Lhfpl3-201ENSMUST00000196406 2589 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Pkp1P97350 BC053393-201ENSMUST00000050937 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Pkp1P97350 Gm29021-201ENSMUST00000185451 1498 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Pkp1P97350 Gm29071-201ENSMUST00000185729 1488 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Pkp1P97350 Gm28799-201ENSMUST00000186506 1498 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Pkp1P97350 Gm28663-201ENSMUST00000186567 1498 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Pkp1P97350 Gm28470-201ENSMUST00000186912 1498 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Pkp1P97350 Gm28971-201ENSMUST00000187506 1498 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Pkp1P97350 Gm28733-202ENSMUST00000187597 1498 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Pkp1P97350 Gm28820-201ENSMUST00000188530 1498 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Pkp1P97350 Gm29606-202ENSMUST00000188564 1498 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Pkp1P97350 Gm29225-202ENSMUST00000188647 1498 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Pkp1P97350 Gm28152-201ENSMUST00000188694 1498 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Pkp1P97350 Gm28771-202ENSMUST00000189399 1499 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Pkp1P97350 Gm28741-201ENSMUST00000189417 1498 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Pkp1P97350 Gm28540-202ENSMUST00000189573 1498 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Pkp1P97350 Gm29122-203ENSMUST00000189609 1498 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Pkp1P97350 Gm28613-201ENSMUST00000189627 1498 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Pkp1P97350 Gm28816-202ENSMUST00000189686 1498 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Pkp1P97350 Gm29584-202ENSMUST00000190181 1498 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Pkp1P97350 Gm28293-202ENSMUST00000190417 1498 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Pkp1P97350 Gm28463-203ENSMUST00000191085 1498 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Pkp1P97350 Gm28124-202ENSMUST00000191099 1498 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Pkp1P97350 Gm29217-202ENSMUST00000191270 1498 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Pkp1P97350 Gm28332-203ENSMUST00000191389 1498 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Pkp1P97350 Gm37346-201ENSMUST00000191665 1498 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
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Pkp1P97350 Gm38371-202ENSMUST00000193996 1498 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Pkp1P97350 Gm37434-203ENSMUST00000194239 1498 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Pkp1P97350 Gm37840-202ENSMUST00000194805 1498 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Pkp1P97350 Gm37687-203ENSMUST00000195020 1498 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Pkp1P97350 Gm37071-203ENSMUST00000195814 1498 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Pkp1P97350 Cytip-201ENSMUST00000028175 6110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Pkp1P97350 Scyl3-203ENSMUST00000161908 3718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Pkp1P97350 Lum-201ENSMUST00000038160 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Pkp1P97350 Nqo2-202ENSMUST00000058978 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Pkp1P97350 Kif9-203ENSMUST00000197248 3184 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Pkp1P97350 C87436-201ENSMUST00000050497 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Pkp1P97350 Gm28112-201ENSMUST00000190898 1875 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Pkp1P97350 Psg21-202ENSMUST00000182128 2066 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Pkp1P97350 Gm46348-201ENSMUST00000222917 2151 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Pkp1P97350 Gm45786-201ENSMUST00000213021 2278 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Pkp1P97350 Gimd1-203ENSMUST00000212594 1432 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Pkp1P97350 Usp17la-201ENSMUST00000067695 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Pkp1P97350 Psd4-202ENSMUST00000102942 11265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Pkp1P97350 AC130217.2-201ENSMUST00000224009 2990 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Pkp1P97350 Gm14827-201ENSMUST00000146644 3089 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Pkp1P97350 Gja10-201ENSMUST00000056517 2117 ntAPPRIS P2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Pkp1P97350 Vps50-203ENSMUST00000170873 3687 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Pkp1P97350 Ide-201ENSMUST00000131070 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Pkp1P97350 Mrpl1-201ENSMUST00000036437 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Pkp1P97350 Gm15621-201ENSMUST00000119162 364 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Pkp1P97350 Atp5l-ps2-201ENSMUST00000121382 314 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 126.6 ms