Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP7

Gm3238, MCG61407, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3238W4VSP7 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3238W4VSP7 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3238W4VSP7 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3238W4VSP7 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3238W4VSP7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3238W4VSP7 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3238W4VSP7 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3238W4VSP7 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3238W4VSP7 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3238W4VSP7 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3238W4VSP7 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3238W4VSP7 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3238W4VSP7 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3238W4VSP7 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3238W4VSP7 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3238W4VSP7 Zcwpw2-202ENSMUST00000187329 1469 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3238W4VSP7 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3238W4VSP7 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3238W4VSP7 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3238W4VSP7 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3238W4VSP7 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3238W4VSP7 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3238W4VSP7 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3238W4VSP7 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3238W4VSP7 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3238W4VSP7 Gm37102-201ENSMUST00000195740 1105 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3238W4VSP7 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3238W4VSP7 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3238W4VSP7 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3238W4VSP7 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3238W4VSP7 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3238W4VSP7 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3238W4VSP7 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3238W4VSP7 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3238W4VSP7 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3238W4VSP7 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3238W4VSP7 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3238W4VSP7 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3238W4VSP7 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3238W4VSP7 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3238W4VSP7 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3238W4VSP7 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3238W4VSP7 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3238W4VSP7 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3238W4VSP7 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3238W4VSP7 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3238W4VSP7 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3238W4VSP7 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3238W4VSP7 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3238W4VSP7 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3238W4VSP7 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3238W4VSP7 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3238W4VSP7 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3238W4VSP7 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3238W4VSP7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3238W4VSP7 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3238W4VSP7 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3238W4VSP7 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3238W4VSP7 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3238W4VSP7 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3238W4VSP7 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3238W4VSP7 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3238W4VSP7 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3238W4VSP7 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3238W4VSP7 4933401J01Rik-201ENSMUST00000193812 1070 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3238W4VSP7 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3238W4VSP7 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3238W4VSP7 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3238W4VSP7 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3238W4VSP7 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3238W4VSP7 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3238W4VSP7 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3238W4VSP7 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3238W4VSP7 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3238W4VSP7 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3238W4VSP7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3238W4VSP7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3238W4VSP7 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3238W4VSP7 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3238W4VSP7 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3238W4VSP7 Gm25509-201ENSMUST00000116985 106 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3238W4VSP7 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3238W4VSP7 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3238W4VSP7 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3238W4VSP7 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3238W4VSP7 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3238W4VSP7 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3238W4VSP7 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3238W4VSP7 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3238W4VSP7 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3238W4VSP7 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3238W4VSP7 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3238W4VSP7 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3238W4VSP7 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3238W4VSP7 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3238W4VSP7 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3238W4VSP7 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3238W4VSP7 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3238W4VSP7 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3238W4VSP7 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
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