Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3550W4VSN7 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3550W4VSN7 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3550W4VSN7 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3550W4VSN7 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3550W4VSN7 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3550W4VSN7 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3550W4VSN7 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3550W4VSN7 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3550W4VSN7 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3550W4VSN7 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3550W4VSN7 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3550W4VSN7 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3550W4VSN7 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3550W4VSN7 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3550W4VSN7 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3550W4VSN7 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3550W4VSN7 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3550W4VSN7 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3550W4VSN7 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3550W4VSN7 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3550W4VSN7 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3550W4VSN7 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3550W4VSN7 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3550W4VSN7 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3550W4VSN7 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3550W4VSN7 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3550W4VSN7 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3550W4VSN7 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3550W4VSN7 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3550W4VSN7 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3550W4VSN7 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3550W4VSN7 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3550W4VSN7 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3550W4VSN7 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3550W4VSN7 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3550W4VSN7 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3550W4VSN7 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3550W4VSN7 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3550W4VSN7 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3550W4VSN7 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3550W4VSN7 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3550W4VSN7 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3550W4VSN7 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3550W4VSN7 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3550W4VSN7 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3550W4VSN7 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3550W4VSN7 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3550W4VSN7 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3550W4VSN7 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3550W4VSN7 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3550W4VSN7 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3550W4VSN7 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3550W4VSN7 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3550W4VSN7 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3550W4VSN7 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3550W4VSN7 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3550W4VSN7 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3550W4VSN7 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3550W4VSN7 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3550W4VSN7 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3550W4VSN7 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3550W4VSN7 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3550W4VSN7 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3550W4VSN7 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3550W4VSN7 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3550W4VSN7 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3550W4VSN7 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3550W4VSN7 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3550W4VSN7 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3550W4VSN7 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm3550W4VSN7 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm3550W4VSN7 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm3550W4VSN7 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm3550W4VSN7 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm3550W4VSN7 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3550W4VSN7 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3550W4VSN7 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3550W4VSN7 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3550W4VSN7 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3550W4VSN7 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3550W4VSN7 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3550W4VSN7 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3550W4VSN7 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3550W4VSN7 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3550W4VSN7 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3550W4VSN7 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3550W4VSN7 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3550W4VSN7 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3550W4VSN7 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3550W4VSN7 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3550W4VSN7 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3550W4VSN7 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3550W4VSN7 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3550W4VSN7 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3550W4VSN7 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3550W4VSN7 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3550W4VSN7 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3550W4VSN7 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3550W4VSN7 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms