Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Apoc2-201ENSMUST00000003074 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
VdrP48281 2310030G06Rik-201ENSMUST00000034564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
VdrP48281 Gm5426-201ENSMUST00000074615 312 ntAPPRIS P1 BASIC7.85□□□□□ -1.15
VdrP48281 Olfr206-201ENSMUST00000084791 1005 ntAPPRIS P1 BASIC7.85□□□□□ -1.15
VdrP48281 Mir146b-201ENSMUST00000093619 109 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
VdrP48281 Arhgap17-201ENSMUST00000098060 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
VdrP48281 Gm44752-201ENSMUST00000207140 3305 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
VdrP48281 Kcnip4-208ENSMUST00000176978 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
VdrP48281 Olfr1065-204ENSMUST00000217586 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
VdrP48281 Vmn2r-ps94-201ENSMUST00000116665 1456 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
VdrP48281 Glcci1-202ENSMUST00000161217 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
VdrP48281 Nucb2-203ENSMUST00000183175 1913 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
VdrP48281 Gm43681-201ENSMUST00000201581 1903 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
VdrP48281 Gm14002-201ENSMUST00000123574 2839 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
VdrP48281 Fbxw10-205ENSMUST00000176577 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
VdrP48281 Olfr1491-205ENSMUST00000216377 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
VdrP48281 Olfr656-202ENSMUST00000215575 4091 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
VdrP48281 Vmn1r70-204ENSMUST00000228090 3185 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
VdrP48281 Gm43181-201ENSMUST00000197001 2072 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
VdrP48281 Gm43322-201ENSMUST00000196232 1612 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
VdrP48281 Gm36757-201ENSMUST00000221818 3556 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
VdrP48281 Odf2l-203ENSMUST00000098539 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
VdrP48281 Agps-203ENSMUST00000175646 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
VdrP48281 Olfr1320-203ENSMUST00000214375 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
VdrP48281 Zfp143-204ENSMUST00000209505 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
VdrP48281 Clasp1-204ENSMUST00000178710 7566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
VdrP48281 AC154738.6-201ENSMUST00000227225 1352 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
VdrP48281 Gm32717-201ENSMUST00000219147 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.84□□□□□ -1.15
VdrP48281 Gm32802-201ENSMUST00000219565 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.84□□□□□ -1.15
VdrP48281 Olfr1085-203ENSMUST00000214566 5129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
VdrP48281 Gm45117-201ENSMUST00000207250 1774 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
VdrP48281 Gmeb1-207ENSMUST00000168553 6523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
VdrP48281 Csnk1g1-209ENSMUST00000205379 4001 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
VdrP48281 Patj-203ENSMUST00000102792 3755 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
VdrP48281 Hipk1-202ENSMUST00000106845 3967 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
VdrP48281 Gm12667-201ENSMUST00000118299 1332 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
VdrP48281 Gm12290-201ENSMUST00000145095 2112 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
VdrP48281 Trim40-201ENSMUST00000087158 2117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
VdrP48281 Fbxo16-204ENSMUST00000226005 3700 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
VdrP48281 Hspg2-201ENSMUST00000030547 14187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
VdrP48281 Olfr1215-202ENSMUST00000214809 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
VdrP48281 Armc2-203ENSMUST00000160262 4810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
VdrP48281 Scd1-201ENSMUST00000041331 4836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
VdrP48281 Gm25607-201ENSMUST00000104020 127 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
VdrP48281 Eaf2-203ENSMUST00000114825 668 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
VdrP48281 Gm13921-201ENSMUST00000119411 463 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
VdrP48281 Gm11955-201ENSMUST00000119801 470 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
VdrP48281 Gm14991-201ENSMUST00000119913 598 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
VdrP48281 Gm11945-201ENSMUST00000120551 476 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
VdrP48281 Gm13586-201ENSMUST00000121784 464 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
VdrP48281 A930104D05Rik-201ENSMUST00000128601 939 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
VdrP48281 Gm10086-201ENSMUST00000136334 354 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
VdrP48281 Gm371-201ENSMUST00000142240 1245 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
VdrP48281 Gm13194-201ENSMUST00000142299 311 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
VdrP48281 6430503K07Rik-201ENSMUST00000144411 476 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
VdrP48281 Rpl29-203ENSMUST00000150576 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
VdrP48281 Gm22847-201ENSMUST00000157707 105 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
VdrP48281 Gm7420-201ENSMUST00000162836 842 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
VdrP48281 Vmn1r224-201ENSMUST00000170076 897 ntAPPRIS P1 BASIC7.84□□□□□ -1.15
VdrP48281 Gm17102-201ENSMUST00000170929 906 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
VdrP48281 Gm8439-201ENSMUST00000171482 420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
VdrP48281 Vmn1r-ps29-201ENSMUST00000174862 785 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
VdrP48281 Gm2877-201ENSMUST00000178248 1204 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
VdrP48281 Gm8324-201ENSMUST00000178911 1204 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
VdrP48281 Olfr421-ps1-201ENSMUST00000179386 1050 ntAPPRIS P1 BASIC7.84□□□□□ -1.15
VdrP48281 Gm26612-201ENSMUST00000180785 1055 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
VdrP48281 Gm20379-201ENSMUST00000188317 1204 ntAPPRIS P1 BASIC7.84□□□□□ -1.15
VdrP48281 Gm29175-201ENSMUST00000189500 402 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
VdrP48281 Gm38087-201ENSMUST00000193653 265 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
VdrP48281 Mark4-ps-201ENSMUST00000196140 384 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
VdrP48281 Csn2-202ENSMUST00000196163 722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
VdrP48281 4930597L12Rik-201ENSMUST00000196286 911 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
VdrP48281 Gm43840-201ENSMUST00000199444 484 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
VdrP48281 1600020E01Rik-203ENSMUST00000204008 713 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
VdrP48281 Gm8999-201ENSMUST00000204951 969 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
VdrP48281 Gm17987-201ENSMUST00000206902 603 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
VdrP48281 Olfr850-202ENSMUST00000211832 947 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
VdrP48281 AC155259.1-201ENSMUST00000214794 477 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
VdrP48281 AC158239.1-201ENSMUST00000216890 779 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
VdrP48281 Gm7239-201ENSMUST00000220981 860 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
VdrP48281 Gm10054-201ENSMUST00000223362 431 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
VdrP48281 Smim15-202ENSMUST00000223808 808 ntAPPRIS P1 BASIC7.84□□□□□ -1.15
VdrP48281 Olfr290-201ENSMUST00000073468 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.84□□□□□ -1.15
VdrP48281 Tdgf1-ps2-201ENSMUST00000074412 505 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
VdrP48281 Vmn1r30-201ENSMUST00000078890 1053 ntAPPRIS P1 BASIC7.84□□□□□ -1.15
VdrP48281 Sla-201ENSMUST00000100572 2626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
VdrP48281 Olfr15-202ENSMUST00000214238 6135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
VdrP48281 Gm42598-201ENSMUST00000200110 2437 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
VdrP48281 Bbs12-201ENSMUST00000057975 2433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
VdrP48281 CT009480.2-201ENSMUST00000225152 3369 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
VdrP48281 Pitpnc1-201ENSMUST00000040380 5478 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
VdrP48281 Olfr122-202ENSMUST00000172582 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
VdrP48281 9030607J07Rik-201ENSMUST00000202228 1622 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
VdrP48281 0610031O16Rik-203ENSMUST00000185046 1429 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
VdrP48281 Gm37790-201ENSMUST00000193136 3346 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
VdrP48281 Gm37534-201ENSMUST00000194483 5222 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
VdrP48281 Lrrtm3-201ENSMUST00000105439 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
VdrP48281 Gm34184-201ENSMUST00000216477 2713 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
VdrP48281 Dtna-202ENSMUST00000115832 6295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
VdrP48281 Kars-ps1-201ENSMUST00000122077 1767 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.7 ms