Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Itih2-201ENSMUST00000042290 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Gm37525-201ENSMUST00000193499 2871 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Sulf1-202ENSMUST00000177608 5598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Asb4-201ENSMUST00000043294 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Ap4e1-201ENSMUST00000002063 4600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Gm26530-201ENSMUST00000180969 3941 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Olfr738-202ENSMUST00000214320 2114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 AL450321.1-201ENSMUST00000220600 3550 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Ikzf3-201ENSMUST00000103141 3658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 5033425B01Rik-201ENSMUST00000213948 1303 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 D030034A15Rik-201ENSMUST00000215835 3953 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Gm9049-201ENSMUST00000178998 2409 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Gm9030-201ENSMUST00000218405 2410 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Gm32717-201ENSMUST00000219147 2409 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Gm9029-201ENSMUST00000219232 2410 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Gm32802-201ENSMUST00000219565 2409 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Gm9045-201ENSMUST00000219760 2409 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Dapp1-203ENSMUST00000136613 2950 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Pou2f1-205ENSMUST00000111427 13050 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Krt222-202ENSMUST00000103132 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Gm29194-201ENSMUST00000189250 2167 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Abcd2-201ENSMUST00000069511 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Foxp2-201ENSMUST00000031545 5647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Gm43557-201ENSMUST00000197100 2370 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Trappc8-201ENSMUST00000025177 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Tdrkh-205ENSMUST00000197495 2476 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Gm37474-201ENSMUST00000194812 1814 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Stc1-201ENSMUST00000014957 4197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Olfr3-202ENSMUST00000213988 2018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Cfap221-202ENSMUST00000174370 2871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 RMST_1.1-210ENSMUST00000219606 2891 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Gm21284-201ENSMUST00000205532 3736 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Ighv14-4-201ENSMUST00000103475 333 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Fam107b-204ENSMUST00000115054 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Mageb16-ps1-201ENSMUST00000117991 1127 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Gm4732-201ENSMUST00000118778 473 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Gm4911-201ENSMUST00000119388 945 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Vmn1r-ps103-201ENSMUST00000120171 893 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Gm7113-201ENSMUST00000120477 958 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Gm13465-201ENSMUST00000129687 979 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Rpl36-ps2-201ENSMUST00000136893 311 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Mup8-202ENSMUST00000163931 986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Gm21304-201ENSMUST00000180568 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Gm21293-202ENSMUST00000180664 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Gm4340-202ENSMUST00000181036 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Gm21312-203ENSMUST00000181239 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Gm4340-203ENSMUST00000181615 1258 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Gm20765-203ENSMUST00000181707 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Mir8094-201ENSMUST00000183361 117 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Gm29566-201ENSMUST00000190627 457 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Gm19002-201ENSMUST00000192649 1012 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Gm37068-201ENSMUST00000195168 640 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 4930572K03Rik-201ENSMUST00000196713 931 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 4930568A13Rik-201ENSMUST00000199961 1061 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Mrln-201ENSMUST00000020090 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Gm43926-201ENSMUST00000203978 430 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Klra13-ps-203ENSMUST00000204367 850 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Gm18484-201ENSMUST00000204389 991 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Gm44213-201ENSMUST00000204977 703 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Klk1b2-ps-201ENSMUST00000206099 786 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Gm39158-201ENSMUST00000210178 856 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Olfr342-202ENSMUST00000216275 3818 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Gm34654-201ENSMUST00000217012 535 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 AC127224.1-201ENSMUST00000218094 453 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 AC105167.1-201ENSMUST00000219966 253 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 AC102435.1-205ENSMUST00000221064 1097 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 AC159188.3-201ENSMUST00000224199 880 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 AL844586.1-201ENSMUST00000224297 1042 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 AC157650.2-201ENSMUST00000224666 328 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 AC154747.4-201ENSMUST00000224802 903 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 AC154515.3-201ENSMUST00000225081 1159 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Olfr691-201ENSMUST00000057528 969 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Cyp4a10-201ENSMUST00000058785 2109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 5031410I06Rik-201ENSMUST00000063524 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Olfr1322-201ENSMUST00000070304 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Olfr1076-201ENSMUST00000076263 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Rpl31-ps20-201ENSMUST00000080982 378 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Olfr224-201ENSMUST00000081102 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Gm7347-201ENSMUST00000095004 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Timp1-201ENSMUST00000009530 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Cdh6-201ENSMUST00000036439 8167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Sh2d4b-201ENSMUST00000070328 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Gimap9-201ENSMUST00000054050 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Vps8-207ENSMUST00000122235 2521 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Gm37518-201ENSMUST00000194930 2603 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Kmo-202ENSMUST00000097458 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Olfr43-204ENSMUST00000215550 1854 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Vmn2r11-201ENSMUST00000164875 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Slc26a5-202ENSMUST00000115176 2768 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Skil-204ENSMUST00000118470 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 AC122828.2-201ENSMUST00000222511 2880 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Gm45297-201ENSMUST00000209893 3483 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Cfap61-206ENSMUST00000133433 3998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 AC125487.2-201ENSMUST00000219810 1300 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Akr1c20-202ENSMUST00000080361 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Gm29461-201ENSMUST00000189232 4176 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Gm10601-201ENSMUST00000120436 1422 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 AC162301.1-201ENSMUST00000228785 1542 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Ptprd-213ENSMUST00000173376 4793 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Vmn1r30-202ENSMUST00000226334 1946 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
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