Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Vmn2r-ps124-201ENSMUST00000176236 903 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Gm20713-201ENSMUST00000176344 435 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Gm2058-201ENSMUST00000178791 560 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Gm19791-201ENSMUST00000180398 859 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Gm21304-201ENSMUST00000180568 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Gm21293-202ENSMUST00000180664 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Gm27018-201ENSMUST00000181136 225 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Gm21312-203ENSMUST00000181239 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Gm20765-203ENSMUST00000181707 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Mir7082-201ENSMUST00000183526 92 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Gm27468-201ENSMUST00000183577 106 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Gm3489-201ENSMUST00000190083 528 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Nanog-ps2-201ENSMUST00000190988 529 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Gm37322-201ENSMUST00000193409 337 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Gm17895-201ENSMUST00000194028 874 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 AC122844.1-201ENSMUST00000195971 107 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Gm43033-201ENSMUST00000199682 425 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Mrln-201ENSMUST00000020090 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Gm45078-201ENSMUST00000205343 546 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Gm9367-201ENSMUST00000205703 546 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Klk1b12-ps-201ENSMUST00000206650 751 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Gm34623-201ENSMUST00000210900 977 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Gm45782-201ENSMUST00000212670 366 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Gm32105-201ENSMUST00000218512 511 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 4930521O17Rik-201ENSMUST00000219339 491 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 AC122486.1-201ENSMUST00000221562 196 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Gm18620-201ENSMUST00000222295 324 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 AC164295.1-201ENSMUST00000224861 186 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Gsta4-201ENSMUST00000034903 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Vmn1r74-201ENSMUST00000050416 915 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Krtap13-1-201ENSMUST00000060494 748 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Cetn1-201ENSMUST00000062769 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Gm10770-201ENSMUST00000099418 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Olfr1312-201ENSMUST00000099600 954 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Rdx-203ENSMUST00000163153 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Aktip-204ENSMUST00000120426 1687 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Obox3-206ENSMUST00000174443 1979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Gm6820-201ENSMUST00000188803 2173 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Impg1-202ENSMUST00000113250 2965 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Gm35835-201ENSMUST00000214447 4589 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 B3gnt5-207ENSMUST00000164397 4872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Pcm1-204ENSMUST00000211247 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Olfr1198-203ENSMUST00000215529 3413 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Gm44130-201ENSMUST00000205157 3004 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Gm20752-201ENSMUST00000197341 2833 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Zc3h12b-201ENSMUST00000082183 2831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 5830416I19Rik-201ENSMUST00000198687 2627 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Zfa-ps-201ENSMUST00000180526 2231 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Patj-203ENSMUST00000102792 3755 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Stra6l-203ENSMUST00000107783 3669 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Tll2-201ENSMUST00000025986 3369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Gm43189-201ENSMUST00000196040 3069 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Osbpl9-201ENSMUST00000030288 2871 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Osbpl6-201ENSMUST00000077972 8037 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 C030015A19Rik-201ENSMUST00000203368 2551 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Olfr62-202ENSMUST00000213189 2570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Fbxo16-204ENSMUST00000226005 3700 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Sgcg-201ENSMUST00000077954 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Gm43537-201ENSMUST00000199064 3110 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Serpinb8-201ENSMUST00000000514 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Ncor1-204ENSMUST00000101066 8852 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Kcnj15-205ENSMUST00000113858 5309 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Mxi1-203ENSMUST00000111737 4843 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Gm33968-201ENSMUST00000211015 1562 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 4930503L19Rik-204ENSMUST00000212155 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Gm37457-201ENSMUST00000193639 2433 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 A530017D24Rik-201ENSMUST00000101077 2315 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Gm13769-202ENSMUST00000214797 2340 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Eci2-203ENSMUST00000110251 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Igkv6-20-201ENSMUST00000103388 375 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Ighv12-3-201ENSMUST00000103485 353 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Tdpx-ps1-201ENSMUST00000117372 597 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Gm12920-201ENSMUST00000121818 1186 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Gm12160-201ENSMUST00000146372 342 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 4930412L05Rik-202ENSMUST00000146501 1241 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Gm24176-201ENSMUST00000158928 121 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Lrmda-203ENSMUST00000159777 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Gm15882-201ENSMUST00000161344 855 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Gm10428-201ENSMUST00000178750 399 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Gm4956-202ENSMUST00000178869 672 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 1700003C15Rik-202ENSMUST00000188236 710 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Gm37231-201ENSMUST00000191716 621 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Gm38159-202ENSMUST00000194145 621 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Gm37734-201ENSMUST00000194294 621 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Gm36941-202ENSMUST00000194799 621 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Gm37378-202ENSMUST00000195795 621 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Gm37130-202ENSMUST00000195874 621 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 9430087B13Rik-201ENSMUST00000196548 1085 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Gm42707-202ENSMUST00000196668 618 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Gm43089-201ENSMUST00000199162 275 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Gm44849-201ENSMUST00000207595 484 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Gm45607-201ENSMUST00000211143 678 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Scoc-209ENSMUST00000212905 798 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Gm29154-209ENSMUST00000213614 878 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Gm7252-201ENSMUST00000223284 456 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 FAM237A-201ENSMUST00000226288 1105 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Stfa2-201ENSMUST00000023619 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Rps29-201ENSMUST00000037023 390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 1700014D04Rik-201ENSMUST00000055343 795 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Gja10-201ENSMUST00000056517 2117 ntAPPRIS P2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms