Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 AV026068-224ENSMUST00000224827 928 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 AC140451.1-201ENSMUST00000227984 737 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Rps26-201ENSMUST00000026420 681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 3300002A11Rik-201ENSMUST00000046994 654 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Samt3-201ENSMUST00000047945 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Gm5250-201ENSMUST00000059065 321 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Olfr1444-201ENSMUST00000059675 1129 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Gm22865-201ENSMUST00000083949 214 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Olfr1427-201ENSMUST00000087825 938 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Vmn1r195-201ENSMUST00000091736 1088 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Gm25099-201ENSMUST00000093716 116 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Ighv1-13-201ENSMUST00000095364 294 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Olfr1039-201ENSMUST00000099910 960 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Otc-201ENSMUST00000049910 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Olfr1362-201ENSMUST00000051874 3045 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Mug-ps1-202ENSMUST00000189975 3293 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Nup93-207ENSMUST00000212824 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Cops2-202ENSMUST00000110462 1853 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Gm9408-201ENSMUST00000197375 1505 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Gm20547-202ENSMUST00000146299 3893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Gm29670-201ENSMUST00000190228 2491 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Gm44676-201ENSMUST00000208520 3055 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Gm14912-201ENSMUST00000120166 1773 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 CT009765.1-201ENSMUST00000219088 2705 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Gria4-204ENSMUST00000212533 5207 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Lilrb4a-203ENSMUST00000219696 1441 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Kank4os-201ENSMUST00000133455 2251 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Pls3-204ENSMUST00000114059 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Olfr1426-202ENSMUST00000208703 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Gm43062-201ENSMUST00000196302 1319 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Gm45657-201ENSMUST00000211318 1349 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 CT009604.1-201ENSMUST00000223900 1328 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Serpinb9-201ENSMUST00000006391 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Gm5286-201ENSMUST00000159524 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Adam30-201ENSMUST00000050342 3510 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 5430427O19Rik-201ENSMUST00000113976 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Crnkl1-201ENSMUST00000001818 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Il7-201ENSMUST00000168269 2307 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Trim12a-203ENSMUST00000106839 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 C130083A15Rik-201ENSMUST00000205707 1460 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Gm45174-201ENSMUST00000208884 3065 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Gm30329-201ENSMUST00000211572 3077 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Nlrp1c-ps-201ENSMUST00000171546 3457 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Frmd7-201ENSMUST00000060650 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Ube2n-201ENSMUST00000099329 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Ccdc191-203ENSMUST00000132859 3779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Rdh11-203ENSMUST00000161204 3262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Fap-209ENSMUST00000174448 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 4833423E24Rik-201ENSMUST00000099923 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Gm12703-201ENSMUST00000145411 2039 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Tial1-211ENSMUST00000165023 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Vmn1r37-205ENSMUST00000227923 1773 ntAPPRIS P2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Spic-201ENSMUST00000004473 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 4932435O22Rik-202ENSMUST00000148405 3406 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Gm40893-201ENSMUST00000220507 1508 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 AC135119.1-204ENSMUST00000228036 2663 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Olfr1293-ps-201ENSMUST00000102551 888 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 S100a1-202ENSMUST00000107340 577 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Cav1-205ENSMUST00000115456 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Gm11945-201ENSMUST00000120551 476 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Gm14369-201ENSMUST00000121355 285 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Ccdc142os-201ENSMUST00000125657 891 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Gm14401-204ENSMUST00000134614 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 1700011I03Rik-204ENSMUST00000135806 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Gm13175-201ENSMUST00000139479 466 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Gm15543-201ENSMUST00000141307 361 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Ttc39aos1-201ENSMUST00000150239 796 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 4930445N08Rik-201ENSMUST00000156925 313 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Gm23441-201ENSMUST00000157268 127 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Gm6434-201ENSMUST00000163316 372 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Gm3611-201ENSMUST00000173687 877 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 1700066J03Rik-201ENSMUST00000181908 444 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Gm27373-201ENSMUST00000184017 184 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Gm27185-201ENSMUST00000184296 247 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Gm27204-201ENSMUST00000184673 527 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Gm27207-201ENSMUST00000184995 878 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Vmn1r189-201ENSMUST00000186062 1137 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 B230112G18Rik-201ENSMUST00000192979 851 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Gm37724-201ENSMUST00000195240 1221 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Gm43037-201ENSMUST00000196808 250 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Gm34144-201ENSMUST00000197039 259 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 4930580E04Rik-201ENSMUST00000197377 690 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Gm43243-201ENSMUST00000199964 278 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Gm19590-201ENSMUST00000201551 1195 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Vmn1r-ps7-201ENSMUST00000202355 928 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Mitf-208ENSMUST00000203938 1074 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Gm44112-201ENSMUST00000204787 372 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Gm30646-201ENSMUST00000207662 180 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Gm45693-201ENSMUST00000211391 1157 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Gm18860-201ENSMUST00000212029 764 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 4930521O17Rik-201ENSMUST00000219339 491 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Atp8b3-202ENSMUST00000219648 524 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Gm19095-201ENSMUST00000220533 730 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 AC102435.1-205ENSMUST00000221064 1097 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 AC134414.1-201ENSMUST00000228499 1221 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Olfr905-201ENSMUST00000051111 937 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 1700011I03Rik-201ENSMUST00000079738 1013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Vmn1r196-201ENSMUST00000091735 906 ntAPPRIS P2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Gm10271-201ENSMUST00000092165 156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 A330023F24Rik-202ENSMUST00000181273 4217 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms