Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 AC117769.2-201ENSMUST00000224612 469 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Chd1P40201 AC154806.5-205ENSMUST00000228828 411 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Ifit3b-201ENSMUST00000076249 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Ncald-204ENSMUST00000120746 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Nup93-202ENSMUST00000109547 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Scoc-201ENSMUST00000081506 1791 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Lig3-201ENSMUST00000021039 5957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Vmn1r40-204ENSMUST00000228485 2689 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Brca2-201ENSMUST00000044620 10724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Olfr874-202ENSMUST00000216982 2632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Gm14743-201ENSMUST00000114026 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Gm14220-201ENSMUST00000118114 449 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Gm14356-201ENSMUST00000118322 869 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Gm14836-201ENSMUST00000118567 471 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Gm8761-201ENSMUST00000121507 955 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Ftx-201ENSMUST00000123841 673 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Selenok-ps1-201ENSMUST00000125204 785 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Gm23891-201ENSMUST00000158114 138 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Gm23050-201ENSMUST00000158775 165 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Gm18833-201ENSMUST00000173218 862 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Gm26057-201ENSMUST00000178099 165 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Gm27006-201ENSMUST00000182218 943 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Gm44184-201ENSMUST00000204290 132 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Gm29791-201ENSMUST00000207144 380 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Olfr1336-201ENSMUST00000056120 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Nckap5-203ENSMUST00000094610 739 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Gm42609-201ENSMUST00000196362 3306 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Cdc40-201ENSMUST00000044166 3534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Fam168a-205ENSMUST00000207875 4077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Chd1P40201 AC125409.2-201ENSMUST00000221888 2158 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Enpp6-201ENSMUST00000039840 4970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Plekha2-201ENSMUST00000064883 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Chd1P40201 1110002J07Rik-201ENSMUST00000181710 2229 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Ftx-203ENSMUST00000130063 4275 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Slco5a1-207ENSMUST00000188454 8463 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Daam1-202ENSMUST00000221317 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Apol10a-201ENSMUST00000060551 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Gm12333-201ENSMUST00000155508 2669 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Chd1P40201 A930030B08Rik-201ENSMUST00000207625 3965 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Dach2-203ENSMUST00000113379 2512 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Gm44704-201ENSMUST00000208963 1990 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Dnm3-201ENSMUST00000070330 4601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Adgrl2-208ENSMUST00000197567 5585 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Sytl4-203ENSMUST00000113297 3306 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Dio2-201ENSMUST00000082432 5815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Tmem161b-206ENSMUST00000225069 2414 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Gm20486-201ENSMUST00000101544 128 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Gm22952-201ENSMUST00000116720 120 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Gm26086-201ENSMUST00000157902 263 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Gm17142-201ENSMUST00000164933 645 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Gm27225-201ENSMUST00000183833 557 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Gm19182-201ENSMUST00000207139 577 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Rpl29-ps2-202ENSMUST00000220540 1165 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Chd1P40201 AC156037.1-201ENSMUST00000221133 127 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Chd1P40201 AC125543.3-201ENSMUST00000221991 126 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Rpl29-ps2-203ENSMUST00000222043 1036 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Chd1P40201 AC154248.1-201ENSMUST00000222072 495 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Prl8a8-204ENSMUST00000224072 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Olfr771-201ENSMUST00000078914 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Zfp626-201ENSMUST00000080175 816 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Fam183b-202ENSMUST00000094156 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Chd1P40201 AC140409.2-201ENSMUST00000216936 3079 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Dennd2c-204ENSMUST00000173206 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Adar-203ENSMUST00000107405 5871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Kif2a-204ENSMUST00000122233 3533 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Olfr888-202ENSMUST00000211851 2930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Plekhg1-202ENSMUST00000120274 7369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Ppp2r3a-202ENSMUST00000075941 6786 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Ptprb-203ENSMUST00000218553 7016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Creb1-202ENSMUST00000087366 8364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Gm4951-201ENSMUST00000031549 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Ank3-219ENSMUST00000182437 3113 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Chd1P40201 A330032B11Rik-201ENSMUST00000180609 1919 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Tsga10-207ENSMUST00000155852 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Chd1P40201 BC051142-202ENSMUST00000097348 1732 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Gm13224-201ENSMUST00000119586 94 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Gm12754-201ENSMUST00000121908 454 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Sox5os3-202ENSMUST00000154167 765 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Gm22820-201ENSMUST00000157205 329 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Adcy8-202ENSMUST00000228014 6900 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Gm36401-201ENSMUST00000194255 2028 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Wdr76-203ENSMUST00000110602 4170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Ambra1-201ENSMUST00000045699 4690 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Tmem170b-201ENSMUST00000129449 7168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Gm38284-201ENSMUST00000194803 4539 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Zfp790-202ENSMUST00000178162 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Prokr2-204ENSMUST00000142766 3932 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Zbed4-ps3-201ENSMUST00000187149 3244 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Zfp59-201ENSMUST00000108331 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Nsd2-201ENSMUST00000058096 4633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Lrrtm4-205ENSMUST00000133918 2255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Chd1P40201 2700049A03Rik-203ENSMUST00000149564 5763 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Gm8279-202ENSMUST00000165713 1760 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Gm5795-203ENSMUST00000171150 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Slc5a6-201ENSMUST00000080431 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Gm9923-201ENSMUST00000217785 1836 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Gm11032-201ENSMUST00000109941 102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Mnd1-ps-201ENSMUST00000162462 604 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Gm22932-201ENSMUST00000175510 72 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
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