Protein–RNA interactions for Protein: P15314

Irf1, Interferon regulatory factor 1, mousemouse

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Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf1P15314 Olfr433-201ENSMUST00000052975 2406 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Irf1P15314 Osbpl1a-202ENSMUST00000117361 2687 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Irf1P15314 Olfr1261-203ENSMUST00000213909 2912 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Irf1P15314 Sntg1-204ENSMUST00000132064 4165 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Irf1P15314 Tbc1d5-201ENSMUST00000024717 5435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Irf1P15314 Gucy1a3-201ENSMUST00000048976 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Irf1P15314 Ppwd1-201ENSMUST00000022226 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Irf1P15314 Wfdc5-201ENSMUST00000045127 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Irf1P15314 Gm3147-202ENSMUST00000201071 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Irf1P15314 Lrrc28-201ENSMUST00000032775 1817 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Irf1P15314 A430089I19Rik-201ENSMUST00000097479 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Irf1P15314 Tmem164-203ENSMUST00000112888 4221 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Irf1P15314 CT009480.2-201ENSMUST00000225152 3369 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Irf1P15314 Vmn2r-ps94-201ENSMUST00000116665 1456 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Irf1P15314 Rapgef4-202ENSMUST00000090826 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Irf1P15314 Tcf7l2-211ENSMUST00000111658 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Irf1P15314 Mbd5-202ENSMUST00000112745 6037 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Irf1P15314 Gm38081-201ENSMUST00000192680 1645 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Irf1P15314 Gm44695-201ENSMUST00000205567 1631 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Irf1P15314 Vmn1r37-206ENSMUST00000228791 1617 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Irf1P15314 Gm28307-201ENSMUST00000190685 2694 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Irf1P15314 Gm42540-201ENSMUST00000200319 2008 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Irf1P15314 2310005A03Rik-201ENSMUST00000142569 1398 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Irf1P15314 E330018M18Rik-201ENSMUST00000209455 1383 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Irf1P15314 Gm42520-201ENSMUST00000199642 1502 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Irf1P15314 Gm9125-202ENSMUST00000180746 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Irf1P15314 Gm9117-202ENSMUST00000193529 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Irf1P15314 Usp37-201ENSMUST00000044260 7111 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Irf1P15314 4930522H14Rik-202ENSMUST00000102725 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Irf1P15314 Ighv1-59-201ENSMUST00000103530 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Irf1P15314 Bdnf-208ENSMUST00000111049 3830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
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Irf1P15314 Gm15343-201ENSMUST00000136382 640 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Irf1P15314 9630013K17Rik-201ENSMUST00000146915 1072 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Irf1P15314 Gm11730-202ENSMUST00000147186 753 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
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Irf1P15314 Gm16430-202ENSMUST00000178145 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Irf1P15314 Gm16405-202ENSMUST00000180150 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
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Irf1P15314 4930404I20Rik-201ENSMUST00000203246 498 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
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Irf1P15314 Mill2-202ENSMUST00000072415 1075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
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Irf1P15314 Snapc4-201ENSMUST00000035427 4363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Irf1P15314 Gm4849-201ENSMUST00000188428 2246 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Irf1P15314 Pax5-201ENSMUST00000014174 8004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Irf1P15314 Cth-201ENSMUST00000118539 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Irf1P15314 Gm3460-201ENSMUST00000167882 1809 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Irf1P15314 Cyp2c50-202ENSMUST00000080171 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Irf1P15314 Rpgr-206ENSMUST00000115534 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Irf1P15314 Gm7203-201ENSMUST00000210880 1404 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Irf1P15314 Olfr1360-202ENSMUST00000205788 1988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Irf1P15314 Zkscan5-201ENSMUST00000031601 3469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Irf1P15314 BC051142-203ENSMUST00000114175 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Irf1P15314 Olfr1315-ps1-203ENSMUST00000217078 1559 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Irf1P15314 2700046A07Rik-202ENSMUST00000067450 2101 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Irf1P15314 Slc16a14-201ENSMUST00000027422 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Irf1P15314 Kbtbd8-201ENSMUST00000032107 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Irf1P15314 Cbx3-204ENSMUST00000114446 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.4 ms